隨著分子生物技術(shù)在生物學(xué),、醫(yī)學(xué)等方面的廣泛應(yīng)用,RNA提取已成為研究基因表達(dá),、克隆目的基因等的一項基本試驗技術(shù),。高質(zhì)量RNA的提取,是后續(xù)RT-PCR,、qPCR,、Northern blot、cDNA文庫構(gòu)建等正常進(jìn)行的必要前提,。Trizol法是一種常見的提取總RNA的方法,,在RNA得率及試劑成本方面具有一定的優(yōu)勢。
圖1 Trizol法提取RNA流程
Trizol是一種較為流行的總RNA抽提試劑,,可以直接從細(xì)胞或組織中提取總RNA,。其含有苯酚、異硫氰酸胍等物質(zhì),,能迅速破碎細(xì)胞并抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶,,因此對于純化RNA及標(biāo)準(zhǔn)化RNA的生產(chǎn)來說使用價值相對比較高。
圖2
? Trizol是動植物細(xì)胞,、組織或者細(xì)菌的總RNA抽提試劑,;
? 主要含有苯酚,、異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細(xì)胞并抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶,。苯酚主要用于裂解細(xì)胞,、變性蛋白,同時使部分RNase失活,,保護(hù)RNA,;異硫氰酸胍可降解細(xì)胞、溶解蛋白質(zhì),,使蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)消失,、使核蛋白與核酸分離,進(jìn)而使核內(nèi)的RNA被釋放出來,,并且抑制RNase活性,;
? 抽提所得RNA無DNA和蛋白污染。一般所得RNA溶于DEPC水后的A260/280值為8-2.0,;
? 裂解細(xì)胞或和組織共勻漿時,,Trizol可以保持樣品中RNA的完整性,即可以有效抑制RNA的降解,;
? 每一百萬細(xì)胞用Trizol抽提可得5-15μg RNA,;每毫克組織用Trizol抽提可得1-10μg RNA,產(chǎn)量因細(xì)胞和組織不同而異,;
?Trizol抽提所得RNA可直接用于Northern,,點雜交,純化mRNA,,體外翻譯,,RNase protectionassay,cDNA克隆,,以及RT-PCR,;也可以用于基因表達(dá)芯片分析、高通量測序等對RNA質(zhì)量要求較高的情況,。
氯仿是分子量比較大的有機溶劑,,在提取RNA時,氯仿可以有效的使有機相和無機相迅速分離,。加入氯仿,,離心后,樣品即分成水樣層(RNA存在于水樣層),、中間層(DNA和蛋白質(zhì)存在于中間層)和有機層,。
細(xì)化它的主要作用點:
(1)作為有機溶劑變性蛋白,使其沉淀并通過離心除去,,同時也通過變性作用抑制RNase活性,;
(2)RNA提取試劑中通常含有苯酚(Trizol主要成分就是苯酚),,苯酚微溶于水,抽提烷之后水相里有痕量的酚,,如果不除去會損傷核酸,,需要通過氯仿把水相里參與的苯酚抽提掉;
(3)作為溶劑抽提樣品中的一些脂溶性雜質(zhì)(比如油脂,、脂溶性色素等),,起到一定除雜作用。
異丙醇的作用主要是沉淀RNA,。RNA存在于水樣層中,,收集水樣層后可以通過異丙醇沉淀RNA來還原。離心前沉淀不可見,,離心棄上清后,可見膠狀的RNA沉淀,。
75%乙醇主要由乙醇和DEPC水配置,,主要用來洗滌粘附在RNA沉淀上的氯仿跟異丙醇。
DEPC處理水是經(jīng)DEPC(即diethyl pyrocarbonate,,焦碳酸二乙)處理過并經(jīng)高溫高壓滅菌的超純水(一級水),,是一種無色液體。經(jīng)檢測不含雜質(zhì)RNA,、DNA,、核酸酶和蛋白質(zhì)。本產(chǎn)品可以用于RNA沉淀的溶解,,含有RNA的各種反應(yīng)體系,,以及其它要求無RNase、DNase和proteinase的反應(yīng)體系,。
分類 | 貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
離心管 | abs7119 | 1.5ml離心管(無菌無酶) | 500支/盒,,10盒/箱 (1袋/盒) |
abs7118 | 0.5ml離心管(無菌無酶) | 1500支/袋,10袋/箱 | |
吸頭 | abs7071 | 10μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,,100盒/箱 |
abs7074 | 200μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,,100盒/箱 | |
abs7077 | 1000μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7176 | 20μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,,100盒/箱 | |
abs7072 | 10μL吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,,100盒/箱 | |
abs7073 | 10μL吸頭(袋裝 無酶) | 1000支/袋,10袋/箱 | |
abs7075 | 200μL吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,,100盒/箱 | |
abs7076 | 200μL吸頭(袋裝 無酶) | 1000支/袋,,20袋/箱 | |
abs7078 | 1000μL加長吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7079 | 1000μL吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,,50盒/箱 | |
