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蛋白八聚體由組蛋白H2A,、H2B,、H3和H4的各兩個亞基組成,由DNA包裹形成核小體,。組蛋白亞基的N末端含有可進行翻譯后修飾的殘基,。H3上的賴氨酸殘基K4可以單、二或三甲基化,分別形成H3K4me1,、H3K4me2或H3K4me3,。H3K4me1、H3K4me2和H3K4me3位于整個基因組的不同區(qū)域,。H3K4me1修飾主要分布在活性增強子元件中,;H3K4me2修飾主要分布在轉(zhuǎn)錄活躍基因的gene body區(qū);而H3K4me3修飾主要分布在TSS附近的啟動子區(qū)并激活轉(zhuǎn)錄,。
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圖片來源: PMID: 30616667
關于H3K4me1
H3K4me1是組蛋白H3蛋白的第4個賴氨酸殘基處的單甲基化,,通常與基因增強子相關。H3K4me1富集在活性和primed增強子區(qū)域內(nèi),。增強子由組蛋白H3K4單/二甲基轉(zhuǎn)移酶MLL4引發(fā),,然后由組蛋白H3K27乙酰轉(zhuǎn)移酶p300激活。H3K4me1會微調(diào)增強子的活性和功能,,而不是控制,。具有MLL3/4的H3K4me1也可以作用于啟動子并抑制基因。H3K4me1修飾是真核細胞增強子的表觀遺傳學標記,,可用于增強子在基因組上定位,。 | ![]() |
EpiCypher H3K4me1抗體
EpiCypher在CUT&RUN和CUT&Tag實驗中篩選了數(shù)百種抗體,并通過獨-有的SNAP-Certification技術進行驗證,,為研究者提供了可識別經(jīng)過修飾的組蛋白和相關細胞靶點的組蛋白PTM抗體,。H3K4me1抗體是EpiCypher最新推出的SNAP-Certified™抗體之一,符合CUT&RUN和CUT&Tag應用中特異性和有效靶標富集的標準,。
產(chǎn)品詳情
產(chǎn)品貨號 | 13-0057 |
產(chǎn)品名稱 | H3K4me1 Antibody, SNAP-Certified™ for CUT&RUN and CUT&Tag |
規(guī)格 | 100 µg |
產(chǎn)品類型 | Monoclonal [2088-1F4] |
宿主 | Rabbit |
濃度 | 0.5 mg/mL |
反應種屬 | Human, Wide Range(Predicted) |
實驗應用 | CUT&RUN, CUT&Tag |
免疫原 | A synthetic peptide corresponding to histone H3 monomethylated at lysine 4 |
保存溫度 | Stable for 1 year at 4°C from date of receipt |
配方 | Antigen affinity-purified antibody in Borate buffered saline pH 8.0, 0.09% sodium azide |
建議稀釋度 | 0.5 µg per reaction for CUT&RUN and CUT&Tag |
實例分析
圖1. CUT&RUN中SNAP特異性分析
圖2. CUT&Tag中SNAP特異性分析
使用SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel對H3K4me1抗體進行分析,,其與相關組蛋白PTMs的交叉反應性<20%。
圖3. CUT&RUN和CUT&Tag全基因組富集
H3K4me1抗體和H3K4me3陽性對照產(chǎn)生預期的富集效果,,不同數(shù)量細胞核的結(jié)果保持一致。
500k和50k K562細胞CUT&RUN 峰圖
圖4. H3K4me1抗體CUT&RUN和CUT&Tag峰圖
H3K4me1抗體在CUT&RUN和CUT&Tag應用中符合EpiCypher特定批次SNAP-Certified™標準,,并且不同的細胞數(shù)量下,,一致的基因組富集證實了高靶向效率。
關于EpiCypher
EpiCypher是一家成立于2012年的表觀遺傳學公司,。從專有組蛋白肽陣列平臺EpiGold™開始,,EpiCypher開發(fā)了一系列同類產(chǎn)品。同時,,EpiCypher是重組核小體制造和開發(fā)的全球領-導-者,。利用其獨-有技術,,不斷添加高純度修飾重組核小體(dNucs™)產(chǎn)品。dNuc™多樣性的產(chǎn)品為破譯組蛋白編碼和加速藥物開發(fā)提供了強大的工具,。
EpiCypher還將dNuc™技術廣泛的應用于多種分析測定產(chǎn)品中,,包括:SNAP-ChIP®Spike-in Controls(用于抗體分析和ChIP定量), EpiDyne®底物(用于染色質(zhì)重塑和抑制劑篩選及開發(fā)),,dCyher™測定(用于探究表觀遺傳蛋白質(zhì)-組蛋白PTM結(jié)合相互作用),。最近,EpiCypher還推出了針對ChIC,、CUT&RUN和CUT&Tag的高靈敏度表觀基因組圖譜CUTANA™分析,。
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