華雅旗下紅榮微再授權(quán)代理TAKARA Rubicon 文庫(kù)構(gòu)建（illumina平臺(tái)）產(chǎn)品

Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit

ThruPLEX與所有Illumina平臺(tái)兼容

產(chǎn)品英文名稱：ThruPLEX® Plasma-seq Kit

產(chǎn)品中文名稱：血漿來(lái)源cell free DNA NGS文庫(kù)構(gòu)建試劑

樣本：血漿來(lái)源的cfDNA（cell free DNA）和ctDNA（循環(huán)腫瘤DNA）

用途：WGS，WES,，靶向測(cè)序,，ctDNA分析

ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術(shù)，并用于血漿來(lái)源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫(kù)（illumina平臺(tái)）構(gòu)建,。

該試劑專門針對(duì)cell-free DNA進(jìn)行優(yōu)化,，在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上，提升了文庫(kù)的信息容量,。文庫(kù)構(gòu)建后可用于CNV分析,、全基因組測(cè)序分析或是采用一些panel針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。

血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫(kù),，能有更好的靈敏度,、更準(zhǔn)確的基因變異分析結(jié)果,。與其它液體活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得,、價(jià)值高的特點(diǎn),，深受研究腫瘤學(xué)或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

產(chǎn)品特點(diǎn)

專為cfDNA設(shè)計(jì)：修復(fù)及連接試劑配方更新,，方法優(yōu)化

高品質(zhì)NGS文庫(kù)：在寬廣的GC含量范圍內(nèi),，可以達(dá)到高檢測(cè)再現(xiàn)性

起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量

快速簡(jiǎn)便：?jiǎn)喂堋?/span>2小時(shí)、3步操作步驟,，無(wú)需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟

應(yīng)用領(lǐng)域：液體活檢,、ctDNA、靶向測(cè)序等領(lǐng)域文庫(kù)構(gòu)建

兼容自動(dòng)化平臺(tái)：Beckman® FXP Workstation

ThruPLEX與所有Illumina平臺(tái)兼容

Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols

High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage

Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA

Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps

Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing

Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation

產(chǎn)品應(yīng)用

WGS,，WES,，靶向測(cè)序，ctDNA分析

cfDNA文庫(kù)構(gòu)建,，腫瘤及產(chǎn)前無(wú)創(chuàng)檢測(cè)（母體血漿中胎兒游離DNA分析）

ThruPLEX Plasma-seq 優(yōu)化用于cell-free DNA等液體活檢樣品

液體活檢樣品包括

循環(huán)核酸

– Cell-free DNA (cfDNA)

• 循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）占一小部分

及RNA 外泌體等

ThruPLEX技術(shù)原理

ThruPLEX技術(shù)和所有Illumina NGS平臺(tái)兼容,。

技術(shù)要點(diǎn)：莖環(huán)形接頭

莖環(huán)形接頭的特別設(shè)計(jì)，免去了大多數(shù)Illumina等文庫(kù)制備技術(shù)需要的中間純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟,。整個(gè)實(shí)驗(yàn)只需15分鐘手動(dòng)操作且為1個(gè)反應(yīng)管,、2個(gè)小時(shí)、3步反應(yīng)的簡(jiǎn)單過(guò)程,。僅在PCR反應(yīng)后進(jìn)行1次磁珠純化,，純化造成的樣品損失低，可對(duì)珍貴樣品進(jìn)行有效分析,。

產(chǎn)品使用

適用樣本：液體活檢樣本

1ng-30ng 血漿,、尿液來(lái)源的cfDNA

組份 

分模板準(zhǔn)備、文庫(kù)合成和文庫(kù)擴(kuò)增三大部分,。保存-20℃,。

Template Preparation Buffer 模板準(zhǔn)備緩沖液（紅色）

Template Preparation Enzyme 模板準(zhǔn)備酶（紅色）

Library Synthesis Buffer文庫(kù)合成緩沖液（黃色）

Library Synthesis Enzyme文庫(kù)合成酶（黃色）

Library Amplification Buffer文庫(kù)擴(kuò)增緩沖液（綠色）

Library Amplification Enzyme文庫(kù)擴(kuò)增酶（綠色）

Nuclease-Free water 無(wú)核酸酶水（無(wú)色）

Indexing 試劑（藍(lán)色）

咨詢 1500 1904 520 紅榮微再-客服: 經(jīng)銷商專員

自備材料：

PCR管或96孔PCR板和密封件

Low binding aerosol barrier tips

新鮮制備的80％（v / v）乙醇

Agencourt® AMPure® XP 磁珠（Beckman Coulter，目錄號(hào)A63880）

可選試劑：

KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)

EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)

Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories

簡(jiǎn)單的工作流程：一管反應(yīng)

樣品加入PCR管,。

準(zhǔn)備模版修復(fù)混合液1（紅蓋）,，加入PCR管，反應(yīng),。

準(zhǔn)備文庫(kù)合成混合液2（黃蓋）,，加入PCR管，反應(yīng),。

準(zhǔn)備文庫(kù)擴(kuò)增混合液3（綠蓋）,，加入PCR管，反應(yīng)。

產(chǎn)品性能

高cell-free DNA文庫(kù)多樣性,、更少的Unmapped Reads,。ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫(kù)，具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads,。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,，文庫(kù)定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測(cè)定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng,、0.62 ng,、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測(cè)序,，且每個(gè)文庫(kù)產(chǎn)生17 M到25 M reads,。每個(gè)文庫(kù)在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后，計(jì)算Duplication rates,。

Rubicon R400490/R400491/R400492 訂購(gòu)信息

Rubicon公司成立于2000年,，總部位于美國(guó)密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù),，檢控嚴(yán)格,，擁有cGMP級(jí)生產(chǎn)能力，是單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建的,。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員,，并且發(fā)展良好,。

華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司主營(yíng)細(xì)胞治療和精準(zhǔn)醫(yī)療等產(chǎn)品，2018年與TAKARA繼續(xù)合作,，授權(quán)代理（上海）其旗下Rubicon單細(xì)胞文庫(kù)構(gòu)建試劑等產(chǎn)品,。