背景介紹
酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA)作為最快速,、靈敏、準(zhǔn)確可靠的定量分析方法之一,,組織樣本的處理和數(shù)據(jù)的處理方式對(duì)于ELISA實(shí)驗(yàn)的成功有著非常重要的作用,。ELISA檢測(cè)的樣本類型不僅包括常見(jiàn)的血清、血漿,、組織勻漿,、細(xì)胞裂解液、細(xì)胞培養(yǎng)上清,,而且包括不常見(jiàn)的尿液,、糞便、肺泡灌洗液,、唾液,、腦脊液、精ye,、陰道分泌物等,。其中組織勻漿、細(xì)胞裂解液,、糞便,、精ye等樣本的收集時(shí)間、處理方法和保存的差異,,會(huì)造成獲得樣品間的蛋白含量差異較大,,進(jìn)而造成后續(xù)檢測(cè)或數(shù)據(jù)處理上的一些問(wèn)題,,從而會(huì)影響到學(xué)者判斷ELISA實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。下面我們著重介紹一些比較通用的組織勻漿液的制備方法,,并通過(guò)文獻(xiàn)進(jìn)行列舉數(shù)據(jù)處理的方法,,以供大家學(xué)習(xí)借鑒。
玻璃勻漿器組織勻漿液的制備方法
用4℃預(yù)冷的1×PBS(pH7.2-7.4,,0.01M,,cell culture,貨號(hào):P1020)沖洗組織,,去除殘留血液,,并去除組織上的筋膜,、脂肪等冗余組織,;
稱重后將組織用眼科剪刀和鑷子剪碎。將剪碎的組織與對(duì)應(yīng)體積的PBS(一般按1:5-1:9的重量體積比,,比如1g的組織樣品對(duì)應(yīng)5-9 mL的PBS,,具體體積可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要適當(dāng)調(diào)整,并做好記錄,。推薦在PBS中加入蛋白酶抑制劑)加入玻璃勻漿器中,,在冰上充分研磨。為了進(jìn)一步裂解組織細(xì)胞,,可以對(duì)勻漿液進(jìn)行超聲破碎,,不建議反復(fù)凍融超過(guò)2次。因?yàn)檫^(guò)多的反復(fù)凍融可能影響細(xì)胞因子含量的穩(wěn)定性,。最后,,將組織勻漿液于2-8℃,5000×g離心5-10分鐘,,取上清檢測(cè),;
處理樣本的過(guò)程就是收集細(xì)胞因子或目標(biāo)蛋白的過(guò)程,由于細(xì)胞因子或蛋白結(jié)構(gòu)容易改變和降解,,組織勻漿過(guò)程完成后,,儲(chǔ)存也非常重要,特別需要注意的是,,不要反復(fù)凍融,,樣本處理之后可分裝密封保存,4度保存應(yīng)小于1周,,-20 度不應(yīng)超過(guò)3個(gè)月,,-80度不應(yīng)超過(guò)6個(gè)月。在標(biāo)本使用前應(yīng)室溫緩慢均衡溶化,,不能進(jìn)行加熱,。
超聲組織勻漿液的制備方法
提前將剪刀,、鑷子用75%酒精消毒,然后用預(yù)冷的1×PBS滌浸泡,,用來(lái)剪切,、剪碎組織;
對(duì)應(yīng)將要提取蛋白的組織編號(hào),,然后給EP管編號(hào),,放在冰上進(jìn)行預(yù)冷。用預(yù)冷的PBS (0.01M,,pH=7.4)沖洗組織,,去除殘留血液,稱重后將組織剪碎,;
配置裂解液:提前將蛋白酶抑制劑(貨號(hào):P6730),、磷酸酶抑制劑(貨號(hào):P1260)、PMSF(貨號(hào):P0100)分別按照1:100的體積比加入到RIRP裂解液中,,快速搖勻后靜置冰上即可,;
將剪碎的組織,加入對(duì)應(yīng)體積的裂解液(一般按1:9的重量體積比,,比如1g的組織樣品對(duì)應(yīng)9mL的裂解液,,具體體積可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要適當(dāng)調(diào)整,并做好記錄),;
在冰上,,用剪刀將組織剪碎(剪至組織顆粒非常細(xì)小,甚至剪成糜狀物),,然后去超聲破碎即可,。(超聲的條件:儀器:新芝 Scientz-IID;破碎條件:180W超聲3s關(guān)6s,,超聲一次時(shí)間1min,,超聲3-4次);
超聲破碎完成后,,離心(4℃,,12000rpm離心30分鐘);
離心完成后,,用移液器吸取上清液至新的EP管中,,同時(shí)記錄蛋白提取液的體積,然后用BCA法測(cè)上清蛋白的濃度,。
組織勻漿液的蛋白定量必要性
為了避免假陽(yáng)性的產(chǎn)生
