mRNA的5’端的帽子結構可以提高其結構穩(wěn)定性,、增強翻譯效率以及降低mRNA在細胞中的免疫原性【1】,。作為mRNA的重要組成部分,帽子結構可以稱得上是mRNA結構的保護傘,。那么,,接下來我們就來學習一下帽子結構。
帽子結構簡介
帽子結構的化學本質是mRNA轉錄過程中發(fā)生修飾所形成的位于mRNA 5'端的一個特殊結構,,即m7GPPPN結構,,又稱甲基鳥苷帽子。它是在RNA三磷酸酶,,鳥苷酰轉移酶,,mRNA(鳥嘌呤-N7)甲基轉移酶和mRNA(核苷-2’)甲基轉移酶共同催化作用下形成的。甲基化程度的不同可形成3種帽子:CAP 0型,、CAP 1型和CAP 2型(如圖1),。
圖1.不同位置甲基化形成的帽結構【2】
帽子結構是mRNA翻譯起始的必要結構,為核糖體識別mRNA提供了信號,,協助核糖體與mRNA結合,,使翻譯從AUG開始。同時帽子結構可增加mRNA的穩(wěn)定性,,保護mRNA免遭5’→3’核酸外切酶的攻擊,。除去天然帽結構,體外轉錄過程中也多用帽結構類似物提高mRNA結構穩(wěn)定性,,常見的有ARCA和Cap 1結構類似物等,。
加帽方式及對比
酶法加帽:使用加帽酶進行轉錄后加帽,最常使用的是牛痘病毒加帽酶(VCE),,該反應過程中加帽酶的異源二聚體會導致產量較低,,短期內難以放大,。特點:先轉錄后加帽,由于增加質控項目工序繁雜(如圖2),,加帽率*,,但各類酶成本較高。
共轉錄加帽:使用帽類似物進行共轉錄加帽,,目前常用的帽類似物有兩種ARCA(抗-反帽結構類似物)和Cap1帽類似物,。有研究表明Cap 1結構能夠增強mRNA的翻譯效率,從而提高mRNA在轉染和顯微注射實驗中的表達,。且隨著帽子結構的不斷優(yōu)化,,加帽率大幅提升,成本逐漸降低,,共轉錄加帽法越來越受各類學者青睞,。特點:一步法加帽,操作簡單(如圖2),,使用Cap 1結構帽類似物,,加帽率可達95%,,隨著帽結構優(yōu)化研究的深入,,成本逐漸降低【3】。
圖2. 兩種加帽方式對比
三代帽子類似物及其對比
第二代帽結構傳統(tǒng)帽類似物ARCA:Cap 0結構非天然加帽,,存在較強免疫原性,,加帽率80%左右,轉錄產量低約1.5mg/ml,,成本高,。
第三代帽結構Cap1帽類似物: Cap 1結構模仿天然加帽,免疫原性降低,,加帽率95%左右,,轉錄產量低約4mg/ml,成本約為ARCA帽類似物的三分之一,。
愛必信提供幾種類型CAP(AG/AU/GG)
Cap1帽類似物 | 類型 | 貨號 | 特點 |
Cap AG | abs60182 | 模仿天然加帽,、 降低免疫原性、 加帽率97-99.5% | |
Cap AU | abs60184 | ||
Cap GG | abs60183 |
帽結構5月上新
除以上帽結構,,5月初我們即將重磅推出新修飾Cap 1帽結構以及Cap 2帽結構類似物的相關產品,,敬請期待。
【參考文獻】:
Fabian M, Nils M, Andrea R. Synthetic mRNA capping[J]. Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2017, 13:2819-2832.
Chen, Yu & Guo, Deyin. (2016). Molecular mechanisms of coronavirus RNA capping and methylation. Virologica Sinica. 31. 10.1007/s12250-016-3726-4.
Henderson JM, Ujita A, Hill E, Yousif-Rosales S, Smith C, Ko N, McReynolds T, Cabral CR, Escamilla-Powers JR, Houston ME. Cap 1 Messenger RNA Synthesis with Co-transcriptional Clean Cap® Analog by In Vitro Transcription. Curr Protoc. 2021 Feb;1(2):e39. doi: 10.1002/cpz1.39. Erratum in: Curr Protoc. 2021 Dec;1(12):e336. PMID: 33524237.
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