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TaqMan探針法qPCR原理及其主要應(yīng)用

2021-11-12  閱讀(4840)

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TaqMan探針法qPCR原理及其主要應(yīng)用


實(shí)時(shí)熒光定量PCR(簡(jiǎn)稱qPCR)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光化學(xué)物質(zhì),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物并進(jìn)行定量分析的方法,。根據(jù)所用熒光化學(xué)物質(zhì)的不同,,qPCR可分為熒光染料法(SYBR Green Ⅰ法為代表)和熒光探針法(TaqMan法為代表)。
SYBR Green Ⅰ染料法因具有使用簡(jiǎn)便,價(jià)格便宜等優(yōu)點(diǎn)而被廣泛使用。但其最大的缺點(diǎn)是缺乏特異性,,即染料可以與任何dsDNA結(jié)合。因此,,qPCR反應(yīng)中有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的出現(xiàn)會(huì)增加熒光值,,影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性,而TaqMan探針法的出現(xiàn)很好地解決了染料法非特異性的問題,。下面,,我們一起來了解一下TaqMan探針法qPCR的基本原理及其主要應(yīng)用。

PART 01

TaqMan探針法qPCR原理



TaqMan探針法qPCR是使用TaqMan熒光探針進(jìn)行熒光檢測(cè)的方法,。其基本原理是PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,,該探針兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。開始時(shí),,探針完整地結(jié)合在DNA任意一條單鏈上,,報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收,檢測(cè)不到熒光信號(hào),;PCR擴(kuò)增時(shí),,Taq酶的5'-3'核酸外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,,從而發(fā)出熒光,切割的熒光分子數(shù)與PCR產(chǎn)物的數(shù)量成正比,,因此,,通過檢測(cè)PCR反應(yīng)體系中的熒光強(qiáng)度可以達(dá)到檢測(cè)PCR產(chǎn)物擴(kuò)增量的目的


圖.TaqMan水解探針作用機(jī)理圖.jpg
圖. TaqMan水解探針作用機(jī)理圖




PART 02

TaqMan探針法qPCR優(yōu)點(diǎn)




 1   特異性高,、定量準(zhǔn)確


從原理可以看出,,熒光探針只與目的序列結(jié)合,理論上探針法的熒光信號(hào)只來源于目的序列,,即不受非特異性產(chǎn)物的影響,,因此,TaqMan探針法qPCR的特異性非常高,,定量準(zhǔn)確,。



 2   實(shí)驗(yàn)耗時(shí)短

因探針法qPCR的高特異性,故無需再設(shè)置熔解曲線檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性如何,,大大縮短了實(shí)驗(yàn)時(shí)間,。


 3   兼容多重反應(yīng)

不同波長(zhǎng)的熒光報(bào)告基團(tuán)可以標(biāo)記不同的探針,因此可以在同一個(gè)反應(yīng)體系中利用不同熒光標(biāo)記的探針同時(shí)檢測(cè)多個(gè)靶標(biāo),,達(dá)到節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本的目的,。



PART 03

TaqMan探針法qPCR主要應(yīng)用


正是由于上述優(yōu)點(diǎn),,TaqMan探針法qPCR已被廣泛地應(yīng)用于科學(xué)研究和生產(chǎn)實(shí)踐之中。有基礎(chǔ)生物學(xué)研究,、食品檢測(cè),、醫(yī)學(xué)檢測(cè)與診斷等,尤其是在醫(yī)學(xué)檢測(cè)和診斷方面得到了大力地推廣。因此本文重點(diǎn)介紹其在醫(yī)學(xué)檢測(cè)與診斷方面的應(yīng)用,。


 1   核酸定量分析

Taqman qPCR技術(shù)可對(duì)傳染性疾病進(jìn)行定量定性分析,,包括病原微生物或病毒含量的檢測(cè),轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)的檢測(cè),,RNAi基因失活率的檢測(cè)等,。

 2   基因表達(dá)差異分析


在現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)的許多研究領(lǐng)域,從基礎(chǔ)科學(xué)研究到藥物研究的實(shí)際應(yīng)用,,檢測(cè)基因表達(dá)情況都是基本的也是很重要的工作,。Taqman qPCR技術(shù)可比較經(jīng)過不同處理(如藥物處理、物理處理,、化學(xué)處理等)樣本之間特定基因的表達(dá)差異,,特定基因在不同時(shí)相的表達(dá)差異。


 3   基因型/等位基因分析

單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是由DNA序列中同一個(gè)位置上的堿基對(duì)的常見替換造成的個(gè)體DNA序列差異,。SNP在人類基因組中數(shù)量較多,,發(fā)生頻率較高,檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性對(duì)于研究個(gè)體對(duì)不同疾病的易感性或者個(gè)體對(duì)特定藥物的不同反應(yīng)有著重要的意義,。


與傳統(tǒng)基因型分析方法相比,,Taqman qPCR技術(shù)具有高效率,低交叉污染等多方面優(yōu)勢(shì),,已成為SNP分型應(yīng)用中方法之一,。


 4   藥物開發(fā)研究


在新藥的開發(fā)過程中,快速了解藥物對(duì)疾病進(jìn)程的影響可以為新藥開發(fā)節(jié)約大量的人力,、時(shí)間和資金,。
與以前所用的Elisa等方法相比TaqMan qPCR技術(shù)可以快速,、準(zhǔn)確,、靈敏地測(cè)定血液或組織中病原體的含量,為比較不同配方的療效,、用藥量,、用藥時(shí)間等提供快速準(zhǔn)確的評(píng)價(jià),。


