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干貨|關(guān)于超微量分光光度計(jì)你想知道的都在這里
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分光光度計(jì)就是利用分光光度法對(duì)物質(zhì)進(jìn)行定量定性分析的儀器,。由于核酸,,蛋白定量以及細(xì)菌生長濃度的定量樣本量很小,,于是超微量分光光度計(jì)應(yīng)運(yùn)而生,。超微量分光光度計(jì)近年來已經(jīng)替換普通的分光光度計(jì)成為分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的新寵,廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)等領(lǐng)域,。
超微量分光光度計(jì)與傳統(tǒng)分光光度計(jì)相比,,前者具備的*優(yōu)點(diǎn)在于:
(1)所需樣品體積小,僅需0.5—2μl,;
(2)不需要比色皿,,用移液槍直接將樣品滴加到檢測(cè)平臺(tái)上,測(cè)量時(shí)樣品自動(dòng)形成液柱,,檢測(cè)完成后只需用干凈的吸水紙將樣品從檢測(cè)平臺(tái)上擦拭干凈即可,,避免了因?yàn)楸壬笄逑床粌魩淼慕徊嫖廴荆?/span>
(3)一般具有多個(gè)光程(電機(jī)控制自動(dòng)選擇)【BIO-DL MicroDrop基座模式下光程1.0 mm、0.2 mm、0.1 mm 和 0.05 mm自動(dòng)調(diào)整】,,而傳統(tǒng)分光光度計(jì)的光程為10 mm,,超微量分光光度計(jì)樣品無需稀釋,測(cè)量范圍可達(dá)到常規(guī)分光光度計(jì)的50倍【BIO-DL MicroDrop基座模式下dsDNA檢測(cè)范圍:2~15000ng/μl】,;
(4)氙氣閃光燈為燈源,,代替了氘燈(紫外)和鎢燈(可見),使用壽命更長,;
(5)不需要預(yù)熱,,可隨時(shí)檢測(cè),檢測(cè)時(shí)間短【BIO-DL MicroDrop<5秒】,;
(6)顯示吸光度值的同時(shí),,程序直接給出濃度值(核酸、蛋白和熒光染料),;
(7)占據(jù)實(shí)驗(yàn)室空間體積比傳統(tǒng)分光光度計(jì)小很多【BIO-DL MicroDrop重量:2.1kg】,。
超微量分光光度計(jì)不僅涵蓋了可見光分光光度計(jì)的功能而且也可以進(jìn)行紫外分光光度計(jì)的應(yīng)用,zui常用以下幾方面:
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核酸的定量
核酸的定量是超微量分光光度計(jì)使用頻率zui高的功能,??梢远咳苡诰彌_液的寡核苷酸,單鏈DNA,、雙鏈DNA,,以及RNA。核酸的zui高吸收峰的吸收波長260nm,。每種核酸的分子構(gòu)成不一,,因此其換算系數(shù)不同。定量不同類型的核酸,,事先要選擇對(duì)應(yīng)消光因子,。如:1OD的吸光值分別相當(dāng)于50μg/ml的dsDNA,,37μg/ml的ssDNA,,40μg/ml的RNA,30μg/ml的Olig,。測(cè)試后的吸光值經(jīng)過上述系數(shù)的換算,,從而得出相應(yīng)的樣品濃度。除了核酸濃度,,分光光度計(jì)顯示幾個(gè)非常重要的比值表示樣品的純度,,如A260/A280的比值,用于評(píng)估樣品的純度,,因?yàn)榈鞍椎奈辗迨?80nm,。純凈的樣品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8或者2.0,,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類物質(zhì)的影響,。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,,多肽,,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0,。
