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氣單胞菌通用PCR試劑盒分析反應(yīng)五要素:
參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物,、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,,PCR 產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,,只要知道任何一段模板DNA序列,, 就能按其設(shè)計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增,。設(shè)計引物應(yīng)遵循以下原則:
①引物長度: 15-30bp,,常用為20bp左右。
②引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,,特定條件下可擴增長至10kb的片段,。
③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶,。ATGC*隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列,。
④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,,否則會形成引物二聚體,,產(chǎn)生非特異的擴增條帶。
⑤引物3'端的堿基,,特別是末及倒數(shù)第二個堿基,,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗,。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點,, 被擴增的靶序列*有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處,。
⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性,。
引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,,以*引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,,且可增加引物之間形成二聚體的機會,。
組成及試劑配制:
1、酶標(biāo)板:一塊(96孔)
2,、 標(biāo)準(zhǔn)品(凍干品): 2瓶,,請臨用前15分鐘內(nèi)配制。每瓶以樣品稀釋液稀釋至0.5ml,,蓋好后室溫靜置大約10分鐘,,同時反復(fù)顛倒/搓動以助溶解,其濃度為200 U/L,,然后做系列倍比稀釋(注:不要直接在板中進(jìn)行倍比稀釋),,分別配制成200 U/L,100 U/L,,50 U/L,,25 U/L,12.5 U/L,,6.25 U/L,,3.12 U/L,樣品稀釋液直接作為空白孔 0 U/L,。如配制100 U/L標(biāo)準(zhǔn)品:取0.3ml (不要少于0.3ml )200 U/L的上述標(biāo)準(zhǔn)品加入含有0.3ml樣品稀釋液的Eppendorf管中,,混勻即可,其余濃度以此類推,。
3,、 樣品稀釋液:1×20ml。
4,、 檢測稀釋液A:1×10ml,。
5、 檢測稀釋液B:1×10ml,。
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