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如何做好RNA提取
閱讀:2284發(fā)布時間:2022-1-25
如何做好RNA提取
RNA定義:
RNA作為重要的生物大分子,是生命現(xiàn)象的分子基礎之一,。mRNA在信息傳遞中起很重要的作用ea6d18,。其它兩大類RNA,rRNA和tRNA,,同樣在蛋白質(zhì)的生物合成中發(fā)揮不可替代的重要功能,。因此mRNA、rRNA,、tRNA在遺傳信息由DNA傳遞到表現(xiàn)生命性狀的蛋白質(zhì)的過程中舉足輕重,。很多實驗中也需要提取相應樣本的RNA作為實驗原料。
提取方法:
1.Trizol法異硫氰酸胍/苯酚法
TRIzol試劑有多組分分離作用,,最大特點就是可同時分離一個樣品RNA/DNA/蛋白質(zhì),。TRIzol使樣品勻漿化,細胞裂解,,溶解細胞內(nèi)含物,同時因含有RNase抑制劑可保持RNA的完整性,。在加入氯仿離心后,,溶液分為水相和有機相,RNA在水相中,。取出水相用異丙醇沉淀可回收RNA,,用乙醇沉淀中間層可回收DNA,用異丙醇沉淀有機相可回收蛋白質(zhì),。
2.CTAB法
影響因素:
1.樣本材料:
●建議使用新鮮材料,。切記使用反復凍融的材料。
●材料長期保存建議液氮,,—80℃短期保存
2.樣本處理:
根據(jù)不同材料選擇不同的樣本處理
●培養(yǎng)細胞:通??芍苯蛹恿呀庖毫呀?/span>
●酵母和細菌:直接液氮研磨,之后用Trizol裂解
●動植物組織:先液氮研磨和勻漿,,后加裂解液裂解,。
純化方案:
●經(jīng)典的沉淀方法,雖然經(jīng)濟,但操作時間長,,易造成 RNA 降解;
●離心柱式純化方法:抽提速度快,,能有效去除影響后續(xù)RNA酶反應的雜質(zhì)。
●磁珠法:同時兼具了樣本需求低,、操作方便,、適配全自動化等優(yōu)點,目前是尤為常用的核酸純化方法,。
常見問題:
1.RNA降解
●樣品取樣以及保存是否得當
●裂解液的質(zhì)量
●外源RNase的污染
●裂解液的用量不足
●組織裂解不充分
●另外某些富含內(nèi)源酶的樣品(如脾臟,,胸腺等),很難避免RNA 的降解,。
2.OD260/OD280<1.65
●檢測吸光度時,,RNA樣品沒有溶于水,而溶于了TE中,。低離子濃度和低PH值條件下OD280值偏高,;
●樣品勻漿時加的試劑量太少或樣本量過多;
●吸取水相時混入了有機相,;
●RNA沉淀未*溶解,。
3.RNA總量低
●樣本選擇問題:樣本自身豐度不足
●樣品裂解或勻漿處理不*;
●RNA沉淀未*溶解,。
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