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組織/細胞RNA提取指南,,擺脫選擇綜合征,!
核糖核酸(RNA),存在于生物細胞以及部分病毒,、類病毒中的遺傳信息載體,。RNA的堿基主要有4種,即A(腺嘌呤),、G(鳥嘌呤),、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),,其中,,U(尿嘧啶)取代了DNA中的T(胸腺嘧啶)。核糖核酸在體內的作用主要是引導蛋白質的合成,。
圖1.DNA和RNA的結構
人體一個細胞含RNA約10pg(含DNA約7pg),。在細胞中,根據結構功能的不同,,RNA主要分三類,,即tRNA(轉運RNA),rRNA(核糖體RNA),,mRNA(信使RNA),。mRNA含量低,,占細胞總RNA的1%~5%。核糖體RNA特點含量高,,占細胞總RNA的80%~85%,。
表1:RNA的結構和功能
隨著高通量組學技術的應用,在高等哺乳動物中已發(fā)現高達數十萬種非編碼RNA,根據結構與功能可對其進行科學分類和系統(tǒng)命名,,如tRNA,、rRNA、snRNA,、snoRNA、siRNA、miRNA,、piRNA和lncRNA等。非編碼RNA是當今生命科學發(fā)展最為迅速的前沿領域之一,,它不斷更新人們對生命本質的認識,,為生物遺傳育種及人類重大疾病的干預、防治和藥物研究等提供全新的思路與技術(Amaral et al,,2008),。
圖2.非編碼RNA的生物學功能(Cell. 2019 Nov 14; 179(5): 1033–1055.)
RNA研究的第一步為RNA提取,高質量的RNA是進行轉錄組測序,、RT-PCR等試驗的基礎,,然而由于RNA單鏈結構的不穩(wěn)定性和無處不在的RNA酶,使得RNA在提取過程中容易發(fā)生降解,,同時,,傳統(tǒng)的RNA提取方法毒性大,因此,,提取出高質量的RNA,,選擇合適的提取產品非常重要!
對于常規(guī)的新鮮或凍存的組織,、貼壁細胞,、懸浮細胞RNA提取,我們MolPure® Cell/Tissue Total RNA Kit 細胞/組織總RNA提取試劑盒19221ES,,適用于10-20 mg動物組織或(1-5)×106個動物細胞的總RNA提取純化,。
RNA純度高:配有基因組DNA吸附柱,可有效去除DNA污染,;
安 全:無需有毒的酚,、氯仿等有機物抽提;
快速簡便:無需異丙醇或乙醇沉淀操,,操作過程30 min完成,;
使用方便:全流程室溫操作,,無需冰浴和低溫離心。
取106個雜交瘤細胞,,分別使用19221和TRIzol(貨號:10606ES)提取總RNA,。之后測定濃度和瓊脂糖凝膠電泳;同時取2 μL,,使用Hifair® Ⅲ One Step RT-qPCR SYBR Green Kit(貨號:11143ES)進行定量測試小鼠GAPDH,。結果顯示,MolPure® Cell/Tissue RNA Kit能穩(wěn)定提取RNA,,RNA產量高,,完整度較好。
圖 2.RNA 質量和濃度
圖3.一步法反轉錄定量結果 (注:綠色為 19221,,藍色為 Trizol)
老師們可能會疑問為什么不Trizol或Trizol相關的產品呢,?因為TRIzol有它固有的缺點:
有難聞的刺鼻氣味
提取過程用到的酚、氯仿都為有毒有機物
提取時間長
如果老師們從成本的角度考慮,,我們也有性能優(yōu)異的Trizol提取產品,。
MolPure® TRIeasy Plus Total RNA Kit總 RNA 提取試劑盒(帶離心柱)19211ES是利用MolPure® RNA Column A1和改進的異硫氰酸胍/酚一步法(TRIzol法)來提取樣品中的總RNA,適用于TRIzol法所能提取的所有樣本,,包括各種動植物,、細菌和細胞樣品。該試劑盒方便快捷,,1 h完成可完成操作,,且不需要異丙醇沉淀和乙醇洗滌過程。
適用范圍廣:可通用動物,、植物,、細菌、細胞等樣品
使用方便:“TRIzol+離心柱"形式,,易于操作
快速簡便:操作過程1 h完成
圖 4.RNA 質量和濃度
TRIeasy™ Total RNA Extraction Reagent TRIeasy™ 總RNA提取試劑 10606ES是一種適用于各種動植物、細菌組織,、細胞的總RNA抽提試劑,,具有的裂解能力,并有效抑制樣本中RNA的降解,保持RNA的完整性,。
TRIeasy™ LS Total RNA Extraction Reagent 液體總RNA提取試劑(同TRIzol LS)19201ES是一種適用于各種動植物,、酵母、細菌等液體樣本的總RNA抽提試劑,,具有的裂解能力,,并有效抑制樣本中RNA的降解,保持RNA的完整性,。
MolPure® Cell/Tissue miRNA Kit細胞/組織miRNA提取試劑盒 19331ES適用于TRIzol法所能提取的所有樣本,,包括各種動植物、細菌組織和培養(yǎng)細胞中總RNA,、miRNA和其他各種小RNA的提取,。該試劑盒可選擇提取包含miRNA的總RNA,,或只針對microRNA富集,,不包含>200 nt其它RNA,30min可完成單樣本的提取,。