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小海龜數(shù)字PCR應用于胃癌的潛在診斷生物標志物篩查

閱讀:389        發(fā)布時間:2023-10-24

數(shù)字PCR(dPCR)是一種核酸絕對定量的技術,與傳統(tǒng)的熒光定量PCR技術(qPCR)相比,,dPCR擁有可以精確到單個核酸分子的高精準度,、適合復雜樣本的高便捷度,、且無需標準曲線或參照基因進行對比分析等特點。因此,,高靈敏度,、絕對定量、高穩(wěn)定性和更高的抗干擾能力成為數(shù)字PCR的4大優(yōu)勢,。

作為最常見的腫瘤之一,,胃癌(GC)具有高死亡率,因為當前的檢查方法不能實現(xiàn)早期診斷,。核粒梭菌(Fn)主要定居在口腔中,,據(jù)報道與胃腸道腫瘤的發(fā)展有關。迄今為止,,關于唾液Fn和胃癌之間的關系知之甚少,。該篇來自山東大學齊魯醫(yī)院文章確定唾液Fn能否作為診斷胃癌的生物標志物,并探討Fn對胃癌細胞的影響,。

 

 

實驗方法:通過液滴數(shù)字聚合酶鏈反應對2019年1月至2020年12月山東大學齊魯醫(yī)院的120例GC患者,、31例wei縮性胃炎(AG)患者、35例非AG (NAG)患者,、26例胃息肉(GP)患者和20例正常對照(NC)的唾液中Fn的豐度進行定量,。進行受試者工作特征(ROC)曲線分析,以評估Fn以及傳統(tǒng)血清腫瘤標志物(包括癌胚抗原(CEA),、糖類抗原(CA) 19-9和CA72-4)的診斷價值,。Transwell實驗和傷口愈合實驗評估Fn感染對GC細胞的影響。western blot法檢測上皮間質轉化(EMT)標記物的表達,。

 

★實驗流程:

  • 研究人員的樣本收集,,120例GC患者、31例wei縮性胃炎(AG)患者,、35例非AG (NAG)患者,、26例胃息肉(GP)患者和20例正常對照(NC)的唾液樣本的收集,離心后儲存在-80℃,。

  • 使用凱杰QIAamp Blood Mini Kit試劑盒提取200ul唾液樣本中的基因組DNA,,濃度用Qubit 3熒光計測定。

  • 使用上海小海龜數(shù)字PCR儀進行Fn的測定,,設計Fn的探針進行檢測,。

  • GC細胞的培養(yǎng),F(xiàn)n的菌株培養(yǎng)

  • 將GC細胞和Fn的菌株共培養(yǎng),,進行感染

  • 將感染后的GC細胞進行Transwell分析

  • 傷口愈合實驗,,感染后的GC細胞進行Transwell分析,感染后用200 μL的移液管jian端進行直線刮擦,,模擬傷口,,隨后,除去培養(yǎng)基和漂浮細胞,,用無血清培養(yǎng)基代替,,并捕獲圖像,。細胞培養(yǎng)48小時后,再次拍攝圖像,。

  • Western blot分析,,將感染Fn和未感染Fn的GC細胞裂解進行Western blot分析

 

實驗結果:核粒梭菌(Fn)是一種牙周致病菌,常見于胃腸道腫瘤組織中,。在此,,研究發(fā)現(xiàn)胃癌患者唾液Fn水平升高,可作為胃癌診斷的潛在生物標志物,,其診斷能力優(yōu)于傳統(tǒng)的血清腫瘤標志物,。研究還發(fā)現(xiàn)唾液Fn水平與胃癌TNM分期和淋巴結轉移呈正相關。此外,,實驗在試管內揭示了Fn通過促進上皮-間質轉化過程來促進GC細胞的遷移和侵襲,。該發(fā)現(xiàn)表明唾液Fn是診斷胃癌的潛在生物標志物。該研究表明唾液中Fn含量可作為診斷胃癌的生物標志物,,F(xiàn)n感染可通過加速上皮間質轉化過程促進胃癌轉移,。

該篇研究用的是小海龜數(shù)字PCR儀設備進行Fn數(shù)字PCR檢測。上海小海龜科技有限公司立足于基因檢測上游儀器,、芯片耗材與試劑開發(fā)的高新技術企業(yè),,其以微流控芯片技術為核心,已成功推出BioDigital 青數(shù)字PCR分體機,、以及BioDigital • 炎和SCI Digital系列數(shù)字PCR全自動一體機,,實現(xiàn)了基因檢測與分子診斷前沿技術領域的重大原始材料科技創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)化突破。

 

BioDigital 青--真正的液滴制備全自動PCR

  • china第yi張計量評價證書

  • 獲得醫(yī)療器械注冊

  • 兼容超多重技術

  • 分體機

 

性能特點:

  • 操作簡單:全封閉自動化液滴制備,,上樣,、制備無人工操作,設有4℃樣本保存功能

  • 使用成本低廉:個位數(shù)芯片成本,,支持單樣本開機

  • 平臺開放:可兼容第三方qPCR Mix

  • 高通量:1~96樣,,4路熒光

  • 液滴數(shù)量:>2萬,有效液滴比例:95%以上

  • 有一類醫(yī)療器械證,,適用于醫(yī)院系統(tǒng)

 

序號產(chǎn)品類碼型號/規(guī)格產(chǎn)品名稱適用范圍
1A00124測試/盒數(shù)字PCR通用試劑盒適配青系列,,用于DNA樣本的檢測
2A00148測試/盒數(shù)字PCR通用試劑盒適配青系列,用于DNA樣本的檢測
3A00224測試/盒病毒核酸提取試劑盒(磁珠法)用于病毒總核酸樣本提取
4A00324測試/盒游離DNA提取試劑盒(磁珠法)用于血液中cfDNA提取
5A00424測試/盒新型guan狀病毒核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)適用于熒光定量PCR儀
6A00524測試/盒新型guan狀病毒核酸檢測試劑盒(數(shù)字PCR法)適配青系列
7A00624測試/盒人EGFR基因T790M突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
8A00724測試/盒人EGFR基因L858R和19del突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
9A00824測試/盒人BRAF基因V600E突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
10A00924測試/盒數(shù)字PCR系統(tǒng)裝機測試試劑盒僅用于青裝機
11A01048測試/盒逆轉錄數(shù)字PCR通用試劑盒適用于青系列,,用于RNA樣本一步法檢測
12A01124測試/盒人EGFR基因T790M和C797S順反式突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
13A01224測試/盒乙型肝炎病毒(HBV),、丙型肝炎病毒(HCV)和人類免疫缺陷病毒(HIV)核酸檢測試劑盒(RT-dPCR-熒光探針法)適配青系列
14A01324測試/盒人EML4-ALK基因融合突變檢測試劑盒(RT-dPCR-熒光探針法)適配青系列
15A01424測試/盒人ROS1基因融合突變檢測試劑盒(RT-dPCR-熒光探針法)適配青系列
16A01524測試/盒人免疫缺陷病毒HIV-1核酸檢測試劑盒(RT-dPCR-熒光探針法)適配青系列
17A01624測試/盒人NRAS基因突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
18A01724測試/盒人HER2基因突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
19A01924測試/盒人BCR-ABL1基因融合突變檢測試劑盒(RT-dPCR-熒光探針法)適配青系列
20A02024測試/盒人ABL1基因T315I突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列
21A02124測試/盒人JAK2基因V617F突變檢測試劑盒(dPCR-熒光探針法)適配青系列

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