產(chǎn)品簡介
? 包括一個(gè)靈活的合成協(xié)議編輯器,,它允許操作員修改所包含的協(xié)議,,并將它們保存在一個(gè)新名稱下,或者從頭開始編寫協(xié)議,。協(xié)議編輯可以在Excel中完成,。對于不同的合成規(guī)模和序列長度,很容易編輯特殊協(xié)議,。比如,,可以給耦合緩慢的堿基對一個(gè)特別的延長的耦合時(shí)間。如果必要的話,,可以給所有單體額外的耦合反應(yīng)時(shí)間,。
? 軟件簡單易用。在計(jì)算機(jī)或平板的Excel表中
詳細(xì)介紹
Oligo高通量DNA合成儀用于合成結(jié)構(gòu)上類似DNA或RNA的寡核苷酸的自動化儀器,。一般應(yīng)用于固相合成法,,每次將一個(gè)核苷酸加到所接長的寡核苷酸鏈上,加入每一個(gè)核苷酸都利用相同的化學(xué)反應(yīng)與相應(yīng)的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用,。
Oligo高通量DNA合成儀特點(diǎn):
? 包括一個(gè)靈活的合成協(xié)議編輯器,,它允許操作員修改所包含的協(xié)議,并將它們保存在一個(gè)新名稱下,,或者從頭開始編寫協(xié)議,。協(xié)議編輯可以在Excel中完成。對于不同的合成規(guī)模和序列長度,,很容易編輯特殊協(xié)議,。比如,可以給耦合緩慢的堿基對一個(gè)特別的延長的耦合時(shí)間,。如果必要的話,,可以給所有單體額外的耦合反應(yīng)時(shí)間。
? 軟件簡單易用,。在計(jì)算機(jī)或平板的Excel表中創(chuàng)建運(yùn)行數(shù)據(jù)后,,可使用Wi-Fi等網(wǎng)絡(luò)連接或標(biāo)準(zhǔn)U盤傳輸?shù)絻x器上。實(shí)驗(yàn)運(yùn)行中,,可以從PC端收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)監(jiān)測實(shí)驗(yàn)結(jié)果,。
? 性能
OligoMaker X12可以在1小時(shí)內(nèi)平行合成12條20對的寡核苷酸。
OligoMaker 48可以在2小時(shí)內(nèi)平行合成多達(dá)48條20對的寡核苷酸,。
OligoMaker 96可以在3小時(shí)內(nèi)平行合成多達(dá)96條20對的寡核苷酸,。
OligoMaker 192可以在4小時(shí)內(nèi)平行合成多達(dá)192條20對的寡核苷酸。
? 可在IUPAC-IUB標(biāo)準(zhǔn)規(guī)則下合成10,、50,、200和1000nmol規(guī)模的核苷酸。
兩個(gè)反應(yīng)盤,,一個(gè)盤可以加載和合成核苷酸,,另一個(gè)盤準(zhǔn)備進(jìn)行凈化步驟。
OligoMaker 48可以升級為OligoMaker 96和OligoMaker 192,;
OligoMaker 96可以升級為OligoMaker 192,。
DNA的固相合成。即DNA3'端固定于基質(zhì)上,,然后沿3'向5'方向依此添加核苷酸直至合成所需的DNA片段,。不同于應(yīng)用DNA聚合酶的DNA合成。
合成過程
*個(gè)堿基的3‘末端固定在樹脂上,,下一個(gè)堿基的5’-OH用二對甲氧三苯甲基DMT保護(hù),,堿基上的氨基用苯甲酸保護(hù),然后對3‘-OH用氨基磷酸化合物進(jìn)行活化,。
1,。1個(gè)堿基的5’-OH和下個(gè)堿基的3‘-OH形成亞磷酸三酯,
2,。然后用碘氧化成磷酸三酯
3,。加入C2H6CL2除去第二個(gè)堿基5’-OH上的保護(hù)劑DMT
循環(huán)進(jìn)行加入下一個(gè)堿基
合成完畢后
亞磷酰胺寡核苷酸合成為例介紹該類儀器的一般操作步驟。亞磷酰胺DNA合成的試劑有:保護(hù)堿基的5/—DMT,,A,、G、C,、T亞磷酰胺單體,,四唑偶聯(lián)催化劑,乙酐,,N—甲基咪唑封閉試劑,,TCA脫保護(hù)溶液,12氧化混合物,,乙腈清洗溶劑,,氨水切除溶液。使用步驟如下:
1,、仔細(xì)檢查合成儀上所有試劑瓶中的試劑量,,必要時(shí)換掉試劑瓶,,特別注意乙腈的量,因?yàn)樵撊軇┯昧枯^大,。
2,、將標(biāo)記好的清潔的收集瓶裝在合成儀上。
3,、將要合成的DNA序列輸入合成儀,。
4、檢查選擇的合成步驟是否正確,。
5,、選擇結(jié)束方法:TritylOffAuto是儀器的原始狀態(tài),若打算以5,,—DMT基團(tuán)連接純化寡核苷酸,,將其轉(zhuǎn)變?yōu)門ritylOnAuto結(jié)束狀態(tài)。
6,、選擇結(jié)束方法,,一般為系統(tǒng)的原始狀態(tài)。
7,、在每個(gè)柱監(jiān)視器的Username下,,輸入你所希望的保存名字。
8,、以代碼代替相應(yīng)的DNA序列標(biāo)記每一個(gè)收集瓶,。
9、打印出每一個(gè)柱設(shè)置的詳細(xì)資料,。
10,、檢查打印出來的資料是否正確。
11,、運(yùn)行StartColumn步驟檢查每一個(gè)柱的位置,,確保合成儀上合成柱處于正確的位置。
12,、檢查連接在合成儀上的溶劑殘留(廢液瓶)是否充滿,。
13、如果分部收集器用來收集每個(gè)DMT脫保護(hù)步驟的流出物,,確保試管充分清潔干凈,,并打開分部收集器,確保DMT廢液管路通向分部收集器,。
14,、啟動循環(huán),運(yùn)行開始程序清洗試劑管路,,除去原來的試劑,。
注意:TritylOnAuto表示在合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個(gè)DMT,,并將其從固相載體上切下來,儲存在收集瓶中,;TritylOffAuto表示在合成寡核苷酸的5,,端核苷酸沒有保護(hù)基團(tuán),將其從固相載體上切下來,,儲存在收集瓶中,;TritylOnManual表示合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個(gè)DMT,,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,,而是保留在合成柱中;TritylOffManual表示在合成寡核苷酸的5,,端核苷酸沒有保護(hù)基團(tuán),,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,而是保留在合成柱中,。