SPOT 方法由 Ronald Frank 開發(fā),，用于在均質(zhì)膜載體上的不同位點(diǎn)同時(shí)合成多肽。該技術(shù)的原理是將預(yù)活化的氨基酸衍生物的小液滴分配到多孔膜上預(yù)定義的位置陣列上,。液滴被吸收并形成單獨(dú)的反應(yīng)室,，用于固相合成中的化學(xué)反應(yīng)。大量不同的點(diǎn)可以排列在一張膜上,，并且這些點(diǎn)中的每一個(gè)都可以通過相應(yīng)試劑溶液的手動(dòng)或自動(dòng)輸送來單獨(dú)處理,。每個(gè)區(qū)域的點(diǎn)數(shù)和點(diǎn)大小由膜的吸收能力和液滴的體積決定。根據(jù)基質(zhì)的特定功能,，點(diǎn)大小與合成的特定規(guī)模相關(guān),。 Ronald Frank 最初使用的濾膜仍然是蕞受歡迎的載體，由改性纖維素濾紙制成,。

在 MultiPep 1&2 合成器上合成肽陣列是一種創(chuàng)建大量肽的廉價(jià)且方便的方法,。它們通過活化氨基酸液滴的沉積在纖維素膜支持物上合成。與之前相比,，膜和氨基功能之間的鍵合在穩(wěn)定性上得到了改善,。它現(xiàn)在對 100% 三氟乙酉夋穩(wěn)定，并且在堿性條件下進(jìn)行試驗(yàn)不會(huì)導(dǎo)致肽損失。該鍵不能被切割以釋放肽,。肽保持共價(jià)連接,，因此難以進(jìn)行質(zhì)量控制。有幾種方法可以獲取有關(guān)合成質(zhì)量的信息,。

通常在每個(gè)合成周期中都有一個(gè)乙酰化步驟,，該步驟應(yīng)封頂所有未反應(yīng)的鏈,。如果出現(xiàn)嚴(yán)重的合成問題，在后面的合成步驟中就會(huì)出現(xiàn)完荃的封頂,，而不會(huì)留下任何游離的氨基,。因此，N端的報(bào)告分子將表明大部分合成是正常的,。有用的報(bào)告分子有

• 生物素,，用簡單的普通鏈霉親和素-報(bào)告基因共軛物檢測

• 鏈霉親和素報(bào)告共軛物也能檢測到 N 端的鏈霉標(biāo)簽II(NWSHPQFEK)。

• 羅丹明染料,，像氨基酸一樣容易耦合,，在日光條件下可見

上圖為煙草在 LUYOR-3410 紫外線燈照射下觀察到的效果

在 MultiPep 1&2 合成器上合成肽陣列是一種廉價(jià)而方便的大量合成肽的方法,。它們是通過沉積活化氨基酸液滴在纖維素膜支架上合成的,。與第一份出版物相比，膜與第一個(gè)耦合氨基酸功能之間的結(jié)合穩(wěn)定性有所提高?，F(xiàn)在,，它對 100% 的反式脂肪酸都很穩(wěn)定，在堿性條件下進(jìn)行檢測也不會(huì)導(dǎo)致肽的損失,。這種鍵不能被裂解以釋放肽,，而是保持共價(jià)連接,，因此很難進(jìn)行質(zhì)量控制。如果在第一個(gè)循環(huán)中引入了可裂解連接體（如 Rink 酰胺連接體）,，則整個(gè)肽都可以用反式

脂肪酸釋放出來,。在這種情況下，必須在側(cè)鏈脫保護(hù)之前切出該點(diǎn)并單獨(dú)處理,。

建議程序:

    1. 根據(jù)儀器手冊設(shè)置合成,。

    2. 在合成的第一個(gè)循環(huán)中，將 FMOC-Rink 酰胺連接物引入所需的質(zhì)控肽,。***質(zhì)控肽可在膜角附近合成,，以便于去除。

    3. 合成后,，從儀器上取下干燥的膜并觀察斑點(diǎn)

    4. 將切下的質(zhì)控點(diǎn)放入 1.5 mL 螺旋蓋微量離心管（或類似試管）中,，加入 150 uL 通用裂解混合物（或自選混合物）,。蓋緊試管蓋，培養(yǎng) 2-4小時(shí),。這將使肽從各自的林克酰胺連接體上裂解,，并去除側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)。

