人類(lèi)與感染性疾病的戰(zhàn)斗持續(xù)了幾千年。但自17世紀(jì)列文虎克用顯微鏡觀察到微生物后,，人類(lèi)才逐漸認(rèn)知到了感染性疾病是由病原微生物導(dǎo)致,，逐步開(kāi)啟了病原微生物的研究。
主要的研究方法包括經(jīng)典的培養(yǎng)鑒定法、實(shí)時(shí)熒光定量PCR法,、NGS分析,、質(zhì)譜分析等多種方法。其中NGS由于可直接從宿主中快速而正確地檢測(cè)鑒別病原體的全基因組序列,，以及通量高,、數(shù)據(jù)庫(kù)全等特點(diǎn)，逐漸成為微生物研究領(lǐng)域的重要方法,，并為后續(xù)實(shí)現(xiàn)對(duì)感染性疾病診斷,、治療及預(yù)防提供技術(shù)保障。

NGS在病原微生物研究中的主要應(yīng)用包括：
(1) 確定病原體全基因組序列,，動(dòng)態(tài)監(jiān)控病原體的基因組變異,；
(2) 特殊病原體（少見(jiàn)、未知,、混合感染）的快速鑒定,；
(3) 病原體的耐藥情況、毒力因子,、以及與宿主的相互作用等的研究,。

但是，科研人員往往面臨病原微生物核酸含量低,、宿主核酸污染,、實(shí)驗(yàn)流程復(fù)雜等問(wèn)題，

Takara病原微生物NGS文庫(kù)構(gòu)建解決方案,，能又快又好地幫您完成以下領(lǐng)域的分析,。

1. 病原微生物檢測(cè)

宏基因組學(xué)（Metagenomics）解決方案

宏基因組學(xué)是研究環(huán)境或人體等樣本中所有以DNA為基因組的微生物遺傳物質(zhì)的技術(shù)，它的發(fā)展開(kāi)啟了病原微生物研究的新時(shí)代,。這種技術(shù)不依賴(lài)微生物分離培養(yǎng),，可直接對(duì)臨床樣本中的核酸進(jìn)行檢測(cè)，分析微生物群落,、以及微生物與宿主之間的相互關(guān)系,。

ThruPLEX DNA-Seq Kit，實(shí)現(xiàn)對(duì)微量樣品的可靠宏基因組分析

在某些情況下,，以非常少量的臨床樣本作為研究對(duì)象進(jìn)行宏基因組分析是難免的,，這類(lèi)樣本包括臨床拭子、體液,、少量組織等,。ThruPLEX DNA-Seq Kit支持50 pg-50 ng DNA起始，單管操作,、手動(dòng)15 min、總共兩小時(shí)，過(guò)程中無(wú)需轉(zhuǎn)管與純化,，輕松應(yīng)對(duì)宏基因組建庫(kù)難題,！

【文獻(xiàn)案例】

皮膚是人體大的器官，“網(wǎng)羅”了各種各樣的微生物,。多年來(lái),，雖然科研人員對(duì)涉及皮膚內(nèi)穩(wěn)態(tài)的微生物群落研究有了一些進(jìn)展，但對(duì)皮炎與微生態(tài)失衡之間是否關(guān)聯(lián)知之甚少,。近來(lái),，瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院的Dr. Nanna Fyhrquist團(tuán)隊(duì)在Nature Communications雜志上發(fā)表了題為Microbe-host interplay in atopic dermatitis and psoriasis的文章，采用宏基因組學(xué)結(jié)合16s rRNA測(cè)序,、宿主轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析技術(shù),，探討過(guò)敏性皮炎、銀屑病及健康人皮膚表面微生物群落特征,，并與宿主皮膚轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,。

結(jié)果顯示，過(guò)敏性皮炎與銀屑病皮膚樣品具有各自*的微生物群落特征,，并都與健康人樣本的數(shù)據(jù)存在差異,。其中，過(guò)敏性皮炎樣本的優(yōu)勢(shì)菌為Staphylococcus aureus,，與皮膚屏障功能,、色氨酸代謝及免疫激活等宿主轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)有相關(guān)性；銀屑病樣本顯示出共生的微生物群落結(jié)構(gòu),，并與宿主疾病相關(guān)基因的表達(dá)存在弱相關(guān)性,。

本案例，作者使用皮膚拭子采集皮膚微生物樣本,，采用ThruPLEX DNA-Seq Kit完成宏基因組文庫(kù)構(gòu)建,，起始DNA量為50-300 pg，非常微量,！該試劑盒具有操作簡(jiǎn)便,，所構(gòu)建文庫(kù)覆蓋度均一、多樣性好,、duplicates比例低等特點(diǎn),，助力Dr. Nanna團(tuán)隊(duì)獲得了可靠的宏基因組數(shù)據(jù)，為后續(xù)皮膚炎癥biomarker的發(fā)現(xiàn)及靶向治療提供了數(shù)據(jù)支持,！

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