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多樣本直接PCR系列專題

2017-8-2  閱讀(1890)

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多樣本直接PCR系列專題

More Genotyping, Less Time and Fewer Reagents

PCR-based Genotyping等實驗,,常需純化樣本基因組。當(dāng)待測樣本較多時,,純化基因組的過程費時,、操作重復(fù),并且實驗成本高,。翊圣生物通過改造Taq DNA聚合酶,,優(yōu)化PCR反應(yīng)體系開發(fā)出無需基因組純化的Direct PCR Kit系列產(chǎn)品。

Clever PCR:Direct PCR

翊圣Direct PCR Kit是直接從樣本開始,,以未經(jīng)基因組純化的微量原始樣本(圖1-A)或其裂解產(chǎn)物(圖1-B)作為模板,,進行PCR-based Genotyping(見圖1)。與常規(guī)PCR-based Genotyping相比,,Direct PCR Kit樣本用量少,操作簡單,,實驗成本低,,可高通量化樣本檢測。

 

圖1 Direct PCR技術(shù) A. 直接法:取少量樣本直接加入到PCR Master Mix中,,進行PCR鑒定,。B. 裂解法:樣本取樣后,加入裂解液中,,裂解釋放基因組,,取少量裂解上清液加入到PCR Master Mix中,進行PCR鑒定,。

技術(shù)優(yōu)勢

★直接:無需進行費時而昂貴的DNA純化

★快速:10min完成模板制備,,zui少50min完成PCR反應(yīng)

★簡便:樣品無需剪碎或研磨即可完成裂解

        PCR Mix為預(yù)混液形式,減少加樣步驟

★節(jié)?。?/span>材料用量少

★高通量:可在96孔板中完成裂解反應(yīng)

 

 

 

 

 

翊圣生物Direct PCR Kit

產(chǎn)品參數(shù)

Animal Tissue Direct PCR Kit

Mouse Tissue Direct PCR Kit

Plant Tissue Direct PCR kit

Animal Blood Dicrect PCR Kit

適用生物

小鼠,、兔子,、鳥類、淡水魚,、果蠅,、線蟲

小鼠,、大鼠

水稻,、玉米、煙草,、油菜,、小麥、大豆等

人血,、鼠血,、雞血、鳥血,、牛血,、狗血

適用組織/材料類型

腦、心臟,、肝臟,、胰臟、腎臟,、脾臟,、睪丸、肌肉,、羽毛末端

鼠尾,、鼠耳、腳趾(帶肌肉)和其他臟器

嫩葉,、老葉,、幼苗嫩莖

EDTA,、Heparin抗凝全血,、血液的采集卡、冷凍血和抗凝血等

樣品使用量

5-10mg

5-10mg

3-5mg(5-7mm),,1-2mg(2-3mm)

人血2-45%,;鼠血2-20%;采集卡1-4mm

基因組釋放時間

10-30min

10-30min

10min或無需專門裂解過程

無需專門裂解過程

PCR產(chǎn)物zui適長度

<1kb

PCR產(chǎn)物是否加A

裂解反應(yīng)體系加A效率不定

50µL體系,,裂解產(chǎn)物使用量

0.5-5µL

0.5-5µL

5-10µL

人血2-45%,;鼠血2-20%;采集卡1-4mm

應(yīng)用

轉(zhuǎn)基因鑒定,、基因分型等

轉(zhuǎn)基因鑒定,、基因分型等

轉(zhuǎn)基因鑒定,、基因分型等

基因型病原微生物鑒定

Direct PCR Kit實驗過程

本系列產(chǎn)品運用*的蛋白酶裂解體系,,裂解樣品,,裂解液可直接作為模板,搭配試劑盒中的PCR Master Mix進行基因擴增,。

 

圖2 動物,、小鼠組織直接PCR實驗過程

 

圖3 動物全血直接PCR實驗過程

 

圖4 植物組織直接PCR實驗過程

產(chǎn)品優(yōu)勢

Ø 改造的Taq DNA Polymerase是Direct PCR的保證:*的抑制物耐受性

對于非純化樣本作為模板時,會引入很多對PCR反應(yīng)有抑制的成分,。以普通的PCR反應(yīng)體系和Taq DNA聚合酶較難得到理想的結(jié)果,,甚至無法進行PCR擴增。本系列試劑盒中PCR Mix為配方優(yōu)化預(yù)混液,,采用改造的Taq DNA Polymerase,,增加與模板DNA結(jié)合能力,對于常見PCR抑制劑具有更高的耐受性,,因此具有更廣泛的模板適應(yīng)性,。

