很多離子可用多種檢測(cè)方式,。例如測(cè)定過(guò)渡金屬時(shí),，可用單柱法直接用電導(dǎo)或脈沖安培檢測(cè)器，也可用柱后衍生反應(yīng),，使金屬離子與PAR或其它顯色劑作用,，再用UV/VIS檢測(cè)。一般的規(guī)律是：對(duì)無(wú)紫外或可見(jiàn)吸收以及強(qiáng)離解的酸和堿,，最好用電導(dǎo)檢測(cè)器,；具有電化學(xué)活性和弱離解的離子，最好用安培檢測(cè)器,；對(duì)離子本身或通過(guò)柱后反應(yīng)后生成的絡(luò)合物在紫外可見(jiàn)有吸收或能產(chǎn)生熒光的離子和化合物,，最好用UV/VIS或熒光檢測(cè)器。若對(duì)所要解決的問(wèn)題有幾種方案可選擇,，分析方案的確定主要由基體的類型,、選擇性、過(guò)程的復(fù)雜程度以及是否經(jīng)濟(jì)來(lái)決定,。
離子色譜柱填料的發(fā)展推動(dòng)了離子色譜應(yīng)用的快速發(fā)展,，對(duì)多種離子分析方法的開(kāi)發(fā)提供了多種可能性。特別應(yīng)提出的是在pH0-14的水溶液和100%有機(jī)溶劑（反相高效液相色譜用有機(jī)溶劑）中穩(wěn)定的親水性高效高容量柱填料的商品化,，使得離子交換分離的應(yīng)用范圍更加擴(kuò)大,。常見(jiàn)的在水溶液中以離子形態(tài)存在的離子，包括無(wú)機(jī)和有機(jī)離子,，以弱酸的鹽（Na2CO3/NaHCO3,，KOH、NaOH）或強(qiáng)酸（H2SO4,、甲基磺酸,、HNO3、HCl）為流動(dòng)相,，陰離子交換或陽(yáng)離子交換分離,，電導(dǎo)檢測(cè)，已是成熟的方法,，有成熟的色譜條件可參照,。

對(duì)近中性的水可溶的有機(jī)“大"分子（相對(duì)常見(jiàn)的小分子而言），若待測(cè)化合物為弱酸,，則由于弱酸在強(qiáng)堿性溶液中會(huì)以陰離子形態(tài)存在,，因此選用較強(qiáng)的堿為流動(dòng)相，陰離子交換分離,；若待測(cè)化合物為弱堿,，則由于在強(qiáng)酸性溶液中會(huì)以陽(yáng)離子形態(tài)存在,，選用較強(qiáng)的酸作流動(dòng)相，陽(yáng)離子交換分離,；若待測(cè)離子的疏水性較強(qiáng),，由于與固定相之間的吸附作用而使保留時(shí)間較長(zhǎng)或峰拖尾，則可在流動(dòng)相中加入適量有機(jī)溶劑,，減弱吸附,，縮短保留時(shí)間、改善峰形和選擇性,。對(duì)該類化合物的分離也可選用離子對(duì)色譜分離,，但流動(dòng)相中一般含有較復(fù)雜的離子對(duì)試劑。
此外,，對(duì)弱保留離子可選用高容量柱和弱淋洗液以增強(qiáng)保留，對(duì)強(qiáng)保留離子則反之,。離子色譜中常用的兩種主要檢測(cè)器:電化學(xué)檢測(cè)器（包括電導(dǎo)和安培）和光學(xué)檢測(cè)器,。在水溶液中以離子形態(tài)存在的離子，即較強(qiáng)的酸或堿,，應(yīng)選用電導(dǎo)檢測(cè),。具有對(duì)紫外或可見(jiàn)光有吸收基團(tuán)或經(jīng)柱后衍生反應(yīng)后（IC中較少用柱前衍生）生成有吸光基團(tuán)的化合物，選用光學(xué)檢測(cè)器,。具有在外加電壓下可發(fā)生氧化或還原反應(yīng)基團(tuán)的化合物,，可選用直流安培或脈沖安培檢測(cè)。對(duì)一些復(fù)雜樣品,，為了一次進(jìn)樣得到較多的信息,，可將兩種或三種檢測(cè)器串聯(lián)使用。