 | 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 |
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Gold Single Cell DNA-seq 試劑盒
| 參考價(jià) | 面議 |
具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
- 型號 R300670
- 品牌 TaKaRa
- 廠商性質(zhì) 代理商
- 所在地 重慶市
更新時(shí)間：2020-09-11 09:44:46瀏覽次數(shù)：1019
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產(chǎn)品簡介
| 供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè) |
|---|
產(chǎn)品貨號：R300670
產(chǎn)品名稱：Gold Single Cell DNA-seq 試劑盒
產(chǎn)品貨號：R300670
| 單細(xì)胞起始的DNA測序文庫構(gòu)建 |
| Gold Single Cell DNA-seq 試劑盒 |
| · 高重現(xiàn)性和準(zhǔn)確性：可用于CNV、SNV和非整倍體檢測 · 在SNV和CNV檢測方面優(yōu)于MDA技術(shù) · 三小時(shí)的工作流程,，手動(dòng)操作時(shí)間不到30分鐘 · 均勻的高覆蓋率,，低的等位基因插入率和脫扣率 |
| ■ 應(yīng)用： |
| 適用于以下細(xì)胞類型的文庫制備： |
| · 癌癥研究：循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC）,激光捕獲顯微切割（LCM）細(xì)胞或DNA,， 以及細(xì)針抽吸（FNA）細(xì)胞； · 生殖健康研究：胚胎細(xì)胞和循環(huán)胎兒細(xì)胞,； · 發(fā)育生物學(xué)：胚胎細(xì)胞,，干細(xì)胞和稀有細(xì)胞； · 宏基因組學(xué)和微生物學(xué)：微生物細(xì)胞,，微生物組和環(huán)境樣品,。 |
| ■ 產(chǎn)品說明： |
| PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit |
| PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一種旨在從單細(xì)胞中生成高質(zhì)量的DNA文庫，以便在Illumina平臺進(jìn)行測序的試劑盒,。該試劑盒基于PicoPLEX技術(shù)，優(yōu)化用于檢測拷貝數(shù)變異 (CNVs),、單核苷酸變異 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和結(jié)構(gòu)變異 (SV),。PicoPLEX Gold kit在SNV檢測中表現(xiàn)出比MDA技術(shù)更好的性能。 PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index,。兼容的 Index如下所述,，需要單獨(dú)購買。 PicoPLEX WGA是一種在被廣泛用于檢測單細(xì)胞中CNV的全基因組擴(kuò)增（WGA）技術(shù),。初,，PicoPLEX技術(shù)主要用于高再現(xiàn)性的檢測非整倍體異倍性和CNV。為了滿足準(zhǔn)確檢測SNV的需求，對PicoPLEX WGA技術(shù)中的酶,、引物和protocols進(jìn)行了進(jìn)一步優(yōu)化，不僅提升了擴(kuò)增的覆蓋度,、一致性,、準(zhǔn)確性,，同時(shí)提高了CNV,、SNV、Indel和其他SV的分辨率,，并且保持了高重現(xiàn)性。 PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定細(xì)胞或非固定細(xì)胞起始,，只需簡單的4步操作流程,，即可在3小時(shí)內(nèi)完成Illumina NGS文庫的構(gòu)建，且手動(dòng)操作時(shí)間非常短,。 |
| DNA HT dual index kits |
| DNA HT dual index kits是與 ThruPLEX或 PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒,。這些試劑盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列對應(yīng)的index引物,，多可提供384種不同的雙端index,，用于樣本混合測序時(shí)的區(qū)分。其中index引物預(yù)先分裝在4個(gè)的不同條形碼標(biāo)記的index微孔板中,，每個(gè)微孔板可提供不同的96種index組合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每個(gè)孔提供的量足夠進(jìn)行一次測序反應(yīng),；另一種是一套中有24個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)管，每個(gè)反應(yīng)管中包含不同的雙端index組合（Code No.R400664）,，且每個(gè)反應(yīng)管（24N）提供的量足夠進(jìn)行兩次測序反應(yīng),。 |
