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NEB E6300S cDNA第一鏈合成試劑盒 cDNA合成
  • NEB E6300S cDNA第一鏈合成試劑盒 cDNA合成

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更新時(shí)間:2024-09-05 15:38:36

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NEB E6300S cDNA第一鏈合成試劑盒 cDNA合成
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NEB E6300S cDNA第一鏈合成試劑盒 cDNA合成

ProtoScript® cDNA 第一鏈合成試劑盒含兩種經(jīng)優(yōu)化的混合液:M-MuLV 酶混合液和 M-MuLV 反應(yīng)混合液,。M-MuLV 酶混合液含 M-MuLV 反轉(zhuǎn)錄酶和小鼠 RNase 抑制劑,M-MuLV 反應(yīng)混合液含 dNTP 和經(jīng)優(yōu)化的緩沖液,。該試劑盒還包含兩種優(yōu)化的反轉(zhuǎn)錄引物和無(wú)核酸酶水,。錨定的 Oligo-dT 引物 [d(T)23VN] 迫使引物與 polyA 尾的起始端退火。經(jīng)優(yōu)化的隨機(jī)引物混合液能隨機(jī)并持續(xù)性地與整個(gè) RNA 模板配對(duì),,包括 mRNA 和無(wú) polyA 尾的 RNA,。合成的第一鏈 cDNA 產(chǎn)物長(zhǎng)度可超過(guò) 10 kb


成功合成 cDNA 的要素:

RNA 模板
高純度的完整 RNA 對(duì)于靈敏的 RT-PCR 檢測(cè)至關(guān)重要。RNA 的 A260/A280 比值應(yīng)至少 1.7 或更高,。

總 RNA 或 mRNA 均可用于反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),。總 RNA 通常足以進(jìn)行大多數(shù) RT-PCR 分析,。不過(guò),,如果需要,可以使用 PolyA Spin mRNA 分離試劑盒(NEB #S1560)或 mRNA 磁性分離試劑盒(NEB #S1550)獲得 mRNA,。

檢測(cè)所需的 RNA 量取決于目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的豐度,。通常推薦使用 1 ng 至 1 μg 的總 RNA 或 0.1-100 ng 的 mRNA。

cDNA 第一鏈合成反應(yīng)
RNA 和引物在 70℃ 條件下變性 5 分鐘,可以去除阻礙較長(zhǎng) cDNA 合成的二級(jí)結(jié)構(gòu),。不過(guò),可以在某些情況下省略此步驟(結(jié)果未發(fā)表),。

推薦在 42℃ 條件下溫育一小時(shí),,以獲得最高產(chǎn)量和最大長(zhǎng)度。不過(guò),,許多靶標(biāo)用較短的溫育時(shí)間即可進(jìn)行檢測(cè),。例如,對(duì)于 2 kb cDNA 合成,,溫育 5 分鐘就足夠了,。

選擇反轉(zhuǎn)錄引物
Oligo d(T) 引物是大多數(shù)實(shí)驗(yàn)的首·選,因?yàn)樗_保所有 cDNA 拷貝在 mRNA 的 3′ 端終止并產(chǎn)生最長(zhǎng)的連續(xù) cDNA,。錨定的 Oligo-dT 引物 [d(T)23VN] 迫使引物與 polyA 尾的起始端退火,,從而防止在 polyA 尾的內(nèi)部位點(diǎn)開(kāi)始退火(1)。不過(guò),,如果需要,,也可以選擇另外兩種引物。

隨機(jī)引物混合液是經(jīng)優(yōu)化的六聚體和 d(T)23VN 引物混合液,。該混合液能隨機(jī)地與整個(gè) RNA 模板配對(duì),,包括 mRNA 和無(wú) polyA 尾的 RNA(例如核糖體 RNA)。隨機(jī)引物混合液產(chǎn)生的 cDNA 平均長(zhǎng)度較短,,可用于檢測(cè)多個(gè)短 RT-PCR 產(chǎn)物,。隨機(jī)引物混合液在各種 RNA 模板中均具有良好的性能。

基因特異引物用于 cDNA 合成反應(yīng)時(shí),,cDNA 產(chǎn)物只能用于擴(kuò)增該轉(zhuǎn)錄本,。RNA 起始量較低(低于 10 ng)且只需要一種特定的 cDNA 時(shí),使用這種方法可以獲得良好的結(jié)果,。

推薦的引物濃度:
引物:終濃度
OLIGO d(T)23VN:5 μM
隨機(jī)引物混合液:6 μM
特異引物:0.1–1 μM


NEB E6300S cDNA第一鏈合成試劑盒 cDNA合成

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產(chǎn)品應(yīng)用:
ProtoScript® First Strand cDNA Synthesis Kit 適用于以下應(yīng)用領(lǐng)域:

  • 定量RT-PCR (qRT-PCR): 利用高保真cDNA合成結(jié)果進(jìn)行定量基因表達(dá)分析,。

  • 基因克隆: 在克隆實(shí)驗(yàn)中用作RT-PCR的cDNA模板,,確保高保真度,。

  • 基因組學(xué)研究: 用于復(fù)雜基因組和轉(zhuǎn)錄組分析,生成高質(zhì)量的cDNA片段,。

  • 病毒學(xué)研究: 適用于病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄,,生成高質(zhì)量cDNA供后續(xù)分析。


華雅思創(chuàng)生物提供New England BioLabs (NEB)全系列產(chǎn)品:包括限制性內(nèi)切酶,PCR,、qPCR和擴(kuò)增試劑,,DNA修飾酶,NGS和目標(biāo)濃縮的樣品制備,,核酸提純,,RNA試劑,DNA組裝,、克隆和誘變?cè)噭┖?,基因組編輯試劑,細(xì)胞分析,,表觀遺傳學(xué),,蛋白質(zhì)表達(dá)與純化技術(shù),感受態(tài)細(xì)胞,,蛋白質(zhì)工具,,糖生物學(xué),DNA質(zhì)粒,,緩沖液,,菌株。



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