磁珠法提取核酸的3種樣本處理方法

以生物磁珠為載體提取核酸，所有反應(yīng)是在液體體系中進(jìn)行的,，但生物樣本多種多樣,，有液體也有固體，或者固液混合體,，大多數(shù)生物樣本在進(jìn)行核酸提取純化之前需要進(jìn)行一定的前處理,，液化、富集,、除雜等都是常見(jiàn)的前處理方式,。

一、液化

將固體樣本轉(zhuǎn)化為液體樣本是zui重要的樣本前處理方法,，固體樣本是很難直接在試劑盒的作用下用于提取核酸的,。固體樣本跟雜質(zhì)一樣，會(huì)嚴(yán)重阻礙磁珠吸附核酸,，并且耗損大量的磁珠位點(diǎn),，很難取得良好的提取效果。

常見(jiàn)的固體樣本如植物組織,、動(dòng)物組織,、泥土、濃痰等,。

植物組織和動(dòng)物組織,，可剪取適量的樣本，在研缽內(nèi)快速研磨,。研磨時(shí)如果需要保護(hù)RNA,，可以采用液氮研磨的方式。如果不需要提取RNA,，也可以加入裂解液或者生理鹽水幫助研磨成勻漿狀態(tài),。

泥土的處理方式主要是通過(guò)浸泡。因?yàn)閺哪嗤林刑崛『怂?，并非提取泥土本身,，而是提取泥土中存在的微生物的核酸。使用生理鹽水或者其他適當(dāng)緩沖液體浸泡泥土,，如果是較為干硬致密的泥土,，浸泡前可以先碾碎成小顆粒，浸泡過(guò)程中可用小棒攪動(dòng)幫助泥土分散,。浸泡一段時(shí)間后,，將泥漿用三層濾紙過(guò)濾，過(guò)濾所得的液體,，即可用于磁珠法提取,。

如濃痰,、膿液等固液混合又較為黏膩的生物樣本，可以先使用氫氧化鈉液體進(jìn)行堿解液化,，再酸中和后,，作為液體樣本進(jìn)行磁珠法提取。

以上方法處理固體樣本,，所得的液體,，可能并不*清澈透明，雜質(zhì)還是相對(duì)較多的,，如果必要,，使用離心的方式，可以除去更多的雜質(zhì),，但相對(duì)應(yīng)該控制離心速度在10000r/min以下,，否則核酸也會(huì)一起隨雜質(zhì)被離心下去。

二,、富集

很多時(shí)候,，用磁珠法提取的核酸都是微量或者痕量的樣本，直接使用樣本進(jìn)行操作,，所能得到的核酸很少,，這就要求下游的檢測(cè)試劑靈敏度很高，如果檢測(cè)試劑靈敏度不足,，在樣本痕量的情況下,，很可能檢測(cè)不出，出現(xiàn)假陰性,。所以對(duì)于微量樣本和痕量樣本,，可以進(jìn)行富集前處理。

有些時(shí)候,，樣本屬于常量樣本，但下游實(shí)驗(yàn)需求核酸量大,，也需要對(duì)樣本進(jìn)行富集,，以便每個(gè)提取都能獲得更多的核酸。

或者樣本量巨大,，無(wú)法直接使用試劑盒進(jìn)行提取,，也需要進(jìn)行富集操作。

常見(jiàn)的富集方法包括蒸發(fā)和離心,。

以土壤浸潤(rùn)水樣本為例,，浸泡大量的土壤樣本，獲得了500ml浸潤(rùn)水,，顯然無(wú)法將500ml浸潤(rùn)水作為樣本直接提取,?？梢韵葘颖痉盅b在兩個(gè)30ml離心管內(nèi)進(jìn)行，12000r/min離心十分鐘,，棄去上清液后,，用適量生理鹽水重懸沉淀后，移入小離心管內(nèi),，在80℃溫度下蒸發(fā)液體至液體量少于300ul,，即可用于磁珠法進(jìn)行核酸提取。

三,、除雜

很多生物樣本中都含有大量的雜質(zhì),，這些雜質(zhì)有的可以在試劑盒核酸提取的過(guò)程中被洗滌液除去，但有些,，很難通過(guò)后續(xù)的試劑盒洗滌直接除去,，這就要求我們?cè)跇颖厩疤幚淼臅r(shí)候，就直接先做初步的除雜,。

以大量血液樣本為例,，常規(guī)定量血液樣本（200ul以下），通常是不需要提前除雜的,。但如果血液樣本的量很大,，如4-5ml/提取，就很難直接進(jìn)行了,，不僅樣本的量超過(guò)常規(guī)試劑盒的容納范圍,，雜質(zhì)也非常多。

通常的做法是,，提前加入紅細(xì)胞裂解液,，離心，棄去上層液體,，裂解液重懸樣本,。

各種各樣的樣本前處理方法是很靈活多樣的，根據(jù)下游需求不同,，樣本特性不同,，通常是多種前處理方式組合應(yīng)用，以達(dá)到*效果,。

四,、結(jié)語(yǔ)

    總之，在磁珠法核酸提取的過(guò)程中,，樣本的前處理工作對(duì)整個(gè)提取結(jié)果會(huì)有至關(guān)重要的影響,。當(dāng)然，選取合適的磁珠,，更能使提取結(jié)果事半功倍,，01系列磁珠,，半沉降時(shí)間可達(dá)15min以上，磁吸時(shí)間僅為15s左右,，可為操作者帶來(lái)不一樣的磁珠操作體驗(yàn),。詳情可參考文章