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外泌體miRNA可通過(guò)細(xì)胞衰老途徑參與結(jié)腸炎發(fā)生,?

閱讀:705      發(fā)布時(shí)間:2023-8-30
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外泌體是直徑為30-200nm的小囊泡,,幾乎來(lái)自所有細(xì)胞[1],。外泌體中包裹了RNA、DNA,、蛋白質(zhì)和脂質(zhì),,通過(guò)在不同細(xì)胞之間的傳遞,介導(dǎo)多種生理和病理過(guò)程,。作為小的非編碼單鏈RNA,,microRNAs (miRNAs)通過(guò)轉(zhuǎn)錄后抑制基因表達(dá),顯著調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)和代謝,,可以被包裝在外泌體中以防止RNase的消化并進(jìn)入循環(huán),,可作為潛在的疾病生物標(biāo)志物[2]


圖1 外泌體miRNA分泌機(jī)制

 

2023年8月7日,,武漢大學(xué)人民醫(yī)院董衛(wèi)國(guó)教授團(tuán)隊(duì)在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Gut Microbes在線發(fā)表了題為“Exosomal-miR-129-2-3p derived from Fusobacterium nucleatum-infected intestinalepithelial cells promotes experimental colitisthrough regulating TIMELESS-mediated cellular senescence pathway"研究性論文(IF 12.2),。該研究揭示了具核梭桿菌(Fusobacterium nucleatum,F(xiàn)n)通過(guò)外泌體加重潰瘍性結(jié)腸炎(UC)的分子機(jī)制,,為UC的診斷和靶向治療提供了新的理論支持,。


圖2 文章信息

 

核梭桿菌(Fn)感染可加劇潰瘍性結(jié)腸炎(UC)。然而,,F(xiàn)n感染的腸上皮細(xì)胞(IEC)衍生外泌體(Fn-Exo)與UC進(jìn)展之間的聯(lián)系尚未被研究,。該研究通過(guò)miRNA測(cè)序鑒定了Fn-Exo和未感染的IEC衍生外泌體(Con-Exo)中差異表達(dá)的miRNA。然后,,在體外和體內(nèi)確定Fn-Exo在UC發(fā)育中的生物學(xué)作用和機(jī)制,。作者發(fā)現(xiàn)外泌體將miR-129-2-3p從Fn感染的IECs傳遞到未感染的IECs,加劇上皮屏障功能障礙和實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎,。機(jī)制上,,F(xiàn)n-Exo通過(guò)miR-129-2-3p/TIMELESS軸誘導(dǎo)DNA損傷,隨后激活A(yù)TM/ATR/p53通路,,最終促進(jìn)細(xì)胞衰老和結(jié)腸炎癥,。總之,,Exo-miR-129-2-3p/TIMELESS/ATM/ATR/p53通路加重了細(xì)胞衰老,、屏障損傷和實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎。目前的研究揭示了Fn感染性UC進(jìn)展中的一個(gè)前所未知的調(diào)控途徑,。此外,,血清中的外泌體-miR-129-2-3p可能作為UC和Fn-high-UC的新型潛在診斷生物標(biāo)志物[3]


圖3 Fn-Exo在結(jié)腸炎中的作用和機(jī)制示意圖

 

一,、愛(ài)必信擁有全套的外泌體&miRNA解決方案



圖4 愛(ài)必信外泌體&miRNA解決方案

 

1,、miRNA提取

一般來(lái)說(shuō),傳統(tǒng)的TRIzol及其它常用的RNA提取試劑盒提取的是較大分子的RNA,,包括rRNA和mRNA,,但對(duì)miRNA的提取效果不佳,。這可能是因?yàn)槿绱诵〉暮怂岱肿硬灰妆淮碱惓恋怼⒁膊灰妆缓怂峒兓ず痛胖槲讲蹲降脑?。因而,,要較好地提取miRNA,必須采取一些新的思路和方法,。根據(jù)目前的研究結(jié)果顯示,,miRNA富集法應(yīng)該是一種不錯(cuò)的選擇。其原理為,,先使用富集試劑將含量較低,、分子量較小的miRNA聚集在一起,再使用核酸純化柱進(jìn)行提取,。顯然,,miRNA聚集后更加有利于miRNA的吸附和捕捉,從而得以有效地提升miRNA的提取得率,。

