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花開花落,，又是一年，是時(shí)候盤點(diǎn)一下新一代測序領(lǐng)域的新變化了,。自今年2月份以來,，測序儀并沒有太大的變化,，但也不是說一切都是老樣子。新的樣品制備儀器正揭開面紗,，而測序讀長更是逆了天,。

羅氏454

454生命科學(xué)曾在2013年宣布，計(jì)劃在2015年停止測序硬件的銷售,。據(jù)羅氏診斷的測序Susan Ulanowicz介紹,，該公司將支持其硬件直到2016年底，而不是之前報(bào)道的2016年年中,。

不過,，羅氏NimbleGen仍在開發(fā)NGS的樣品制備工具。1月,，它推出了SeqCap Epi序列富集系統(tǒng),，以捕獲甲基化的基因組DNA。zui近,，NimbleGen更推出了SeqCap RNA富集系統(tǒng),，利用寡核苷酸來富集特定部分的轉(zhuǎn)錄組。

據(jù)羅氏NimbleGen的營銷總監(jiān)Ji Wu介紹,，SeqCap RNA富集系統(tǒng)有三個(gè)版本可以選擇：lncRNA設(shè)計(jì)捕獲17.35 Mb,，代表32,808個(gè)lncRNA和TUCP轉(zhuǎn)錄異構(gòu)體,；以及兩個(gè)定制版本,，從低至10 ng總RNA中捕獲7 Mb至200 Mb的序列。“它降低了測序的成本,，并提高了發(fā)現(xiàn)和鑒定新穎外顯子,、剪接變體、突變和基因融合的能力,，”Wu談道,。

Illumina

Illumina負(fù)責(zé)測序系統(tǒng)的產(chǎn)品營銷Joel Fellis表示，Illumina在今年有一些測序試劑的更新,。

本月發(fā)售的HiSeq Rapid v2 Reagent Kit適用于HiSeq 2500,，它將快速運(yùn)行模式下的讀長提高至2 x 250 bp（雙端），能在60小時(shí)內(nèi)帶來300 Gb,。

HiSeq X HD v2 Reagent Kit也將在11月發(fā)布,。它讓研究人員能夠更快地制備測序文庫，而無需PCR擴(kuò)增,。Fellis表示：“為了獲得*的基因組組裝,，我們建議使用TruSeq DNA PCR-Free kit。因?yàn)樗鼛砹颂魬?zhàn)性區(qū)域的出色覆蓋,，比如那些GC含量高的區(qū)域,。”

7月，Illumina發(fā)布了TruSeq Synthetic Long-Read DNA Library Prep Kit，這是Illumina兩年前收購的Moleculo技術(shù)的商業(yè)化產(chǎn)品,，而之前僅作為服務(wù)提供,。Fellis解釋道，試劑盒通過計(jì)算的方式從Illumina短讀取技術(shù)中產(chǎn)生長讀取數(shù)據(jù),。這些信息將有助于染色體定相（phasing）和de novo組裝,。

NextSeq 500是Illumina在今年推出的新產(chǎn)品。Fellis表示,，明年上半年將發(fā)布試劑升級,。在zui近召開的美國人類遺傳學(xué)學(xué)會的會議上，科學(xué)家展示了新試劑為NextSeq 500帶來HiSeq水平的準(zhǔn)確性,。“比之前的試劑相比,，您將獲得更加準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)，”他說,。

Ion Torrent

Ion Torrent的Ion PGM™ 和Ion Proton™ 儀器如今歸在賽默飛世爾旗下,，zui近也有一些試劑升級。

賽默飛在第三季度發(fā)布了新的Hi-Q™ DNA聚合酶,，有望明顯減少插入缺失的錯(cuò)誤率,。據(jù)Ion Torrent的產(chǎn)品Andy Felton介紹，對于金黃色葡萄球菌,，插入缺失錯(cuò)誤率下降94%,，而大腸桿菌也下降80%。對于基因panel,，這要看情況而定,。Felton提到一個(gè)含有2300個(gè)PCR擴(kuò)增子的重測序panel，插入缺失錯(cuò)誤率大約下降43%,。目前,，適用于Ion PGM的Hi-Q已推出，而Ion Proton的配方應(yīng)該在2015年上半年推出,。

