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——提取效果媲美進口M*品牌
20世紀80年代中期前,微生物學家通過人工培養(yǎng)的方法研究土壤微生物生態(tài)系統(tǒng),而可培養(yǎng)的微生物不到總數(shù)的1%,,相當多的微生物還未被認知。隨著宏基因組學的快速發(fā)展,,通過提取土壤微生物總DNA來研究生態(tài)系統(tǒng)的方法開始出現(xiàn),。然而,,土壤是一個非常復雜的異質體系,,其中,,含有的腐植酸及腐植酸類似物、酚類化合物,、重金屬離子等,,在DNA提取過程中如不能有效去除,將直接影響后續(xù)的PCR擴增,、核酸雜交,、內切酶消化等分子操作,。
為了解決這一難題,,翌圣研發(fā)了一款采用陶瓷珠和二氧化硅顆粒混合而成的玻璃珠進行樣本處理的土壤DNA提取試劑盒—MolPure® Soil DNA Kit,,可有效處理真細菌孢子和內生孢子,,革蘭氏陽性細菌,,酵母,藻類,,線蟲和真菌等土壤中的各類微生物,。該試劑盒的離心吸附柱中采用的硅基質材料為*新型材料,配合*的裂解液配方可快速回收高純度核酸,。提取的DNA純度高,,質量穩(wěn)定可靠,可適用于各種下游應用實驗,,如酶切,、PCR等實驗。
◆ 操作便捷:室溫操作,,僅需40min即可回收DNA,。
◆ 產量高:*的玻璃珠能高效裂解土壤微生物,釋放更多DNA,,最大限度地提取其產量,。
◆ 適用范圍廣:適合花壇土、花盆土,、農田土,、山林土、淤泥,、黑土等各類型土壤,。
◆ 純度高:有效去除土壤中腐殖酸、重金屬離子等雜質,,并與離心柱法純化相結合,,大大地提高了DNA的純度。
圖1. 土壤DNA提取操作流程圖
◆ 提取效果媲美進口M*品牌
圖2. 瓊脂糖電泳檢測大腸桿菌16s rDNA的擴增條帶,。Y為翌圣品牌,,M*為進口品牌,陽性對照為培養(yǎng)的大腸桿菌gDNA,,Y1/Y2和M1/M2為1μL洗脫液,,M3/M4為M1/M2稀釋3倍后的洗脫液。
◆ 比進口O*品牌操作簡單,,節(jié)約30min
圖3. Yeasen土壤DNA提取試劑盒和O*品牌同類型產品操作步驟對比圖,。Yeasen土壤DNA提取試劑盒比O*品牌同類型產品步驟省3步,并且提取速度節(jié)約30min,。
◆ Q1:試劑盒是如何進行破壁的,?
A:MolPure® Soil DNA Kit采用*的裂解液和珠磨法進行破壁,可有效處理真細菌孢子和內生孢子,,革蘭氏陽性細菌,,酵母,,藻類,線蟲和真菌等土壤中的各類微生物,。
◆ Q2:如何解決DNA電泳拖尾嚴重呢,?
A:1、可能原因一:土壤中含有豐富小型生物和易裂解的細菌,。這些易裂解的小型生物和細菌在玻璃珠長時間渦旋中會造成DNA降解。
解決方案:可通過減少渦旋時間,,或者用高能量的珠磨儀代替手工渦旋,。高能量的珠磨儀能提供非常高的能量,在短時間就可以達到破壁效果,,能減少DNA的降解,。
2、可能原因二:樣品中存在某些化學物質,,或者樣品在貯藏過程中發(fā)生降解,。
解決方案:針對不同的樣品,采用合適的貯藏條件進行保存,,以防止微生物DNA的降解,。
◆ Q3:該方法可以獲得所有微生物的DNA嗎?
A:不一定,。土壤樣品中含有大量的微生物,,有細菌和真菌,以及其他植物根系,,小型生物,。某些真菌,特別孢子類真菌,,因帶有非常厚的細胞壁,,無法破壁而導致DNA的丟失。因此,,可加強破壁的強度和時間來提取這些難提取的DNA,。
◆ Q4:哪些因素會影響DNA的產量呢?
A:土壤樣品中所含的微生物的種類,,微生物的數(shù)量,,以及土壤樣品中的有機,無機鹽都會直接影響到DNA的產量,。
◆ Q5:哪些事項需要注意,?
A:注意事項如下:
1) 土壤DNA產量主要來源樣品內微生物、植物動物殘渣,,冰凍或貯存過程中DNA會發(fā)生不同程度的降解,,導致DNA含量降低或條帶成較嚴重的涂抹狀(即降解),。因此,,盡量使用新鮮樣品或貯存時間較短樣品進行DNA提取,。
2) 如果土壤樣品中的水分含量比較多,建議先將水分離心去除后再進行提取,。
3) 不要省略空柱子離心步驟,,該步驟能除去柱子中殘留的乙醇,否則可能會影響下游實驗,;如產物點電泳時無法正常沉降,,絕大部分情況下由于空甩不*,乙醇殘留所致,,可在下次提取中,,提高離心機速度或延長空甩時間至5~10min,可解決殘留問題,。
產品名稱 | 產品編碼 | 規(guī)格 | 價格(元) |
MolPure® Soil DNA Kit 土壤DNA提取試劑盒 | 18815ES50 | 50T | 1353.00 |
實驗類型 | 產品名稱 | 產品編碼 |
PCR實驗 | Hieff Canace® Gold高保真DNA聚合酶 | 10148ES60/76 |
2×Hieff Canace® Gold高保真酶預混液 | 10149ES03/08 | |
電泳實驗 | YeaRed核酸染料(10,000× 水溶液) | 10202ES76 |
qPCR實驗 | Hieff UNICON® Universal Blue qPCR SYBR Green Master Mix | 11184ES08 |
克隆實驗 | Hieff Clone®一步法快速克隆試劑盒 | 10911ES20 |
Top⑩化學感受態(tài)細胞 | 11801ES80/92 | |
DH5α化學感受態(tài)細胞 | 11802ES80/92 |
HB210817