愛(ài)必信研發(fā)了可高效提取各樣本中miRNA的專門(mén)試劑盒,與部分同類試劑盒相比,,顯著提升了miRNA的提取效率,。

1)采用特殊的消化技術(shù),去除較大分子的DNA和rRNA, 使miRNA更容易分離提取
2)采用miRNA富集技術(shù),,使miRNA聚集起來(lái),,使之更容易被核酸純化膜吸附純化,大幅提升miRNA的提取效率,;
3)操作簡(jiǎn)便,,只需30多分鐘即可獲得理想的miRNA提取結(jié)果。

 


貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

abs60262

細(xì)胞miRNA提取試劑盒

30T/60T

abs60260

血液miRNA提取試劑盒

30T/60T

abs60261

組織miRNA提取試劑盒

30T/60T

abs60263

外泌體RNA提取試劑盒

50T/100T

abs60264

血漿血清miRNA提取試劑盒

50T/100T









2,、miRNA逆轉(zhuǎn)錄&qPCR

miRNA逆轉(zhuǎn)錄的難點(diǎn)在于其分子較小,,逆轉(zhuǎn)錄引物無(wú)法理想地與miRNA結(jié)合。顯然,,進(jìn)行miRNA逆轉(zhuǎn)錄時(shí),,需要對(duì)miRNA分子進(jìn)行加長(zhǎng)改造。有兩種方法可達(dá)到這一目的:一種采用Poly(A)加尾法,,另一種采用莖環(huán)法,。對(duì)于加尾法逆轉(zhuǎn)錄來(lái)說(shuō),miRNA能否有效加長(zhǎng)的關(guān)鍵在于Poly(A)聚合酶的活性,。Poly(A)聚合酶活性高,,就可以在短時(shí)間內(nèi)給miRNA加上較長(zhǎng)的Poly(A)尾巴,使miRNA分子能夠高效地結(jié)合Oligo(dT)引物,。另外Oligo(dT)引物的設(shè)計(jì)也至關(guān)重要,,如果是簡(jiǎn)單的Oligo(dT),,引物與miRNA的結(jié)合往往會(huì)發(fā)生錯(cuò)位,導(dǎo)致逆轉(zhuǎn)錄效率降低,。高效的Oligo(dT)引物應(yīng)該加入錨定堿基,,從而使二者的結(jié)合更加特異高效。莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄成功的關(guān)鍵在于莖環(huán)的設(shè)計(jì),,該莖環(huán)應(yīng)能高效地與miRNA 3’端特異,、高效地結(jié)合,同時(shí)還要能夠順利地折疊和打開(kāi),。

miRNA qPCR相對(duì)較為簡(jiǎn)單,,主要有染料法和探針?lè)ā煞N方法相比,,探針?lè)ㄌ禺愋愿鼜?qiáng),。不過(guò)如果miRNA能夠高效提取,并且miRNA qPCR逆轉(zhuǎn)錄成功,,無(wú)論miRNA qPCR選擇何種方法,,一般都會(huì)有較為理想的結(jié)果。

二,、加尾法逆轉(zhuǎn)錄VS頸環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄如何選擇,?

