可以采用染色法,。碘化丙啶是紅色熒光活力染料,，結合DNA。碘化丙啶不能穿透活細胞和早期凋亡細胞的細胞膜,，當細胞失去膜的完整性,，碘化丙啶可染色DNA，也就是說它可以染死細胞,，這個是常用的方法,。
Trypan Blue是一種常被使用于細胞染色的染劑。Trypan Blue無法穿透活細胞的細胞膜,，但是當細胞受傷或死亡,，細胞膜破損時，Trypan Blue則可以通透細胞膜進入細胞內,，使細胞染成藍黑色,。利用此一特點，配合血球計數(shù)器的使用,，則可以在奧林巴斯顯微鏡（CX22/CX31/CX41)底下,，分辨出細胞樣本中的活細胞與死細胞，以方便細胞計數(shù),。
一般用美藍與堿性品紅的復合染料進行死菌的區(qū)分,。染色后，活菌染為藍色，死菌和培養(yǎng)基偏紅,，在顯微鏡（CX22/CX31/CX41)下很好區(qū)分,。堿性品紅用乙醇加熱溶解，過濾,，按1：10左右加入,，可以根據(jù)情況適當調整到可以區(qū)分活菌和培養(yǎng)基即可。這是發(fā)酵中檢查是否染菌的zui常用方法,。
蘸取含細菌的液體LB培養(yǎng)基,，在奧林巴斯顯微鏡下直接觀察，活菌游動,，而死菌不動,，這是zui簡單的一種粗略的方法，用戶可以試試,。
