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漲知識(shí) | 克隆專題一:不同分子克隆方法介紹(上)
克隆是英文“clone"或“cloning"的音譯,而英文“clone"則起源于希臘文“Klone",原意是指以幼苗或嫩枝插條。1963年J.B.S.Haldane在題為“人類種族在未來(lái)二萬(wàn)年的生物可能性"的演講上采用“克?。–lone)"的術(shù)語(yǔ),,把“克隆技術(shù)"帶到了人們的視野中,。
克隆技術(shù)又稱為“生物放大技術(shù)",,目前應(yīng)用泛的技術(shù)為“分子克隆",又稱重組DNA技術(shù),,即通過(guò)重組技術(shù)將目的DNA片段按照人們的設(shè)計(jì)定向連接起來(lái),,在特定的受體細(xì)胞中與載體同時(shí)復(fù)制并得到表達(dá),產(chǎn)生新的遺傳性狀的技術(shù),。
隨著分子生物學(xué)研究的不斷深入,,分子克隆技術(shù)也隨之更新迭代,從傳統(tǒng)的依賴限制性內(nèi)切酶的方法發(fā)展到如今的TA克隆,、TOPO克隆,、無(wú)縫克隆、Gateway技術(shù)等等,,新的技術(shù)不斷涌現(xiàn),,為分子生物學(xué)的發(fā)展和進(jìn)化提供新的力量。今天小翌就帶領(lǐng)大家認(rèn)識(shí)一下不同的分子克隆方法,。
傳統(tǒng)分子克隆技術(shù)的依賴于限制性內(nèi)切酶和酶切位點(diǎn),。主要步驟是通過(guò)限制性內(nèi)切酶(翌圣的FuniCut™快速限制性內(nèi)切酶Cat#15001ES-15051ES)酶切載體和目的基因,通過(guò)連接酶(翌圣T4 DNA連接酶Cat#10300)將酶切的片段拼接在一起(即連接過(guò)程),,形成可以表達(dá)目的基因的新載體(即重組質(zhì)粒),,使用轉(zhuǎn)化技術(shù)轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞中,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)目的基因的擴(kuò)增,、轉(zhuǎn)錄和翻譯,。
傳統(tǒng)分子克隆實(shí)驗(yàn)流程如下圖:
圖1.傳統(tǒng)分子克隆實(shí)驗(yàn)流程
該技術(shù)最早由Cohen Group在1973年實(shí)現(xiàn),他們將E.coli的tetr質(zhì)粒psclol和nersrR6-3質(zhì)粒體外限制酶切割,,連接成新的質(zhì)粒,,轉(zhuǎn)化E.coli,,在含四環(huán)素和新霉素的平板上篩選出了terrNer,實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌遺傳性狀的轉(zhuǎn)移,。傳統(tǒng)分子克隆技術(shù)較為成熟,,但是該方法受到限制性酶切位點(diǎn)和連接效率等方面的限制,并不能高效,、準(zhǔn)確的克隆需要的目的基因,。
圖2. Stanley Cohen和Herbert Boyer(第一個(gè)成功實(shí)現(xiàn)基因工程技術(shù)的團(tuán)隊(duì))
圖3. TA克隆流程示意圖【3】
圖4. TOPO克隆原理
圖5. TOPO TA/Blunt克隆試劑盒輕松連接2 kb(10 ng)平末端/粘性末端片段
注:A&B:TOPO克隆轉(zhuǎn)化平板。C&D:插入片段PCR鑒定電泳圖,。
圖6.同源重組原理
Gibson Assembly:包含T5 exonuclease,、Phusion DNA polymerase和Taq DNA Ligase三種酶,通過(guò)5’→3’ T5核酸外切酶活性,,沿著5’→3’方向降解dsDNA,,產(chǎn)生3’黏性末端,通過(guò)同源臂互補(bǔ)配對(duì),,退火后借助Phusion DNA聚合酶修復(fù)片段上的缺口,,Taq DNA連接酶催化片段形成磷酸二酯鍵,將所有缺口補(bǔ)齊,,獲得重組片段,。
圖7. Gibson Assembly原理圖【5】
圖8. In-Fusion Cloning原理【6】
產(chǎn)品定位 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號(hào) | 規(guī)格 |
通用緩沖液,5min完成精準(zhǔn)酶切 | FuniCut™快速限制性內(nèi)切酶 | 15001ES-15051ES | 50 T |
常規(guī)PCR | 2×Hieff® PCR Master Mix(With Dye) | 10102ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
常規(guī)PCR,,不含染料 | 2×Hieff® PCR Master Mix(No Dye) | 10103ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
快速PCR,,快至1s/kb | 2×Hieff® Ultra-Rapid HotStart PCR Master Mix(with Dye) | 10157ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
TOPO克隆-兼容TA/平末端 | Hieff Clone® Universal Zero TOPO TA/Blunt Cloning Kit | 10906ES20 | 20 T |
TOPO克隆-TA末端 | Hieff Clone® Zero TOPO-TA Cloning Kit 零背景TOPO-TA克隆試劑盒 | 10907ES20 | 20 T |
TOPO克隆-平末端 | Hieff Clone® Zero TOPO-Blunt Cloning Kit | 10909ES20 | 20 T |
單片段一步克隆,已發(fā)文章累計(jì)IF達(dá)到1000+ | Hieff Clone® Plus One Step Cloning Kit一步法快速克隆試劑盒 | 10911ES20/50 | 20 T/50 T |
1-6片段一步克隆,,最快5分鐘完成重組反應(yīng) | Hieff Clone® Universal One Step Cloning Kit通用型一步法快速克隆試劑盒 | 10922ES20/50 | 20 T/50 T |
參考文獻(xiàn)
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4.Seki T, Seki M, Onodera R, et al. Cloning of cDNA encoding a novel mouse DNA topoisomerase III (Topo IIIbeta) possessing negatively supercoiled DNA relaxing activity, whose message is highly expressed in the testis[J]. J Biol Chem, 1998, 273 (44): 28553-28556.
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