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Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit
——文庫轉(zhuǎn)化率高達60%,，極其適用FFPE、cfDNA樣本
DNA 文庫構(gòu)建是NGS樣本制備的核心環(huán)節(jié),。文庫質(zhì)量直接影響測序數(shù)據(jù)質(zhì)量——如mapping rate、coverage、complexity、bias等,。要想獲得好的文庫，必須選擇好的建庫試劑盒,，而建庫試劑盒的關鍵,，在于其文庫轉(zhuǎn)化率，即DNA雙端接頭連接效率,，因為只有雙端連接成功的DNA,，才能夠被有效擴增zui終成為測序模板。
產(chǎn)品特點
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®,，采用高質(zhì)量的酶學組成,，改進型接頭連接技術，以及具有強擴增效率的高保真酶,，顯著提高文庫轉(zhuǎn)化率與擴增效率,，助理完成更好。
1. 文庫轉(zhuǎn)化效率高達60%
文庫轉(zhuǎn)化率,，即DNA樣本雙端接頭連接效率。只有雙端連接成功的DNA,，才能夠被有效擴增zui終成為測序模板,。
圖1 Agilent 2100 檢測350bp平末端DNA單端和雙端連接產(chǎn)物峰。
0：350bpDNA峰,、1：單端接頭連接產(chǎn)物峰,、2：雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測試基于各公司的標準 protocol進行,。
圖2 接頭連接效率百分比（%）,。
對圖1峰面積進行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的雙端連接效率可達60%。
2. 不同GC樣本,，擴增效率測試
Hieff NGS™ MaxUp II Kit中使用具有強擴增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫擴增,。以1 ng GC含量分別為38%、50%,、70%的400 bp DNA為起始樣本,，12 cycles擴增，Qubit檢測不同試劑盒所得產(chǎn)物濃度,，Super Canace表現(xiàn),。
表1 擴增模塊效率比較。
產(chǎn)品名稱 | GC 38% (ng) | GC 50% (ng) | GC 70% (ng) |
Super CanaceTM High-Fidelity Mix | 25.6 | 18 | 17.1 |
K*-HiFi mix | 15.8 | 16.7 | 21.1 |
3. FFPE,、cfDNA樣本, 文庫產(chǎn)量測試
Hieff NGS™ MaxUp II Kit以FFPE和cfDNA為起始樣本建庫,，相對同類型試劑盒品牌 K*,，在相同擴增循環(huán)數(shù)下，獲得更多文庫產(chǎn)量,。
表2 FFPE,、cfDNA樣本文庫產(chǎn)量比較。
樣本 | 100 ng FFPE | 5 ng cfDNA | ||
7 cycles (ng) | 10 cycles (ng) | 9 cycles (ng) | 12 cycles (ng) | |
MaxUP II | 400 | 2000 | 120 | 1200 |
K* 品牌 | 150 | 1100 | 100 | 1080 |
注：FFPE樣本來自小鼠肺蠟塊,，固定時間6個月,；cfDNA樣本來源于血漿。
4. 無偏好性的測序質(zhì)量
在不同GC含量樣本中,，使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測序數(shù)據(jù),。
表3 不同GC樣本測序數(shù)據(jù)
樣本 | Mapped Reads (%) | Coverage (%) | ||||
Average | 5× | 10× | 15× | 20× | ||
蠟狀芽孢桿菌（GC 34%） | 93.8 | 99.644 | 99.643 | 99.641 | 99.639 | 99.638 |
大腸桿菌（GC 51%） | 92.7 | 93.057 | 92.782 | 92.687 | 92.625 | 92.579 |
嗜鹽桿菌（GC 65%） | 94.2 | 99.598 | 99.028 | 98.391 | 97.885 | 97.419 |
蠟狀芽孢桿菌（GC 34%） 大腸桿菌（GC 51%） 嗜鹽桿菌（GC 65%）
圖3 不同GC含量樣本測序偏好性圖譜。
5. 2.5小時內(nèi)
表現(xiàn)如此,，使用起來也非常方便哦!
訂購信息
產(chǎn)品 | 貨號 | 規(guī)格 | 價格（元） |
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12200ES08/24/96 | 8/24/96libraries | 2456/6486/23567 |
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