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UV-VIS常規(guī)可見-紫外檢測(cè)
全波長超微量分光光度計(jì)可以像普通的紫外-可見分光光度計(jì)一樣行使功能,。如BIO-DL MicroDrop可以顯示從185到910nm的光波下樣品的吸光值。zui多可以同時(shí)檢測(cè)40個(gè)波長下的吸光值并把數(shù)據(jù)顯示在報(bào)告中,。
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蛋白質(zhì)的直接定量(UV法)
這種方法是在280nm波長,,直接測(cè)試蛋白。蛋白質(zhì)測(cè)定過程非常簡(jiǎn)單,,先測(cè)試空白液,,然后直接測(cè)試蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)直接定量方法,,適合測(cè)試較純凈,、成分相對(duì)單一的蛋白質(zhì)。紫外直接定量法相對(duì)于比色法來說,,速度快,,操作簡(jiǎn)單;但是容易受到平行物質(zhì)的干擾,,如DNA的干擾,;另外敏感度低,要求蛋白的濃度較高,。
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比色法蛋白質(zhì)定量
蛋白質(zhì)通常是多種蛋白質(zhì)的化合物,,比色法測(cè)定的基礎(chǔ)是蛋白質(zhì)構(gòu)成成分:氨基酸(如酪氨酸,絲氨酸)與外加的顯色基團(tuán)或者染料反應(yīng),,產(chǎn)生有色物質(zhì),。有色物質(zhì)的濃度與蛋白質(zhì)反應(yīng)的氨基酸數(shù)目直接相關(guān),從而反應(yīng)蛋白質(zhì)濃度,。
比色方法一般有BCA,,Bradford,Lowry等幾種方法,。
Lowry法:以zui早期的Biuret反應(yīng)為基礎(chǔ),,并有所改進(jìn)。蛋白質(zhì)與Cu2+反應(yīng),,產(chǎn)生藍(lán)色的反應(yīng)物,。但是與Biuret相比,,Lowry法敏感性更高。缺點(diǎn)是需要順序加入幾種不同的反應(yīng)試劑;反應(yīng)需要的時(shí)間較長;容易受到非蛋白物質(zhì)的影響;含EDTA,,Tritonx-100,,ammoniasulfate等物質(zhì)的蛋白不適合此種方法。
BCA(Bicinchoninineacidassay)法:這是一種較新的,、更敏感的蛋白測(cè)試法,。要分析的蛋白在堿性溶液里與Cu2+反應(yīng)產(chǎn)生Cu+,后者與BCA形成螯合物,,形成紫色化合物,,吸收峰在562nm波長。此化合物與蛋白濃度的線性關(guān)系*,,反應(yīng)后形成的化合物非常穩(wěn)定,。相對(duì)于Lowry法,操作簡(jiǎn)單,,敏感度高,。但是與Lowry法相似的是容易受到蛋白質(zhì)之間以及去污劑的干擾。
Bradford法:這種方法的原理是蛋白質(zhì)與考馬斯亮蘭結(jié)合反應(yīng),,產(chǎn)生的有色化合物吸收峰595nm,。其zui大的特點(diǎn)是,敏感度好,,是Lowry和BCA兩種測(cè)試方法的2倍,;操作更簡(jiǎn)單,速度更快,;只需要一種反應(yīng)試劑,;化合物可以穩(wěn)定1小時(shí),方便結(jié)果,;而且與一系列干擾Lowry,,BCA反應(yīng)的還原劑(如DTT,巰基乙醇)相容,。但是對(duì)于去污劑依然是敏感的,。zui主要的缺點(diǎn)是不同的標(biāo)準(zhǔn)品會(huì)導(dǎo)致同一樣品的結(jié)果差異較大,無可比性,。
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細(xì)菌細(xì)胞密度(OD600)
實(shí)驗(yàn)室確定細(xì)菌生長密度和生長期,,多根據(jù)經(jīng)驗(yàn)和目測(cè)推斷細(xì)菌的生長密度,。在遇到要求較高的實(shí)驗(yàn),,需要采用分光光度計(jì)準(zhǔn)確測(cè)定細(xì)菌細(xì)胞密度。OD600是追蹤液體培養(yǎng)物中微生物生長的標(biāo)準(zhǔn)方法,。
