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MaxUP II 建庫試劑盒

2017-10-23  閱讀(640)

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Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit

——文庫轉(zhuǎn)化率高達60%,,極其適用FFPE、cfDNA樣本

 

DNA 文庫構(gòu)建是NGS樣本制備的核心環(huán)節(jié),。文庫質(zhì)量直接影響測序數(shù)據(jù)質(zhì)量——如mapping ratecoveragecomplexitybias,。要想獲得好的文庫,必須選擇好的建庫試劑盒,,而建庫試劑盒的關鍵,,在于其文庫轉(zhuǎn)化率,即DNA雙端接頭連接效率,,因為只有雙端連接成功的DNA,,才能夠被有效擴增zui終成為測序模板。

產(chǎn)品特點

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®,,采用高質(zhì)量的酶學組成,,改進型接頭連接技術以及具有強擴增效率的高保真酶,,顯著提高文庫轉(zhuǎn)化率與擴增效率,,助理完成更好。

 

                   

 

 
  

1. 文庫轉(zhuǎn)化效率高達60%

文庫轉(zhuǎn)化率,,即DNA樣本雙端接頭連接效率。只有雙端連接成功的DNA,,才能夠被有效擴增zui終成為測序模板,。

1  Agilent  2100 檢測350bp平末端DNA單端和雙端連接產(chǎn)物峰。

 

0350bpDNA峰,、1:單端接頭連接產(chǎn)物峰,、2:雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測試基于各公司的標準 protocol進行,。

接頭連接效率百分比(%),。

 

對圖1峰面積進行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的雙端連接效率可達60%

2. 不同GC樣本,,擴增效率測試

Hieff NGS™ MaxUp II Kit中使用具有強擴增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫擴增,。以1 ng GC含量分別為38%50%,、70%400 bp DNA為起始樣本,,12 cycles擴增,Qubit檢測不同試劑盒所得產(chǎn)物濃度,,Super Canace表現(xiàn),。

 

1  擴增模塊效率比較。

 

產(chǎn)品名稱

GC 38% (ng)

GC 50% (ng)

GC 70% (ng)

Super CanaceTM High-Fidelity Mix

25.6

18

17.1

K*-HiFi mix

15.8

16.7

21.1

3. FFPE,、cfDNA樣本, 文庫產(chǎn)量測試

Hieff NGS™ MaxUp II KitFFPEcfDNA為起始樣本建庫,,相對同類型試劑盒品牌 K*,,在相同擴增循環(huán)數(shù)下,獲得更多文庫產(chǎn)量,。

 

FFPE,、cfDNA樣本文庫產(chǎn)量比較。

 

樣本

100 ng FFPE

5 ng cfDNA

7 cycles (ng)

10 cycles (ng)

9 cycles (ng)

12 cycles (ng)

MaxUP II

400

2000

120

1200

K* 品牌

150

1100

100

1080

注:FFPE樣本來自小鼠肺蠟塊,,固定時間6個月,;cfDNA樣本來源于血漿。

4. 無偏好性的測序質(zhì)量

在不同GC含量樣本中,,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測序數(shù)據(jù),。

 

不同GC樣本測序數(shù)據(jù)

 

樣本

Mapped Reads (%)

Coverage (%)

Average

5×

10×

15×

20×

蠟狀芽孢桿菌(GC 34%)

93.8

99.644

99.643

99.641

99.639

99.638

大腸桿菌(GC 51%)

92.7

93.057

92.782

92.687

92.625

92.579

嗜鹽桿菌(GC 65%)

94.2

99.598

99.028

98.391

97.885

97.419

 

                   蠟狀芽孢桿菌(GC 34%          大腸桿菌(GC 51%             嗜鹽桿菌(GC 65%

     

 

不同GC含量樣本測序偏好性圖譜。

5. 2.5小時內(nèi)

表現(xiàn)如此,,使用起來也非常方便哦!

   

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Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®

12200ES08/24/96

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2456/6486/23567

 

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