abs7080 | 1000μL吸頭(袋裝 無酶) | 500支/袋,,10袋/箱 | |
abs7081 | 1000μL加長吸頭(袋裝 無酶) | 500支/袋,,10袋/箱 |
一、細(xì)胞裂解
1,、組織樣本:
Trizol用量:每50-100mg 組織加1 ml Trizol,,樣品體積不應(yīng)超過Trizol體積的10%。
(1)將動物或植物組織切成小塊,,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理,;
(2)將研磨好的組織粉末快速轉(zhuǎn)入裝有1ml Trizol的2 ml離心管中,在渦旋振蕩器上迅速振蕩混勻,,置于冰上,,待所有的樣品研磨完;
(3)裂解產(chǎn)物應(yīng)呈澄清的透明粘稠液體,。對于富含蛋白,、脂肪或多糖物質(zhì)的組織樣品如肌肉、脂肪組織和植物結(jié)節(jié)部位等,,勻漿后仍會存留有不溶物質(zhì),,可于4℃ 12,000 x g 離心10min,然后吸取上清至一新的離心管中,。
2,、細(xì)胞樣本:
(1)貼壁細(xì)胞:吸盡培養(yǎng)液,每10cm2培養(yǎng)面積(6孔板單孔或35 mm平皿)加入1ml Trizol,,用加樣器吹打數(shù)次,,以確保細(xì)胞裂解,然后轉(zhuǎn)移至離心管中,。注:Trizol的使用量應(yīng)由培養(yǎng)皿表面積決定,,而非由細(xì)胞數(shù)目決定。Trizol量不足可能導(dǎo)致提取的RNA中有DNA污染,;
(2)懸浮細(xì)胞:離心收集細(xì)胞,,吸盡液體,每 5-10×106動植物或酵母細(xì)胞,,或每 1×107細(xì)菌細(xì)胞加入1ml Trizol,,用加樣器吹打,使其裂解,,然后轉(zhuǎn)移至離心管中,。
注:添加Trizol前切勿洗滌細(xì)胞 ,以免RNA降解,。必要時可以用勻漿器來裂解某些細(xì)菌或者酵母細(xì)胞,。
二、液相分離
(1)裂解產(chǎn)物于室溫放置5min,,使核酸-蛋白復(fù)合物分離,;(注:此時樣品可在-80℃長期保存,。)
(2)每1ml Trizol加入0.2ml氯仿,蓋緊管蓋,,劇烈振蕩15s,,室溫放置2-3min;
(3)4℃ 12,000 x g離心15min,,樣品會分成三層:桔黃色的下層有機相,,中間層和無色的上層水相;
(4)吸取含總RNA的上層水相至一新的離心管中,,吸取水相的體積為所用Trizol試劑的60%,。
三、RNA回收
(1)按照每1ml Trizol的最初使用量加入0.5ml異丙醇,,顛倒數(shù)次混勻,,室溫放置10min;
(2)4℃ 12,000 x g 離心10min,,棄除上清,,可見膠狀的RNA沉淀;
(3)按照每1ml Trizol的最初使用量加入1ml 75%乙醇,,顛倒數(shù)次混勻,洗滌沉淀,;
(4)4℃ 12,000 x g離心5min,,棄除上清;
(5)室溫倒置5-10min晾干或真空抽干(不要使用真空干燥離心機,,以免RNA過干,,難以溶解);
(6)加入適量(如25ul)DEPC-ddH2O或TE緩沖液,,用加樣器吹打數(shù)次溶解RNA,;
(7)通過RNA電泳以及紫外分光光度計檢測,確定RNA的濃度,、純度和完整性,;
(8)所得的RNA應(yīng)立即使用或適量分裝后-80℃保存,避免反復(fù)凍融,。
除以上介紹的單品Trizol(abs60154)外,,還有Trizol(總RNA抽提試劑盒)(abs9331)包含有RNA提取全流程的試劑。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 包含試劑名稱 | 體積 |
abs9331 | Trizol(總RNA抽提試劑盒) | 1Kit | Trizol | 100ml |
分相試劑BCP | 10ml | |||
異丙醇 | 50ml | |||
75%乙醇 | 100ml | |||
DEPC水 | 10m |
參考文獻(xiàn)
[1]袁琳, 代亞坤, 高炳淼. 改進(jìn) TRIzol 法提取不同發(fā)育時期??目俁NA[J]. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué), 2020, 48(4): 96.
[2]Eldh M, L?tvall J, Malmh?ll C, et al. Importance of RNA isolation methods for analysis of exosomal RNA: evaluation of different methods[J]. Molecular immunology, 2012, 50(4): 278-286.
[3]王華, 李華. 保存動物組織內(nèi) RNA 的方法改進(jìn)[J]. 生物技術(shù)通報, 2010 (6): 152-155.
Absin特色產(chǎn)品線:
WB相關(guān):ECL發(fā)光液,、預(yù)染marker、預(yù)制膠,;IHC相關(guān):二抗試劑盒,、組化筆,;IP/CoIP試劑盒;激動劑/抑制劑,;血清,、BSA、蛋白酶K,、CTB,、TTX、CEE,;凋亡試劑盒,;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒,;重組蛋白,;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體,、對照抗體,;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...
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