選擇何種miRNA逆轉(zhuǎn)錄以及定量方法,主要由實(shí)驗(yàn)來(lái)決定,。對(duì)于從事較多miRNA(3個(gè)以上)研究的研究者來(lái)說(shuō),,選用加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒較好,因?yàn)橐淮文孓D(zhuǎn)錄后可以進(jìn)行多個(gè)miRNA的qPCR擴(kuò)增,,省去了很多的實(shí)驗(yàn)操作,。但對(duì)于只檢測(cè)1-2個(gè)miRNA的研究者來(lái)說(shuō),選用莖環(huán)法比較合適,,因?yàn)榍o環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄結(jié)果更加特異,。


貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

加尾染料法

abs60265

miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒

20T/40T

abs60266

miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(血漿)

25T/50T

abs60271

miRNA加尾染料法熒光定量PCR試劑盒

200T/300T/400T

探針?lè)?/span>

abs60267

miRNA探針?lè)孓D(zhuǎn)錄試劑盒

20T/40T

abs60268

miRNA探針?lè)孓D(zhuǎn)錄試劑盒(血漿)

20T/40T

abs60272

miRNA探針?lè)晒舛縋CR試劑

100T/200T/400T

莖環(huán)染料法

abs60269

miRNA莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒

25T/50T

abs60270

miRNA莖環(huán)染料法熒光定量PCR試劑盒

200T/400T






需要特別注意的是,miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和miRNA qPCR試劑盒一般是配套使用的,,研究者最好買我公司配套的miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑和qPCR試劑,,否則,有可能出現(xiàn)實(shí)驗(yàn)失敗,。其主要原因是逆轉(zhuǎn)錄引物上往往設(shè)計(jì)有qPCR引物結(jié)合序列,,如果買不同廠家的試劑,qPCR引物可能無(wú)法特異地結(jié)合逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,。另外,,對(duì)于初學(xué)者而言,miRNA上游引物的設(shè)計(jì)有一定難度,,往往既花了時(shí)間,,又得不到好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,,建議最好購(gòu)買能夠贈(zèng)送上游引物的逆轉(zhuǎn)錄試劑生產(chǎn)廠家。

1)凡購(gòu)買miRNA逆轉(zhuǎn)錄和定量試劑盒一套,,即可免費(fèi)獲得逆轉(zhuǎn)錄&qpCR引物,;
2)凡購(gòu)買miRNA逆轉(zhuǎn)錄和定量試劑盒一套支持miRNA引物定制合成服務(wù)。

外泌體相關(guān)產(chǎn)品推薦


貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

abs993

無(wú)外泌體胎牛血清

50ml

abs9430

外泌體專用無(wú)血清培養(yǎng)基

500ml

abs9587

外泌體專用裂解液

20ml

abs60364

外泌體DNA提取試劑盒

50T/100T

abs60263

外泌體RNA提取試劑盒

50T/100T

abs50040

細(xì)胞上清外泌體提取試劑盒

20T

abs50039

血漿血清外泌體提取試劑盒

20T






參考文獻(xiàn)


[1] Pegtel DM, Gould SJ. Exosomes. Annu Rev Biochem. 2019;88:487–514. doi: 10.1146/annurev-biochem-013118-111902.

[2] Jeppesen DK, Fenix AM, Franklin JL, Higginbotham JN, Zhang Q, Zimmerman LJ, Liebler DC, Ping J, Liu Q, Evans R, et al. Reassessment of exosome composition. Cell. 2019;177(2):428–445.e18. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.029.

[3] Wei S, Wu X, Chen M, Xiang Z, Li X, Zhang J, Dong W. Exosomal-miR-129-2-3p derived from Fusobacterium nucleatum-infected intestinal epithelial cells promotes experimental colitis through regulating TIMELESS-mediated cellular senescence pathway. Gut Microbes. 2023 Jan-Dec;15(1):2240035. doi: 10.1080/19490976.2023.2240035. PMID: 37550944; PMCID: PMC10411316.

 

好消息,!Absin文獻(xiàn)獎(jiǎng)勵(lì)重磅升級(jí),!


 

Absin特色產(chǎn)品線:

WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker,、預(yù)制膠,;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆,;IP/CoIP試劑盒,;激動(dòng)劑/抑制劑;血清,、BSA,、蛋白酶K、CTB,、TTX,、CEE;凋亡試劑盒,;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒,;重組蛋白,;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體,、對(duì)照抗體,;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...

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