 5   無創(chuàng)產(chǎn)前檢查


到目前為止,,人們對(duì)遺傳性物質(zhì)改變引起的遺傳性疾病還無法治療,只能通過產(chǎn)前診斷,,減少病嬰出生,,以防止各類遺傳性疾病的發(fā)生,。
例如為減少X連鎖遺傳病患兒的出生,可從孕婦的外周血中分離胎兒DNA,,TaqMan qPCR檢測(cè)其Y性別決定區(qū)基因,。此外還可以通過TaqMan qPCR對(duì)孕婦弓形蟲,梅毒等進(jìn)行檢測(cè),,這對(duì)找出不明原因流產(chǎn)和習(xí)慣性流產(chǎn)的病因提供有力的幫助,,大大提高優(yōu)生優(yōu)育。


 6   腫瘤基因檢測(cè)

盡管腫瘤發(fā)病的機(jī)理尚未清楚,,但相關(guān)基因發(fā)生突變是致癌性轉(zhuǎn)變的根本原因已被廣泛接受,。癌基因的表達(dá)增加和突變,在許多腫瘤早期就可以出現(xiàn),。


TaqMan qPCR是一種有效的腫瘤前期檢測(cè)及伴隨診斷技術(shù),,涵蓋癌癥惡性腫瘤的預(yù)防及治療。不但能有效地檢測(cè)到基因的突變,,而且可以準(zhǔn)確檢測(cè)癌基因的表達(dá)量,。


目前用此方法已進(jìn)行過端粒酶hTERT基因、慢性粒細(xì)胞性白血病WT1基因,、腫瘤ER基因,、前列腺癌PSM基因、腫瘤相關(guān)的病毒基因等多種基因的表達(dá)檢測(cè),。




 7   病原體檢測(cè)

Taqman qPCR可以對(duì)多種病原體(如人類乳頭瘤病毒,、人類免疫缺陷病毒、肝炎病毒,、流感病毒及非洲豬瘟病毒)進(jìn)行定量測(cè)定,。該技術(shù)對(duì)病原體的檢測(cè)解決了免疫學(xué)檢測(cè)的“窗口期"問題,可判斷疾病是否處于隱性或亞臨床狀態(tài),,適用于傳染病早期的大規(guī)模確診


Taqman qPCR還可對(duì)病毒分型,,例如可以鑒定特殊的HPV型別以及變異株,,并對(duì)其進(jìn)行針對(duì)性的處理,更有效預(yù)防宮頸癌,。
此外,,Taqman qPCR還可確定病毒載量。在抗病藥物治療監(jiān)測(cè)的過程中,,病毒載量是判斷藥物療效的重要指標(biāo),。如HIV的藥物載量測(cè)定需通過Taqman qPCR技術(shù)來測(cè)定血液中HIV RNA的量,通過藥物載量的高低變化可幫助判斷HIV藥物效果,。




PART 04

翌圣生物Taqman qPCR Mix在非洲豬瘟病毒檢測(cè)的應(yīng)用



非洲豬瘟是由非洲豬瘟病毒(ASFV)感染家豬或野豬引起的一種急性,、烈性,、高度接觸性傳染病其發(fā)病率和死亡率可達(dá)100%,,嚴(yán)重危害著全球養(yǎng)豬業(yè),,造成難以估量的經(jīng)濟(jì)損失。

目前非洲豬瘟沒有疫苗和有效的治療手段,,qPCR法是OIE推薦使用的非洲豬瘟常規(guī)診斷的重要工具,,也是中國在現(xiàn)階段非洲豬瘟流行情況下的檢測(cè)技術(shù)


翌圣生物作為深耕于上游生命科學(xué)領(lǐng)域酶制劑的供應(yīng)商,,長(zhǎng)期為IVD企業(yè)提供高品質(zhì),、高性價(jià)比的原料(含可凍干原料),積極應(yīng)對(duì)非洲豬瘟疫情,,助力非洲豬瘟高效檢測(cè),。




Hieff Unicon® Universal TaqMan multiplex qPCR master mixCat#11211)
2×Mix預(yù)混合試劑,含有基因改造的抗體法熱啟動(dòng)Taq酶及深度優(yōu)化的多重反應(yīng)緩沖體系,,可極大地提高擴(kuò)增靈敏度和特異性,。

產(chǎn)品特點(diǎn):

 優(yōu)異的擴(kuò)增靈敏度 3 copies/反應(yīng)可穩(wěn)定檢出

 超強(qiáng)的存儲(chǔ)穩(wěn)定性4℃、25℃,、37℃放置7天,,反復(fù)凍融50次均性能穩(wěn)定

 精密度高:CV<1%

 多平臺(tái)適用:適用于市售各種熒光定量PCR儀

 支持多重檢測(cè):每孔反應(yīng)至多可檢測(cè)4-5個(gè)靶標(biāo)

部分性能展示:

超高靈敏度,3 copies/反應(yīng)穩(wěn)定檢出


圖. 使用ASFV引物探針,,對(duì)ASFV質(zhì)粒(終體系3 copies)進(jìn)行20個(gè)復(fù)孔的檢測(cè),比較各個(gè)品牌試劑的檢出率,,可以看到Y(jié)easen qPCR mix的檢出率更高。




PART 05

產(chǎn)品信息




產(chǎn)品類型

產(chǎn)品描述

產(chǎn)品名稱

貨號(hào)

探針法qPCR試劑

超高靈敏度

Hieff Unicon® Universal TaqMan multiplex qPCR master mix

11211ES

全預(yù)混穩(wěn)定性優(yōu)化版(含UDG)

Hieff Unicon® C55P1 TaqMan Multiplex qPCR Master Mix (UDG plus)

13171ES

高GC含量擴(kuò)增子擴(kuò)增

Hieff Unicon® TaqMan multiplex qPCR master mix

11208ES

可凍干試劑盒

Hieff Unicon Lyo-TaqMan Multiplex qPCR Kit

13695ES



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