超微量分光光度計(jì)使用時(shí)注意小貼士:
(1)測(cè)量前將樣品中度混勻(可采用震蕩器或用手指彈震管底)
(2)移液器吸頭插入液面下吸取樣品,,可避免吸入氣泡,;TIP頭貼著下光纖表面打出樣品,且只按到移液器*擋盡頭,,第二擋不要按,,可以避免吹出氣泡到樣品中。
(3)每次測(cè)量完畢后,,用蒸餾水清潔上下光纖端面,,這樣可以更好地保證下一次測(cè)量的準(zhǔn)確性(主要針對(duì)超高濃度樣品,一般樣品無此要求),。
(4)每次做空白檢測(cè)前一定要先用水清潔上下光纖表面,,可保證空白檢測(cè)準(zhǔn)確。
(5)每次測(cè)量的核酸樣品量建議為1-2微升,蛋白樣品建議2微升,。 過少可能無法形成水柱,,過多可能溢出。
(6)加樣后盡快測(cè)量,,以防蒸發(fā)濃縮以及灰塵落入,,已加樣品不能多次檢測(cè),如需重測(cè)需重新滴加同一樣品,。
(7)儀器避免陽光直射,,避免強(qiáng)風(fēng)吹拂,以避免蒸發(fā),。
(8)連續(xù)測(cè)量一段時(shí)間后擦凈樣品,,用水清潔上下光纖表面,然后用水或緩沖液進(jìn)行重新空白后再檢測(cè),。
(9)清潔光纖端面(上樣基座)時(shí)必須用潔凈質(zhì)軟的實(shí)驗(yàn)室用紙(擦鏡紙等)進(jìn)行輕輕擦拭,。
(10)儀器不用時(shí),將上臂放下,,可以防止灰塵,。
※ 超微量分光光度計(jì)新晉小生——MicroDrop簡(jiǎn)介
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一機(jī)多用:既可使用超微量基座(下圖上),也可使用常規(guī)比色皿(下圖下),,想怎么測(cè)就怎么測(cè),!
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開機(jī)即用:交貨后即可使用 – 安裝時(shí)不需要進(jìn)行任何調(diào)節(jié)。只需開啟電源就能進(jìn)行測(cè)量,!
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上樣量少:上樣范圍0.5μl-2μl,,節(jié)約珍貴的樣本。再也不用擔(dān)心樣品不夠用啦,!
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無線連接:無需數(shù)據(jù)線連接電腦,,從此告別雜亂的數(shù)據(jù)連接線,儀器可自發(fā)WiFi信號(hào),。
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全光譜范圍:可檢測(cè)185-910nm波長下樣本的吸光值,,檢測(cè)范圍廣,,基座模式下因?yàn)榭s短了光程,檢測(cè)濃度范圍非常廣闊,,dsDNA:2-15000ng/ul,,無需稀釋樣品,簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)流程,,減少實(shí)驗(yàn)誤差,,能夠滿足極大部分用戶的需求。
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檢測(cè)快速:全波長掃描時(shí)間(185—910nm)只需5s,,每個(gè)樣品所需要的時(shí)間不到5秒鐘,,快速的檢測(cè)速度為大量的樣品檢測(cè)節(jié)省了寶貴時(shí)間。
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美觀簡(jiǎn)約:自重2.1kg,,便于移動(dòng),,占地面積小,選配平板無線連接,,平板可隨測(cè)隨取,,節(jié)省實(shí)驗(yàn)臺(tái)面空間。
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數(shù)據(jù)存儲(chǔ):可自定義選擇數(shù)據(jù)存儲(chǔ),,不僅能夠自動(dòng)保存檢測(cè)原始數(shù)據(jù),,也可導(dǎo)出Excel數(shù)據(jù)表,方便計(jì)算后續(xù)實(shí)驗(yàn)的加樣量,。