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如何看懂流式結(jié)果圖

閱讀:14429        發(fā)布時(shí)間:2019-8-30

流式結(jié)果圖有4種類型,,分別為:1. 直方圖  2.散點(diǎn)圖  3. 等高線圖  4.密度圖

下面一一為大家介紹

1. 直方圖(Histograms)

a.橫坐標(biāo)代表熒光信號(hào)或散射光信號(hào)相對(duì)強(qiáng)度,可以是線性或?qū)?shù)坐標(biāo),。

 

 

 

 

 

b.縱坐標(biāo)一般是相對(duì)細(xì)胞數(shù),。

直方圖適用于分析處理周期(如下圖)

 

 

直方圖分析數(shù)據(jù)注意事項(xiàng):

① 不能比較不同標(biāo)記之間的表達(dá)量。如一號(hào)樣本單標(biāo)記CD133,、二號(hào)樣本單標(biāo)記CD44,,那么CD133與CD44表達(dá)量不能用直方圖進(jìn)行比較。

② 直方圖的形狀(直方圖的高度及寬度)取決于儀器的類型,、處理軟件和樣本

③檢測(cè)目的細(xì)胞非常少(即檢測(cè)的細(xì)胞在一個(gè)細(xì)胞群體中所占的比例特別少),,因此需要統(tǒng)計(jì)大量的數(shù)據(jù),直方圖將會(huì)將該稀有細(xì)胞覆蓋,,如下圖散點(diǎn)圖中的P2門為CD16陰性群體,,但在直方圖中則幾乎看不出來,所以此時(shí)散點(diǎn)圖為展示數(shù)據(jù)方式,。

 

 

2. 散點(diǎn)圖(Dot plots)

散點(diǎn)圖是雙變量圖的基本圖形,,相對(duì)于單參數(shù)直方圖其分析通量更高,同時(shí)也能更好觀察到較小比例細(xì)胞群,,參見直方圖注意事項(xiàng)2,,另外散點(diǎn)圖中設(shè)門后,可以賦予門控顏色,,便于觀察門控細(xì)胞群在其他圖中的分布,,比如下圖只賦予淋巴細(xì)胞門紅色,則可以觀察到淋巴細(xì)胞中在散射光圖中的分布。

 

 

 

 

 

橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)都是光信號(hào),,十字門左下角是雙陰性群,,右下角和左上角是單陽群,右上角是雙陽群,。散點(diǎn)圖上的每一個(gè)點(diǎn)可以代表某一個(gè)細(xì)胞的信息,。

 

但是散點(diǎn)圖在顯示足夠多events下的細(xì)胞分群上缺乏細(xì)節(jié),如下圖,,流式儀器記錄的events達(dá)到50000以上時(shí),,CCR7的陽性群與陰性群已經(jīng)沒有明顯界限,但當(dāng)用等高線圖或者密度圖時(shí),,明顯改善點(diǎn)圖存在的缺點(diǎn),。

 

3.密度圖(Density plot)

密度圖不僅能夠表示一個(gè)標(biāo)記的表達(dá)水平,還能顯示給定區(qū)域中事件的相對(duì)數(shù)量(密度),。有三種密度圖,。密度度、斑馬線圖,、偽彩圖,。選擇自己一種喜歡的應(yīng)用

 

 

 

 

4.等高線圖(Contour plots)

等高線圖是另一顯示數(shù)據(jù)密度的形式。該圖使用等高線顯示數(shù)據(jù)的相對(duì)強(qiáng)度,。等高線的每條線包含events的百分比由所用軟件的等高線圖決定,。單純的等高線圖不能顯示低密度的群體顆粒或者異常值,,比較好的策略為等高線圖與點(diǎn)圖結(jié)合起來使用,,比如下圖左邊為點(diǎn)圖,中間為等高線圖,,左邊為等高線加點(diǎn)圖。

 

 

 

 

分析,,建議用散點(diǎn)圖用直方圖不能說錯(cuò),,但這需要在沒有自發(fā)熒光或自發(fā)熒光低、熒光滲漏調(diào)整到位的情況下,。而在實(shí)際檢測(cè)中,,自發(fā)熒光總是難以避免,更不用說現(xiàn)在多色流式中熒光滲漏對(duì)通道的干擾,。

通過下面這個(gè)圖可以明顯看出,,在直方圖上,自發(fā)熒光造成的拖尾,,使得你的陰陽性分界位置難以確定,,即使GFP樣本能夠形成雙峰,但實(shí)際上雙峰分界位置同時(shí)包括了自發(fā)熒光假陽性信號(hào),、陽性群弱表達(dá)信號(hào),,這兩部分信號(hào)數(shù)量一樣的時(shí)候,,這個(gè)位置恰好相互抵消,但如果不一樣的,,這個(gè)比例就不準(zhǔn)確了,,如果改用下面的散點(diǎn)圖,用不規(guī)則門(如下面的梯形門),,就可以準(zhǔn)確圈出陽性群,,呈現(xiàn)更真實(shí)的比例:

 

綜上,不同類型的流式圖各有優(yōu)缺點(diǎn),,適用于不同類型的檢測(cè),。

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