| DNA unique dual index kits |
| DNA unique dual index kits是與 ThruPLEX或 PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用,，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對應(yīng)的index引物,，多可提供96種不同雙端index,，用于樣本混合測序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的4組各24個(gè)單獨(dú)的管中,，其中每組可提供24種不同index引物組合（Code No.R400665-R400668）,。每個(gè)index引物管（24U Sets A-D）提供的量足夠進(jìn)行兩次測序反應(yīng)。 |
| DNA single index kits |
| DNA single index kits是與 ThruPLEX或 PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用,，用以構(gòu)建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對應(yīng)的index引物,，可提供24種單端index，用于樣本混合測序時(shí)的區(qū)分,。index引物預(yù)先分裝在不同的2組各12個(gè)單獨(dú)的管中,，其中每組可提供12種不同index引物組合（Code No.R400695和R400697）,。每個(gè)index引物管（12U Sets A-B）提供的量足夠進(jìn)行8次測序反應(yīng)。 |
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| 圖1. PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技術(shù),。 PicoPLEX Gold的技術(shù)概要,。通過step1裂解細(xì)胞獲得gDNA,，通過隨機(jī)引物進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增 (step 2),，然后進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增得到測序文庫（step 4）,。 |
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| 圖2. PicoPLEX Gold的主要特點(diǎn)：高覆蓋度,，高均勻性，和高重現(xiàn)性 (與A產(chǎn)品技術(shù)相比),。 Panel A. 圖中顯示在不同深度的測序中覆蓋的堿基數(shù) (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) ,。PicoPLEX Gold在較低深度的覆蓋度與A產(chǎn)品 (MDA) 相似,，在較高深度的覆蓋度高于A產(chǎn)品（MDA）。 Panel B. 以gDNA樣本 (NA12878) 和單細(xì)胞樣本 (GM12878) 起始,，使用PicoPLEX Gold和A產(chǎn)品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增,。相比較于MDA，PicoPLEX Gold顯示出更均勻的覆蓋度,。 Panel C. 評估覆蓋度的重現(xiàn)性,。與A產(chǎn)品 (右) 相比,，PicoPLEX Gold (左) 的在兩個(gè)單細(xì)胞群之間的一致性明顯更好,。 |
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| 圖3. 使用PicoPLEX Gold進(jìn)行高質(zhì)量單核苷酸變異（SNV）檢測。 Panel A. 以單細(xì)胞（1c）,，5個(gè)細(xì)胞（5c）或15 pg的 NA12878 gDNA起始,，比較A產(chǎn)品（MDA）,，PicoPLEX Gold（PP Gold）和 PicoPLEX WGA（PP WGA）這3個(gè)試劑盒之間的SNV檢測率。其中1個(gè)和5個(gè)細(xì)胞的測序深度為35M read pairs,， gDNA樣品深度為40M read pairs,。PicoPLEX Gold（藍(lán)色）有高的保真度和覆蓋度，與A產(chǎn)品（灰色）和PicoPLEX WGA（紫色）相比,，可以高質(zhì)量的檢測更多的SNV（2-9倍）,，具有明顯的優(yōu)勢。 Panel B. PicoPLEX Gold（藍(lán)色）的B等位基因頻率的對稱分布,，以0.5為中心,，展示兩個(gè)等位基因的平衡情況。與A產(chǎn)品（MDA）相比,，PicoPLEX具有更好的等位基因平衡（灰色）,。 Panel C. PicoPLEX Gold的無偏擴(kuò)增, 在測試的所有單細(xì)胞文庫制備的技術(shù)中，表現(xiàn)出低的等位基因脫扣率（假陰性）,。 Panel D. PicoPLEX Gold試劑盒中的聚合酶具有高保真度（藍(lán)色）,，使得等位基因插入率與A產(chǎn)品（灰色）相當(dāng)，且顯著低于PicoPLEX WGA（紫色）,。 |
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