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PCR應用中存在的問題

閱讀:2820      發(fā)布時間:2018-3-20
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    開展 PCR 應具有一定的條件。需要一個正規(guī)的 pCR 實驗室,,采集標本,、核酸提取、擴增及產物分析應在不同的房間進行;需有嚴密的防污染措施,、假陽性和假陰性結果的質控等,。實驗者應具有一定的分子生物學理論知識及實驗技能,能夠及時發(fā)現和糾正實驗中的問題,。目前,,我國在 PCR 應用中尤其是在臨床診斷中存在問題較多,主要表現為: PCR 試劑的考核,、審查工作薄弱,,許多單位實驗條件不符合要求,部分操作人員的理論和實驗知識水平較低,。 PCR 的應用范圍過寬等,,因此造成 PCR 實驗結果的可靠性差,出現較多的假陽性,、假陰性結果,。

  一、假陽性:

  實驗中設立的陰性對照可提示有無假陽性結果出現,。如果一次實驗中的幾個陰性對照中出現一個或幾個陽性結果,,提示本次實驗中其它標本的檢測結果可能有假陽性,。造成假陽性的原因包括樣品污染、擴增試劑污染,、擴增產物交叉污染等,。常見的污染來源包括實驗室環(huán)境、加樣器,、操作中形成的噴霧,、 DNA 抽提儀器、試劑及任何與擴增產物接觸的東西,。預防措施:(1)工作區(qū)隔離,。(2)改進實驗操作,如在加樣過程中避免試劑飛濺,、吸頭離心管使用前高壓處理,、試劑分裝成小份一次使用后棄去等。(3)操作程序合理化,,如后加陽性對照等,。

  交叉污染的處理方法: 交叉污染指擴增產物對將要擴增的樣品或反應管的污染。由于 PCR 的敏感性和效率特別高,,所以少量的擴增產物污染標本或反應管即可出現假陽性,。交叉污染的處理方法包括 [1] :

  1 .在 DNA 模板和多聚酶加入前,紫外線照射反應管內容物以破壞污染的 PCR 產物,。一般選用波長 254nm 照射 30min ( Nature ,, 1990 , 34:27 )

  2 . PCR 實驗中使用 dUTP ,,而不用 dTTP ,。在擴增前使用 UraciI N 一 g1ycosylase (尿嘧啶糖基化酶)處理可降解交叉污染的 PCR 產物,而不降解基困組 DNA 模板,,然后熱滅活此酶,再進行擴增反應( Gene ,, 1990 ,, 93 : 125 )。

  3 .在 PCR 反應前加入一種光化學試劑,,反應完成后激活該試劑,,光化學試劑可交聯 DNA 鏈,使之不能再擴增( Nucleic Acids Res ,, 1991 ,, 19 : 99 )。

  二,、假陰性:

  如果實驗中設置的陽性對照未能擴增成陽性結果,,提示本次實驗中可能有假陰性結果,。但這里應注意,許多國產 PCR 試劑盒中陽性對照采用質粒 DNA ,,和標本相比來說,,不需純化提取核酸的步驟,因此,,如果在標本核酸純化提取步驟有問題,,即使陽性對照均呈陽性,標本檢測中還可能有假陰性,。

  造成假陰性的原因包括: (1) DNA 抽提過程不當,。 (2) DNA 樣品中含有 Taq 聚合酶抑制劑,如尿素,、 DMSO ,、 SDS 等物質,可抑制 Taq 酶活性,, DNA 樣品中的蛋白質和重金屬離子等亦影響 Taq 酶活性,,尤其是含有較多膿液或分泌物的標本,其中雖有待查菌,,但卻因標本處理不當而出現假陰性 [2] ,。

  設置內對照是判斷假陰性較好的指示系統(tǒng)。在每一反應管中加入內對照,,若內對照未能擴增出來,,說明該反應管的結果可能有問題。

  三,、PCR產物的鑒定

  PCR 產物通過瓊脂糖凝膠電泳可判斷其長度是否為預期的長度,,但只有通過雜交試驗或序列分析等才能判斷其特異性。嚴格說來,, PCR 產物均應通過實驗證實其特異性,。在我國一些科研論文和臨床檢測中缺乏這一環(huán)節(jié)。

  綜上所述,, PCR 具有其優(yōu)點,,但也有不足之處,它是一種很好的科研手段,,但作為常規(guī)診斷方法尚需進一步改進和提高 [9] ,。目前的關鍵問題是如何正確應用 PCR 。雖然 PCR 尚未在包括美國等發(fā)達國家作為常規(guī)診斷方法,,但如果具備開展 PCR 需要的條件,, PCR 是可作為輔助診斷手段使用的。目前,,只有針對 PCR 應用中存在的問題,,采取措施,,正確應用 PCR ,才能使這一技術在科研和臨床工作中發(fā)揮應有的作用,。

  參考文獻

  [1] Arnheim N, Erlich H. Polymerase chain reaction strategy. Annu Rev Biochem, 1992, 252:1643.

  [2] 葉順章,,聚合酶鏈反應在性病診斷中的應用,中華皮膚科雜志,, 1996 ,, 29/p>

  [3] Billiald P, Goyffon M, PCR: principles and prospects in clinical bilology. Ann Pharm Fr, 1995,53(4):155

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