    5. 將含有已裂解多肽的上清液轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的微量離心管中,，并丟棄裝有已用斑點(diǎn)的離心管,。

    6. 使用標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室程序?qū)⑷芤和贶醺稍铮☉?yīng)注意強(qiáng)酸和實(shí)驗(yàn)室設(shè)備）。

    7. 用 10 uL 0.1 % 的反式脂肪酸重溶干肽,。

    8. 對該溶液進(jìn)行 MALDI分析,，基質(zhì)一般為1μL 或更少。(注意 MW為 -1)

注：三氟乙酉夋(TFA)是一種揮發(fā)性很強(qiáng)的酸,。整個(gè)裂解和加工過程必須在通風(fēng)櫥中進(jìn)行,。在此階段必須佩戴安全眼鏡、手套和白大褂,，并遵守所有安全規(guī)定,。所有廢物必須按照國家規(guī)定進(jìn)行處理。

通用裂解混合物

• 92.5%(vv)三氟乙酉夋,，TFA

• 5% (v/v) 三異丙基硅烷

• 2.5% (vv) 水

用于可裂解點(diǎn)的 Fmoc 鏈接器

Su et al.

Epigenetics&Chromatin volume 7, Article number:7(2014),，組合 PTM 組蛋白肽微陣列合成使用 RespepSL 自動(dòng)合成器(Intavis AG,，KoIn，Germany,MultiPep 1CEM)在改性纖維素上合成肽,。將Fmoc從 celluspot 中移除并耦合 Cy3(Lumiprobe,公司)后,，就得到了纖維素-Cy3 染料共軛的斑點(diǎn)對照?？瞻准?xì)胞色斑對照組是通過去除色斑上的 Fmoc 并將試紙置于溶解條件下而制成的,。對于肽，初始偶聯(lián)包括等摩爾量的Fmoc-Ala-OH 和 Boc-Ala-OH,，以減少樹脂負(fù)載并提高合成質(zhì)量。每次合成的肽都含有可被酸裂解的鏈節(jié),，以便通過高效液相色譜法和質(zhì)譜法進(jìn)行質(zhì)量評估(附加文件 12:表 S2),。此外還加入了 20 原子的聚乙烯連接體(PE)(Novabiochem 公司)，以提高合成效果和陣列中的蛋白質(zhì)結(jié)合力,。Fmoc-Glu-(biotinyLPEG)-OH(Novabiochem)是鏈霉親和素的對照,。

使用標(biāo)準(zhǔn)的 Fmoc/tBu 化學(xué)方法生成 13 氨基酸肽。如前文所述 [24],，肽的 PTM 以適當(dāng)保護(hù)的單體形式引入,。合成完成后，用 82.5% 的三氣乙酸(TFA)去除側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán):5% 硫代苯甲醚5% 水:5%二氯甲烷中的飽和苯酚:2.5%乙烷二硫醇,，持續(xù) 90 分鐘(每個(gè)點(diǎn)150μ),。取出溶液，換上 250 μ的 88.5% 反式脂肪酸,、4% 三氟甲磺酸,、2.5% 三異丙基硅烷和 5% 水，輕輕攪拌過夜以溶解纖維素,。用冷的二乙酉迷沉淀肽纖維素共軛物兩次,，晾干幾分鐘，然后重新溶解到100μ 的二甲基亞砜(DMSO)中,。

Boisguerin et al.

Chemistry & Biology, Vol. 11, 449–459, April, 2004,，我們用與 PSD-95 PDZ3-結(jié)構(gòu)域結(jié)合的多肽 NYKQTSVCOOH 測試了硫醚環(huán)化的效率[148]。溴乙?；?10)(粗體數(shù)字 10-12 參考圖 3.5 (A))是在幾個(gè)可裂解點(diǎn)上合成的(通過加入Fmoc-Rink 連接器實(shí)現(xiàn)可裂解性),。3 小時(shí)后，用反式脂肪酸將肽產(chǎn)物 h-1,、h-2 和 h-3 從點(diǎn)上裂解,，并用 HPLC 和 ESI-MS 進(jìn)行分析(圖 3.5 (B))。對反應(yīng)產(chǎn)物的分析清楚地表明,，在 h-3 條件下,，硫醚-環(huán)化反應(yīng)的效率很高,。為了確定肽序列對環(huán)化!清除步驟的影響，我們又合成了兩種膜結(jié)合溴乙?；?EFHAALGSYVCOOH和 QHIDSQKKACOOH,。

關(guān)于點(diǎn)合成的常見問題

1. SPOT 合成的時(shí)間是什么時(shí)候?

使用雙偶聯(lián)方案合成 4x384 肽時(shí)，每個(gè)周期需要 2 個(gè)小時(shí),，最后處理需要 2-3 個(gè)小時(shí),。每個(gè)周期的操作時(shí)間約為 30 分鐘，用于制備活性衍生物和清洗膜,。

2. 膜上肽的密度是多少?