另一個(gè)新產(chǎn)品是Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit,，一個(gè)基于PCR的序列富集工具，能在每個(gè)反應(yīng)中捕獲并測序代表2萬個(gè)人類轉(zhuǎn)錄本的擴(kuò)增子,。這種試劑主要是面向轉(zhuǎn)錄本計(jì)數(shù),，而非異構(gòu)體分析。Felton表示：“我們認(rèn)為這是測定癌癥樣本中基因表達(dá)變化的一個(gè)偉大方式,，因?yàn)槟軌驈?0 ng FFPE DNA開始,。”

今年3月，賽默飛還推出了Ion Chef™,，一臺全自動的儀器,，能自動完成PGM和Proton的克隆擴(kuò)增和芯片上樣,。據(jù)Felton介紹，適用于Proton的PII芯片仍在開發(fā)之中,，預(yù)計(jì)產(chǎn)量在2億至3億個(gè)100-bp的讀取,，適合RNA-Seq等應(yīng)用。

Oxford Nanopore Technologies

多虧了MinION試用計(jì)劃（MAP）,，用戶終于可以將U盤大小的MinION測序儀拿回家了,。一些用戶已經(jīng)發(fā)表了他們的結(jié)果。沖繩縣工業(yè)技術(shù)中心的Alexander Mikheyev和Mandy Tin在8月發(fā)表文章,，稱這臺儀器的通量低,，錯(cuò)誤率高。

Oxford Nanopore并沒有對此事作出回應(yīng),。不過,，計(jì)算生物學(xué)家Keith Robison在其博客中寫道：“Mikheyev和Tin未能探索各種各樣的參數(shù)或關(guān)注MAP社區(qū)，而是匆匆趕制出這篇論文,，因此,，他們的分析有很大的缺陷。”

同時(shí),，Oxford Nanopore也在擴(kuò)大它的儀器產(chǎn)品線,。的成員是PromethION，一種平板大小的臺式測序儀,。它能夠在大量的納米孔中運(yùn)行少量樣品,，或在數(shù)千個(gè)納米孔傳感通道中平行運(yùn)行多個(gè)樣品。

Pacific Biosciences

上個(gè)月,，Pacific Biosciences宣布推出的試劑,，名為P6-C4（即第6代的聚合酶和第4代的試劑）,。這種新試劑可以將PacBio的平均讀長提高到10,000至15,000 bp,，zui長讀長甚至超過40,000 bp。

據(jù)介紹,，升級后每個(gè)SMRT Cell的有效數(shù)據(jù)產(chǎn)出量有望達(dá)到500M至1000M,。“通過每次儀器運(yùn)行時(shí)提供更大量的長讀取，新試劑讓用戶能夠更高質(zhì)量地組裝基因組,。”PacBio的長讀取技術(shù)在定位轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)和傳染病監(jiān)控等應(yīng)用上很受歡迎,。zui近，一些研究也證實(shí)了這項(xiàng)技術(shù)與de novo基因組組裝兼容,。

第三方工具

測序供應(yīng)商可不僅僅是那些生物試劑測序儀的廠家,。瑞士自動化公司Tecan在9月宣布推出Freedom EVO® NGS工作站，適用于Illumina和Ion Torrent的文庫制備,。據(jù)Tecan介紹,，F(xiàn)reedom EVO NGS工作站可為沒有任何經(jīng)驗(yàn)的用戶提供文庫制備,、核酸定量、qPCR體系構(gòu)建,，濃度均一化,，樣本匯集和捕獲等過程的自動化。

安捷倫科技公司的SureSelect靶向序列捕獲試劑盒一直挺受歡迎,。6月,，它宣布推出新的SureSelectQXT試劑盒，這是個(gè)革命性的NGS靶向序列捕獲方案,，能夠短短7小時(shí)內(nèi)從50 ng基因組DNA中產(chǎn)生測序即用的文庫,。

新一代測序已經(jīng)迎來了越來越多的觀眾，而他們對工具的需求也在推動儀器不斷發(fā)展,。因此,，如果明年有更多的新產(chǎn)品問世，請不要驚訝,。www.shxfkj.com elisa試劑盒,，進(jìn)口elisa試劑盒，國產(chǎn)elisa試劑盒,，elisa試劑盒價(jià)格,，農(nóng)殘檢測試劑盒，血清,，進(jìn)口血清 -上海信帆生物科技有限公司