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基因擴(kuò)增PCR的擴(kuò)增與克隆方法及一些使用的小建議
基因擴(kuò)增PCR主要有冰箱、超凈臺(tái),、加樣器,、混勻器、天平等,。加樣器,、天平除了要外,還應(yīng)有定期校準(zhǔn),。試劑分裝應(yīng)在超凈臺(tái)中進(jìn)行,,擴(kuò)增反應(yīng)混合液應(yīng)使用分子生物學(xué)級(jí)的,試劑制備好后應(yīng)有質(zhì)檢:一是否有污染,、二是檢測(cè)試劑的擴(kuò)增效果,。
基因擴(kuò)增PCR的擴(kuò)增與克隆方法:
?、僖锏男蛄袘?yīng)位于基因組DNA的高度保守區(qū),且與非擴(kuò)增區(qū)無同源序列,。這樣可以減少引物與基因組的非特異性結(jié)合,,提高反應(yīng)的特異性
②引物長(zhǎng)度:15-40bp為宜,。引物過短或過長(zhǎng)均可使反應(yīng)的特異性下降,。
③引物的堿基盡可能隨機(jī)發(fā)布,,避免出現(xiàn)數(shù)個(gè)嘌呤或嘧啶的連續(xù)排列,,G+C堿基的含量在40%-75%之間。
?、芤飪?nèi)部應(yīng)避免形成二級(jí)結(jié)構(gòu),,特別是引物的末端應(yīng)避免有回文結(jié)構(gòu)。
?、荻€(gè)引物不應(yīng)有互補(bǔ)序列,,特別是3’端應(yīng)避免互補(bǔ),以免形成“引物二聚體”,,浪費(fèi)引物,。
⑥引物5’末端堿基無嚴(yán)格限制,,在與模板DNA結(jié)合的引物長(zhǎng)度足夠的條件下,,其5’端堿基可不與模板DNA互補(bǔ)而呈游離狀態(tài),因此可在引物5’端加上限制性內(nèi)切酶位點(diǎn),、啟動(dòng)子序列或其它序列等以便于PCR產(chǎn)物的分析克隆等,,引物的5’端至多可加10個(gè)堿基而對(duì)PCR反應(yīng)無影響。
基因擴(kuò)增PCR的使用建議:
1,、使用本制品時(shí)務(wù)必將Buffer反復(fù)混勻后再加,,避免因組分不一導(dǎo)致結(jié)果差異;
2,、配置和分裝反應(yīng)液時(shí)請(qǐng)一定使用新的(無污染的)噴頭以避免污染,;
3、如擴(kuò)增條帶多,,可適當(dāng)添加酶和dNTPs,;
4、當(dāng)多重PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的長(zhǎng)度均在1kb以內(nèi)時(shí),,使用3%~4%濃度的Agarosegel進(jìn)行電泳分離效果,。