標(biāo)準(zhǔn)密度為 10x15 厘米纖維素膜片上 600 個(gè)肽網(wǎng)格,，中心到中心的距離為 4.2 毫米。也可以自由定義其他網(wǎng)格,。在非常受控的條件下,，纖維素膜上的密度可達(dá) 25x40 個(gè)點(diǎn)。

3. 一個(gè)點(diǎn)有多少肽?

我們提供的膜經(jīng)過衍生處理后,，游離氨基的負(fù)載量約為 300-400 nmol/cm2,。每個(gè)斑點(diǎn)的負(fù)載量可通過面積計(jì)算得出。

例如:一個(gè)直徑為6毫米的點(diǎn)約有 80 納摩爾的肽,，一個(gè)直徑為3 毫米的點(diǎn)約有 20 納摩爾的肽,。

4. 在 CelluSpots 合成過程中，應(yīng)選擇哪種品牌的濾紙放在框架下?

建議使用 Whatman 540 或 541

5. 乙?；嚢彼崛绾斡糜诤铣?

獲取 Fmoc-LyS(Ac)-OH,，CAS#159766-56-0，并按照與 MultiPep 1&2 相同的標(biāo)準(zhǔn)偶聯(lián)方法進(jìn)行偶聯(lián),。

6. Ahx連接劑的親水性對應(yīng)物是什么?

建議使用 Fmoc-8-氨基-3,6-二氧雜辛酸,。

7. 如何提高小規(guī)模濾板合成的產(chǎn)量?

使用 Ramage 樹脂(PC-01-0601)，用小容量裂解雞尾酒可立即裂解肽,。

8. 如何使用 MultiPepRSi 或 RespepSL 合成 PNA 使用以下設(shè)置:

PNA 單體：0.3M 在 NMP 中使用新型偶聯(lián)劑

活化劑：HATU 或 PyAOP(0.6M 溶液);HATU 更穩(wěn)定,，PyAOP 應(yīng)每天更新。

堿混合物：DIPEAV2,6-lutidine(1.2/1.8M,，DMF 中),，兩種堿在 DMF 中的混合比例為20.09%(vvv)。

9. 如何減少消旋化?

在所有合成的肽中,，外消旋化約占 1%,。消旋化會(huì)使肽更加穩(wěn)定，從而導(dǎo)致錯(cuò)誤折疊,。苯丙氨酸和組氨酸會(huì)發(fā)生消旋化,。組氨酸在 50C 或更高的溫度下很容易發(fā)生消旋化。DIC 和 OxymaPure 的組合可減少消旋化,。PyOxim 和 NMM 的組合更易發(fā)生消旋化,，但不如 HBTU 和 NMM 的組合,。

10. 如何減少脫保護(hù)過程中天冬氨酸的形成?

在整個(gè)合成過程中，用 20% 的哌啶在 DMF（含 0.1M HCOOH）中對 Fmoc 基團(tuán)進(jìn)行脫保護(hù),，以避免天冬酰亞胺副反應(yīng),。

11. 如何從 SPOT 膜上裂解多肽?

使用 Fmoc 鏈接劑作為第一個(gè)氨基酸。切出所需的點(diǎn)并涂上裂解液,。Rink-Linker 會(huì)自行裂解并生成 C 端酰胺,。

12. 我的 SPOT 肽中有一部分 N 端酰胺被乙酰化了,。如何避免這種情況?

最后一個(gè)氨基酸使用叔丁氧羰基氨基酸,。這樣可以避免濾紙和濾紙下方通道中的微量醋酸酐造成乙酰化,。

13. 溶解了 NMP 的氨基酸可以保存多久?

除半胱氨酸和蛋氨酸外,，氨基酸溶液可在 4℃ 下保存一個(gè)月。請注意,，如果粉未變質(zhì)，丙氨酸和谷氨酸會(huì)產(chǎn)生沉淀,。