分析病毒

艾默里大學生物學副教授Katia Koelle說,，SARS-CoV-2病毒變種的出現(xiàn)在對抗CO-VID-19的斗爭中增加了曲折,，表明需要對該病毒進行更好的基因組監(jiān)測,。

Koelle說：“改進的跨州SARS-CoV-2基因組監(jiān)測確實將幫助我們更好地了解引起大流行的病毒在美國的發(fā)展和傳播。”“需要更多的聯(lián)邦資金,，以及用于樣本收集和基因測序的集中標準,。研究人員需要訪問此類元數(shù)據，以便更好地跟蹤病毒在地理上的傳播方式,，并確定可能難以控制的任何新變種,，以便衛(wèi)生官員可以更快，更有效地做出反應。”

Koelle研究了病毒進化與病毒傳染病流行病學傳播之間的相互作用,。她是《觀點》文章的高級作者,，該文章剛剛發(fā)表在《科學》雜志上，有關SARS-CoV-2測序對控制CO-VID-19大流行的重要性,。

邁克爾·馬丁(Michael Martin)是埃默里(Emory)的人口,，生物學和生態(tài)計劃的博士研究生，也是科勒(Koelle)實驗室的成員,，是《科學》雜志的第-一作者,。大衛(wèi)·范因斯伯格(David VanInsberghe)是科勒實驗室的博士后研究員，是該書的合著者,。

馬丁說：“對SARS-CoV-2的研究一直以迅雷不及掩耳的速度進行,。”“這種加速為我們提供了迄今為止-快的針對疾病的大數(shù)據集之一。到目前為止,，我們已經學到了很多關于這種病毒如何傳播和適應的知識,，但是我們仍然有很多盲點需要解決。”

基因組是生物體的遺傳物質,。人類基因組由雙鏈DNA組成,，以四個不同的核苷酸堿基字母編碼。一個人類基因組由超過30億個堿基對組成,。相反,，包括SARS-CoV-2在內的冠狀病毒的基因組是由RNA組成的，RNA的結構比DNA更簡單,。例如,，SARS-CoV-2基因組由一條只有30,000個字母長的RNA鏈組成。排序是一種可以讀取這些字母的技術,。

本文總結了有關SARS-CoV-2的關鍵見解,，這些見解已通過從各個患者樣品中對其基因組進行測序而獲得。它還列舉了仍然存在的挑戰(zhàn),，包括將元數(shù)據收集和整合到遺傳分析中,，以及需要開發(fā)更有效和可擴展的計算方法以應用于成千上萬的基因組的需求。