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藍(lán)藻細(xì)菌是普遍存在的環(huán)境細(xì)菌,,由于藍(lán)藻細(xì)菌很早就從其他菌株中分支出來,,因此很少有人知道它們的進(jìn)化,。近日,,研究人員發(fā)現(xiàn)一種Melainabacteria與藍(lán)藻關(guān)系密切但卻不同,,并編碼了許多同源蛋白,,包括生理節(jié)奏調(diào)節(jié)因子以及罕見的表面蛋白。
藍(lán)藻細(xì)菌是普遍存在的環(huán)境細(xì)菌,,由于藍(lán)藻細(xì)菌很早就從其他菌株中分支出來,,因此很少有人知道它們的進(jìn)化。近日,,研究人員發(fā)現(xiàn)一種Melainabacteria與藍(lán)藻關(guān)系密切但卻不同,,并編碼了許多同源蛋白,包括生理節(jié)奏調(diào)節(jié)因子以及罕見的表面蛋白,。
藍(lán)藻細(xì)菌是在環(huán)境中*的細(xì)菌,,它在地球化學(xué)事件中具有重要的作用,例如大氣早期的氧化,,這是由于它具有生氧光合作用的能力,。由于藍(lán)藻細(xì)菌很早就從其他菌株中分支出來,并且沒有其他有關(guān)的分類群被人們所發(fā)現(xiàn),,因此對(duì)它們的進(jìn)化一直知之甚少,。如今,Ley,、Banfield和同事描述了一種候選的“兄弟姐妹”門,,名為Melainabacteria,后者在地下水和人類消化道中都曾被發(fā)現(xiàn),。
盡管之前的研究曾發(fā)現(xiàn)16S 核糖體RNA(rRNA)基因與消化道樣本中的藍(lán)藻基因有關(guān),,但它表明這些序列起源于攝取的葉綠體,而非乃在的細(xì)菌,。在zui近的研究中,,從來自先前測序地下水含水層的宏基因組數(shù)據(jù),以及從3個(gè)人類糞便樣本中新分離出的DNA序列中,,作者尋找了與藍(lán)藻基因有關(guān)的序列,,以及全新的序列,。通過這些序列,利用一種迭代算法和手工篩選,,他們組裝了全部或部分基因組,。從糞便樣本中復(fù)原了7個(gè)基因組,從含水層中復(fù)原了1個(gè)(被稱為ACD20),。16S rRNA和核糖體蛋白系統(tǒng)發(fā)育表明,,所有8個(gè)基因組都屬于一個(gè)新的候選門類,作者將其稱為Melainabacteria,。
Melainabacteria與藍(lán)藻關(guān)系密切但卻不同,,并編碼了許多同源蛋白,包括生理節(jié)奏調(diào)節(jié)因子以及罕見的表面蛋白,。然而,,與藍(lán)藻不同,Melainabacteria含有鞭毛但卻缺乏光合作用基因,,取而代之的是依靠厭氧發(fā)酵來生成能量。源自消化道的基因組比ACD20要小,,這暗示了一種適應(yīng)的基因組縮小,,但它們編碼了維生素生物合成路徑,這可能對(duì)宿主有益,。與消化道Melainabacteria形成對(duì)比的是,,ACD20包含有一整套固氮作用(nif)基因。有趣的是,,Melainabacteria固氮酶還原酶(nifH)與藍(lán)藻的nifH并不相同,,這意味著Melainabacteria和藍(lán)藻分別獨(dú)立進(jìn)化出固氮的能力。
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