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KAPA RiboErase Globin 血液RNA-Seq的利器
閱讀：2840發(fā)布時間：2021-2-5
對血液樣本進行RNA測序時,，如果不進行適當的處理，會影響測序的結果,。
*,，真核生物細胞含有一些高豐度RNA,，其中含量高的是核糖體RNA（rRNA）,，而血液的RNA中含量第二高的就是珠蛋白（globin）RNA。這兩種RNA占血液樣本總RNA的85%以上,。
如果不進行處理就建庫測序,，高豐度RNA占據著大量的數據,，不僅浪費了測序成本,，更淹沒了目標RNA的數據，特別是一些低豐度但起著關鍵調控的RNA或者是罕見融合位點,，使我們難以比較表達的差異化和特異性。
利用mRNA的polyA尾特點來富集mRNA的方法,，雖然可以去除核糖體RNA,，但并不能去除globin mRNA，同時其它的非編碼RNA的品種也會一并丟失。另外,，在RNA樣本的質量不高時，由于降解導致polyA尾的不完整,，這種方法也不適用,。
這些問題通過采用RNA酶H法的KAPA新品Globin RNA去除寡核苷酸加上RiboErase (HMR)核糖體RNA去除試劑盒即可輕松解決！
RNA酶H法的原理：rRNA及globin RNA與特異互補的DNA寡核苷酸鏈雜交,，接著與DNA鏈雜交的RNA品種被RNA酶H特異消化去除，引入的DNA鏈則通過后續(xù)的DNA酶消化而去除,。
1
產品應用
1
可同時去除細胞質5S,、5.8S,、18S及28S 核糖體RNA，線粒體12S及16S 核糖體RNA,， 以及珠蛋白globin mRNA
2
適合物種：人,、小鼠、大鼠
3
可用于檢測帶polyA尾的RNA（成熟mRNA）及不帶polyA尾的RNA（包括非編碼RNA及前體RNA）
4
高質量與低質量RNA樣本同樣適用
2
優(yōu)異表現
1
穩(wěn)定去除99.9% rRNA及99.9% globin mRNA
2
低至25ng的血液來源RNA樣本也可獲得豐富轉錄本信息
3
一天內快速完成RNA富集及建庫流程（~6.5小時）（配套KAPA RNA Hyper建庫試劑盒）
4
降低非特異性去除比例（與非酶去除法比較）
KAPA更高效,、重復性更好
▲ 圖一 KAPA 實驗流程與I品牌同類產品相比,，KAPA對globin mRNA及rRNA的去除效率更高,，重復性更好。測序文庫從25/100/1000ng人血來源的RNA樣本制備,，實驗流程采用了相應產品推薦的實驗方案,。
KAPA助您發(fā)現更多
▲ 圖二 KAPA 實驗流程提升了*轉錄本的檢測數量
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