 

圖5 直接PCR Kit中的PCR Mix具有更高的雜質(zhì)耐受度。相同模板量,,用不同的PCR Mix進行PCR,,同時在體系中加入不同濃度的各種PCR反應(yīng)抑制物。比較不同條件下的PCR產(chǎn)物量,。

 

 

 

 

 

 

翊圣生物針對不同樣本,,開發(fā)出一系列產(chǎn)品

,、多動物通用型Animal Tissue Direct PCR Kit

Ø zui快速:操作時間短

 

圖6 翊圣動物組織直接PCR試劑盒更加節(jié)省時間,。

Ø  實驗例:基因敲除小鼠基因型鑒定

 

圖7 動物組織直接PCR試劑盒檢測基因敲除動物組織直擴結(jié)果。M:100bp DNA ladder,。1-8:以裂解產(chǎn)物為模板,。+:以50ng純化基因組DNA為模板。:以去離子水為模板,。循環(huán)數(shù):35個循環(huán)。單條帶(580bp):敲除動物純合子基因組,。單條帶(180bp):野生型基因組,。兩條帶(580bp/180bp):敲除動物雜合子基因組。

二,、嚙齒類型:Mouse Tissue Direct PCR Kit

Ø 更快速:基因釋放充分

 

圖8 小鼠組織直接PCR試劑盒不同裂解時間直擴結(jié)果,。M:100bp DNA ladder。+:以50 ng純化基因組DNA為模板,。循環(huán)數(shù):35個循環(huán),。

 

 

 

Ø 更*:基因釋放充分

1,、優(yōu)于常規(guī)堿裂解方法

 

圖9 鼠尾經(jīng)不同裂解方式處理后,直擴結(jié)果,。檢測基因:SOX21,。M:100 bp DNA ladder。1-2:以常規(guī)堿裂解方式處理裂解產(chǎn)物為模板,。3-4:以小鼠組織直接PCR試劑盒裂解產(chǎn)物為模板,。+:以50 ng純化基因組DNA為模板。:以去離子水為模板,。循環(huán)數(shù):35個循環(huán),。

2、媲美同類產(chǎn)品

 

圖10 鼠尾經(jīng)不同品牌同類產(chǎn)品裂解處理后,,直擴結(jié)果,。檢測基因:SOX21。M :100 bp DNA ladder,。+ :以50 ng純化基因組DNA為模板,。循環(huán)數(shù):35個循環(huán)。

 

三,、多動物通用型:Animal Blood Direct PCR Kit

Ø zui大模板耐受度:高達45%

 

圖11 不同體積的EDTA抗凝人血加入量,,動物血液直接PCR試劑盒直擴結(jié)果。檢測基因:SOX2,。M:DNA Marker I,。循環(huán)數(shù):30個循環(huán)。

 

 

 

四,、植物類型:Plant Tissue Direct PCR Kit

Ø 多類型植物樣本驗證

 

圖12 不同類型植物葉片直擴結(jié)果,。M:100 bp DNA ladder。C:相應(yīng)植物純化基因組DNA為模板,。1-2:葉片組織裂解產(chǎn)物為模板,。循環(huán)數(shù):30個循環(huán)。

客戶實驗

1,、轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定

 

 

圖13青島大學(xué)用戶使用鼠尾直接PCR試劑盒擴增某基因結(jié)果,。M:DNA marker II。1-12:轉(zhuǎn)基因小鼠鼠尾裂解液,。13:陽性質(zhì)粒對照,。:以去離子水為模板。循環(huán)數(shù):30個循環(huán),。

2,、水稻基因直擴

 

圖14 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)用戶使用植物直接PCR試劑盒擴增水稻相關(guān)基因

 

訂購信息

產(chǎn)品貨號

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

價格(元)

10180ES50

Animal Tissue Direct PCR Kit 動物組織直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10180ES70

200 T

1236.00

10181ES50

Mouse Tissue Direct PCR Kit 小鼠組織直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10181ES70

200 T

1236.00

10182ES50

Animal Blood Direct PCR Kit 全血直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10182ES70

200 T

1236.00

10183ES50

Plant Tissue PCR Kit 植物組織直接PCR試劑盒

50 T

326.00

10183ES70

200 T

1236.00

 

 

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