OligoMaker 48高通量DNA合成儀用于合成結構上類似DNA或RNA的寡核苷酸的自動化儀器,。一般應用于固相合成法,每次將一個核苷酸加到所接長的寡核苷酸鏈上,,加入每一個核苷酸都利用相同的化學反應與相應的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用,。
OligoMaker 48高通量DNA合成儀特點:
? 包括一個靈活的合成協(xié)議編輯器,它允許操作員修改所包含的協(xié)議,,并將它們保存在一個新名稱下,,或者從頭開始編寫協(xié)議。協(xié)議編輯可以在Excel中完成,。對于不同的合成規(guī)模和序列長度,,很容易編輯特殊協(xié)議。比如,,可以給耦合緩慢的堿基對一個特別的延長的耦合時間,。如果必要的話,可以給所有單體額外的耦合反應時間,。
? 軟件簡單易用,。在計算機或平板的Excel表中創(chuàng)建運行數據后,可使用Wi-Fi等網絡連接或標準U盤傳輸到儀器上,。實驗運行中,,可以從PC端收集實驗數據監(jiān)測實驗結果,。
? 性能
OligoMaker X12可以在1小時內平行合成12條20對的寡核苷酸。
OligoMaker 48可以在2小時內平行合成多達48條20對的寡核苷酸,。
OligoMaker 96可以在3小時內平行合成多達96條20對的寡核苷酸,。
OligoMaker 192可以在4小時內平行合成多達192條20對的寡核苷酸。
? 可在IUPAC-IUB標準規(guī)則下合成10,、50,、200和1000nmol規(guī)模的核苷酸。
兩個反應盤,,一個盤可以加載和合成核苷酸,,另一個盤準備進行凈化步驟。
OligoMaker 48可以升級為OligoMaker 96和OligoMaker 192,;
OligoMaker 96可以升級為OligoMaker 192,。
亞磷酰胺寡核苷酸合成為例介紹該類儀器的一般操作步驟。亞磷酰胺DNA合成的試劑有:保護堿基的5/—DMT,,A,、G、C,、T亞磷酰胺單體,,四唑偶聯(lián)催化劑,乙酐,,N—甲基咪唑封閉試劑,,TCA脫保護溶液,12氧化混合物,,乙腈清洗溶劑,,氨水切除溶液。使用步驟如下:
1,、仔細檢查合成儀上所有試劑瓶中的試劑量,,必要時換掉試劑瓶,特別注意乙腈的量,,因為該溶劑用量較大,。
2、將標記好的清潔的收集瓶裝在合成儀上,。
3,、將要合成的DNA序列輸入合成儀。
4,、檢查選擇的合成步驟是否正確,。
5、選擇結束方法:若打算以5,—DMT基團連接純化寡核苷酸,,將其轉變?yōu)榻Y束狀態(tài),。
6、選擇結束方法,,一般為系統(tǒng)的原始狀態(tài),。
7、在每個柱監(jiān)視器下,,輸入你所希望的保存名字,。
8、以代碼代替相應的DNA序列標記每一個收集瓶,。
9,、打印出每一個柱設置的詳細資料。
10,、檢查打印出來的資料是否正確,。
11、檢查每一個柱的位置,,確保合成儀上合成柱處于正確的位置,。
12,、檢查連接在合成儀上的溶劑殘留(廢液瓶)是否充滿,。
13、如果分部收集器用來收集每個DMT脫保護步驟的流出物,,確保試管充分清潔干凈,,并打開分部收集器,確保DMT廢液管路通向分部收集器,。
14,、啟動循環(huán),運行開始程序清洗試劑管路,,除去原來的試劑,。
注意:在合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,并將其從固相載體上切下來,,儲存在收集瓶中,;在合成寡核苷酸的5,端核苷酸沒有保護基團,,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,,而是保留在合成柱中;,。