ELISA檢測(cè)指標(biāo)眾多,,某些組織樣本如肝臟,腎臟,腦組織等,,因?yàn)榧?xì)胞內(nèi)含有的蛋白復(fù)雜多變,,可能會(huì)造成與檢測(cè)指標(biāo)有假陽(yáng)性反應(yīng)。所以通過(guò)蛋白含量檢測(cè),,把高濃度(20mg/mL以上)的樣本進(jìn)行稀釋至1-2mg/mL,,進(jìn)行判斷是否存在假陽(yáng)性的可能;
為了方便后續(xù)的數(shù)據(jù)處理和比較分析
因?yàn)榻M織塊的大小,、提取蛋白的效率不同,,所以必然提取的組織勻漿液中蛋白含量在一定的范圍內(nèi)變化,或者樣本間蛋白含量差異顯著,。這些都會(huì)造成后續(xù)數(shù)據(jù)處理的困難,,無(wú)法分辨是因?yàn)檠芯刻幚淼挠绊懀€是蛋白含量造成的差異性,。因此,,大多數(shù)學(xué)者會(huì)繼續(xù)發(fā)掘數(shù)據(jù)的其余方面,例如,,處理組與對(duì)照組的含量百分比,;每克組織勻漿蛋白中細(xì)胞因子含量的比較,;聯(lián)用其余指示性指標(biāo)進(jìn)行比較,,例如,炎癥反應(yīng)級(jí)別,、脂肪率,、模型差異等進(jìn)行聯(lián)合比較分析。
每克肝組織勻漿液蛋白中的TNF-α的含量圖
注:圖片摘自Borovikova, L., S. Ivanova, M. Zhang, H. Yang, G.I. Botchkina, L.R. Watkins, H. Wang, N. Abumrad, J.W. Eaton, and K.J. Tracey (2000) Vagus nerve stimulation attenuates the systemic inflammatory response to endotoxin. Nature 405: 458-462 (cites the use of KRC3012 with liver tissue homogenates).
脂多糖刺激處理組和實(shí)驗(yàn)組的TNF-α
百分比圖
注:數(shù)據(jù)處理方法為均值與標(biāo)準(zhǔn)差,;圖片摘自Borovikova, L., S. Ivanova, M. Zhang, H. Yang, G.I. Botchkina, L.R. Watkins, H. Wang, N. Abumrad, J.W. Eaton, and K.J. Tracey (2000) Vagus nerve stimulation attenuates the systemic inflammatory response to endotoxin. Nature 405: 458-462 (cites the use of KRC3012 with liver tissue homogenates).
組織勻漿液中瘦素與脂肪墊比率的數(shù)據(jù)聯(lián)用
比較圖
注:圖片摘自Lennie, T.A., M.D. Mortman, and R.J. Seeley (2001) Activity of body energy regulatory pathways in inflammation-induced anorexia. Physiology and Behavior 73(4):517-523 (cites the use of KRC0062 with serum and with tissue homogenates).
組織勻漿液進(jìn)行細(xì)胞因子檢測(cè)的思考
因?yàn)槟壳皺z測(cè)細(xì)胞因子的類型越來(lái)越多,,我們也要重新考慮樣本處理適合自己的樣本類型,并且適合自己檢測(cè)的細(xì)胞因子類型,,例如,,檢測(cè)因子有可能為蛋白酶3(Protease 3)、核糖核酸酶A(核糖核酸酶A),、中性粒細(xì)胞彈性蛋白酶(NE/ELA2)等具有酶活性質(zhì)的細(xì)胞因子,,在組織勻漿過(guò)程中是否添加蛋白酶抑制劑就值得思考;
一些檢測(cè)細(xì)胞因子需要酸化激活處理也需要特別注意,,例如轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1(TGF-β1),、肌肉生長(zhǎng)抑制素(GDF-8)等,因此在組織勻漿液的pH最好處于6.5-7.5的中性范圍,;
以上我們介紹的方法只是比較通用的方法學(xué),。最后,我們作為科學(xué)研究使用,還是需要更多的參考具有代表性,、可靠文獻(xiàn)中所述的處理方法,,避免因?yàn)樽约簶颖咎幚淼姆绞讲粚?duì),造成ELISA檢測(cè)的失敗,,影響檢測(cè)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和真實(shí)性,。
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