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用SPEX 組織研磨儀高通量破碎96孔板中的酵母菌
閱讀:3187發(fā)布時(shí)間:2016-7-26
多年生化,、遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的研究成果已經(jīng)使得酵母菌成為一種的基因表達(dá)研究和蛋白質(zhì)重組表達(dá)的通用宿主,成為生物系統(tǒng)研究的模式型生物,,是生物制藥科學(xué)家的有力工具,。盡管包括Pichia、Hansenula,、Debaryomyces均被研究者所使用,,但使用zui普遍的依然是Saccharomyces酵母,。
酵母菌mRNA 和細(xì)胞內(nèi)蛋白,很難用傳統(tǒng)酶解方法完整提取,。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白酶,,它們不僅會(huì)破壞細(xì)胞壁,且會(huì)破壞特定分子,。另外,,酶解產(chǎn)生的原生質(zhì)體,需借助特定試劑進(jìn)行溶解,,而導(dǎo)致很多蛋白質(zhì)變性失活,。因此常常需要使用物理方法破碎酵母菌,從而釋放內(nèi)容物,。
通常的壓榨或球磨方式,,每次只能處理一個(gè)樣品,操作效率太低,。對(duì)于那些需要進(jìn)行高通量篩選檢測酵母菌的實(shí)驗(yàn),,單個(gè)處理是一個(gè)主要的瓶頸和不切實(shí)際的,所以我們就需要一種可以單次高通量裂解細(xì)胞的方法,。Geno/Grinder組織研磨儀——一個(gè)zui初是為了在深孔板中高通量破碎種子而設(shè)計(jì)的垂直振蕩研磨儀就可以很好的解決這一問題???/span>同時(shí)在6個(gè)96孔深孔板中對(duì)酵母菌進(jìn)行破碎,。實(shí)現(xiàn)高通量地裂解酵母。
材料和方法:
釀酒酵母在YPD培養(yǎng)基((1% 酵母提取物, 2% 蛋白胨, 2% 葡萄糖))中30°C下150 rpm振蕩培養(yǎng)一整夜,,使用無菌96孔板(CorningLife Science),,每個(gè)孔中加入100 ml 培養(yǎng)液和酸洗的玻璃珠(Sigma,G-8772)。使用一系列不同尺寸的玻璃研磨珠(106 目 (非常小),150-212 目,212-300 目,425-600 目(大).)對(duì)照組酵母菌中只加入培養(yǎng)液不加玻璃研磨珠,。蓋上橡膠密封墊密封后放入Geno/Grinder動(dòng)植物組織研磨機(jī)內(nèi),,固定好。 1500轉(zhuǎn)/分鐘下振蕩5-10分鐘,。完成后,,用相差顯微鏡檢查酵母培養(yǎng)物并拍照。
結(jié)果和討論:
酵母裂解的有效性取決于玻璃珠的大小和研磨持續(xù)的時(shí)間,。圖1-3是用425-600目玻璃珠振蕩5-10分鐘的細(xì)胞裂解的效果,。在裂解細(xì)胞時(shí),玻璃珠的目數(shù)越低效果更差,,106目的玻璃珠尤其沒有效果,。結(jié)果表明425-600目的玻璃珠是裂解Saccharomyces的。
Geno/Grinder組織研磨儀的*設(shè)計(jì)也是裂解過程中一個(gè)重要的因素,。標(biāo)準(zhǔn)的珠磨研磨機(jī)適應(yīng)微孔板的應(yīng)用模仿“油漆攪拌器”設(shè)計(jì),,呈8字形運(yùn)動(dòng),。這種運(yùn)動(dòng)方式不能使樣品得以均一的裂解,樣品間差別很大,。而Geno/Grinder的垂直振蕩模式則能有效的裂解多孔材料中的樣品,,這種上下垂直運(yùn)動(dòng)方式使得玻璃珠更直接的碰撞細(xì)胞(而不會(huì)像一般的珠磨除了碰撞細(xì)胞外也常常會(huì)碰撞孔壁),從而能夠得到均一的研磨效果,。
圖1. 對(duì)照組未加玻璃珠的酵母菌,。10分鐘后,這些酵母菌依然完好無損,。
圖2. 用425-600目玻璃珠振蕩5分鐘的細(xì)胞裂解的效果,。破碎的酵母像是黑暗的“鬼魂”,完整的酵母菌則繼續(xù)折射光而呈現(xiàn)出明亮的部分,。
圖3. 用425-600目玻璃珠振蕩10分鐘的細(xì)胞裂解的效果,。絕大多數(shù)酵母菌已經(jīng)破碎呈現(xiàn)出黑暗的細(xì)胞“鬼魂”陰影,極少幾個(gè)酵母菌沒有被振蕩破碎而呈現(xiàn)出明亮的部分,。
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