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上新,!一種新型固相烷基化試劑,,助力高效處理蛋白組學樣本

閱讀:810      發(fā)布時間:2023-10-31
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背景


蛋白質組學本質上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,、亞細胞定位,、翻譯后的修飾、蛋白與蛋白相互作用等,,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發(fā)生,、細胞代謝,、生長發(fā)育以及各種脅迫反應等過程的整體而全面的知識。




隨著生物質譜技術迅速發(fā)展,,質譜技術已經(jīng)逐漸成為了蛋白質組學分析的主流技術,。質譜儀器具有高靈敏度、高分辨率等特點,,樣本前處理的質量和可重復性顯著影響質譜儀的分離和鑒定能力,。


蛋白質組學樣本前處理流程復雜、處理時間長(傳統(tǒng)蛋白質組前處理需過夜),,造成了樣品前處理不穩(wěn)定,、樣品質量參差不齊,重現(xiàn)性差等問題,,急需一種高效,、高回收率、抗干擾能力強的蛋白質組學分析的前處理方法,。






蛋白質組學分析流程






產(chǎn)品介紹




??萍瘓F全新推出的蛋白組學樣本前處理試劑盒,其中的關鍵組分是一種新型固相烷基化試劑,,與傳統(tǒng)的烷基化試劑相比,,采用新型固相烷基化試劑,蛋白質可與其它小分子(如糖,、鹽,、表面活性劑、脂類等)實現(xiàn)快速分離,,提高蛋白質的純度,,顯著降低樣本復雜程度。同時,,試劑表面親水性較好,,可顯著提高蛋白質或酶解產(chǎn)物的回收率。產(chǎn)品適用于處理各種來源的蛋白質組樣品,,如細胞,、血漿、細菌,、腫瘤組織等




??频鞍捉M學樣本前處理試劑盒

(新型固相烷基化試劑)






產(chǎn)品特點




一、高效



操作簡便,、高效,,一站式覆蓋蛋白質組提取到消化的所有步驟



二、高回收率



蛋白質組處理回收率高,,可滿足納克至微克級別蛋白質組樣品的處理需求



三,、抗干擾



抗干擾能力強,,對樣品中表面活性劑、有機試劑,、各種酸堿緩沖溶液等均可耐受



四,、適配自動化



除手動操作外,可適配??谱詣踊疤幚碓O備






產(chǎn)品測試數(shù)據(jù)






使用試劑盒對293T細胞處理后進行重復性驗證




材料:用 6M 鹽酸胍超聲裂解 293T 細胞離心獲得

實驗方法:隨機選取2批次試劑,,將同一樣品分為6份,每批次試劑各做3個平行樣品,,使用蛋白組學樣本前處理試劑盒流程處理后,,將樣品進行Q Exactive質譜檢測。




Q Exactive質譜檢測結果如下:



表1:不同批次前處理試劑處理293T蛋白樣品QE質譜檢測蛋白數(shù)及零漏切率


圖1:不同批次試劑處理293T蛋白樣品質譜檢測重復性Pearson Correlation Coefficient均>0.99






使用試劑盒對E. coli 樣本處理后進行重復性驗證




材料:用 6M 鹽酸胍超聲解 E. coli 離心獲得

實驗方法:隨機選取2批次試劑,,將同一樣品分為6份,,每批次試劑各做3個平行樣品,使用蛋白組學樣本前處理試劑盒流程處理后,,將樣品進行Q Exactive質譜檢測,。




Q Exactive質譜檢測結果如下:



表2:不同批次前處理試劑處理E.coli蛋白樣品QE質譜檢測蛋白數(shù)及零漏切率

圖2:不同批次試劑處理E.coli 蛋白樣品質譜檢測重復性Pearson Correlation Coefficient均>0.99






■ 實驗總結



對293T 細胞和E. coli 樣本分別用兩批次試劑進行前處理,批間的重復性測試表明可檢測到的蛋白數(shù)及零漏切率基本一致,,達到預期要求,;檢測結果皮爾斯相關系數(shù)介于0.991-0.996之間。說明不同批次試劑實驗結果重復性好,。




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