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MaxUpII DNA Library Prep Kit

2020-4-15  閱讀(181)

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MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®

——建庫試劑盒中的王

1,、產(chǎn)品概述
Hieff NGS® MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®,,可用于NGS測(cè)序中DNA樣本文庫構(gòu)建,,采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,改進(jìn)型接頭連接技術(shù),,以及具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的高保真酶,,顯著提高文庫轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率,Input DNA范圍為500 pg-1 μg,,適用包含cfDNA,、FFPE在內(nèi)的所有樣本進(jìn)行文庫構(gòu)建,產(chǎn)品可以應(yīng)用于全基因組測(cè)序,、靶向捕獲測(cè)序,、Chip-seq等測(cè)序方法中。

2,、產(chǎn)品特點(diǎn)
≥ 適用樣本類型廣:包含cfDNA,、FFPE在內(nèi)的所有樣本均能獲得優(yōu)異文庫和測(cè)序質(zhì)量
≥ 應(yīng)用范圍廣:產(chǎn)品可應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序,、Chip-seq等等
≥ 高品質(zhì)酶學(xué)組成:業(yè)界領(lǐng)現(xiàn)的接頭連接效率,,高達(dá)60%、超高保真性和*擴(kuò)增效率
≥ 品質(zhì)穩(wěn)定:嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控

3,、操作流程
精簡(jiǎn)的操作步驟,,2-2.5小時(shí)快速建庫


4、產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1)文庫轉(zhuǎn)化效率高達(dá)60%

圖1  Agilent  2100 檢測(cè)350bp平末端DNA//片段單端和雙端連接產(chǎn)物峰
 

0:350bpDNA//片段峰,、1:?jiǎn)味私宇^連接產(chǎn)物峰,、2:雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測(cè)試基于各公司的標(biāo)準(zhǔn) protocol進(jìn)行,。

圖2 接頭連接效率百分比(%),。

對(duì)圖1峰面積進(jìn)行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的雙端連接效率可達(dá)60%


2)擴(kuò)增效率高,兼容不同GC含量樣本
使用具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫擴(kuò)增,,效率更高,。

產(chǎn)品名稱GC 38% (ng)GC 50% (ng)GC 70% (ng)
Super Canace® High-Fidelity Mix25.61817.1
K*-HiFi mix15.816.721.1

1 ng GC含量分別為38%,、50%、70%的400 bp DNA//片段為起始樣本,,12 cycles擴(kuò)增。

3)文庫產(chǎn)量高

樣本100 ng FFPE5 ng cfDNA
7 cycles (ng)10 cycles (ng)9 cycles (ng)12 cycles (ng)
MaxUP II40020001201200
K* 品牌15011001001080

以FFPE和cfDNA為起始樣本建庫,,相對(duì)同類型試劑盒品牌 K*,,在相同擴(kuò)增循環(huán)數(shù)下,獲得更多文庫產(chǎn)量,。

4)數(shù)據(jù)無偏好性
在不同GC含量樣本中,,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測(cè)序數(shù)據(jù)。

樣本Mapped Reads (%)Coverage (%)
Average10×15×20×
蠟狀芽孢桿菌(GC 34%)93.899.64499.64399.64199.63999.638
大腸桿菌(GC 51%)92.793.05792.78292.68792.62592.579
嗜鹽桿菌(GC 65%)94.299.59899.02898.39197.88597.419

                                                 

                                           圖3不同GC含量樣本測(cè)序偏好性圖譜


5,、客戶反饋

5.1建庫產(chǎn)量高
1)杭州某生物公司邁*
洗相同條件下對(duì)比實(shí)驗(yàn),,脫體積32 μL,對(duì)比文庫產(chǎn)量,,翊圣MaxUpII文庫產(chǎn)量比K*文庫產(chǎn)量更高

 MaxUp IIK* Hyper
Input DNA50 ng25 ng10 ng50 ng25 ng10 ng
循環(huán)數(shù) (cycles)79137913
文庫濃度 (ng/µL)15.423.858.28.7613.552.4





圖4 對(duì)比文庫質(zhì)量峰圖,,翊圣MaxUpII文庫主峰單一,大小與目的片段的大小一致,,K*品牌建庫試劑盒出現(xiàn)多峰的現(xiàn)象

2)北京某基因技術(shù)有限公司中*
gDNA樣本(NA12878),,平行實(shí)驗(yàn)中,翊圣建庫試劑盒MaxUpII與K*品牌對(duì)比,,文庫質(zhì)量和產(chǎn)量基本一致,,在捕獲建庫中能兼容不同的捕獲試劑!


5.2文庫對(duì)應(yīng)測(cè)序更為準(zhǔn)確

1)上海某醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所渥*


                           圖5 K*品牌與翊圣MaxUpII建庫試劑盒測(cè)序數(shù)據(jù)對(duì)比柱狀圖


訂購(gòu)信息

產(chǎn)品貨號(hào)規(guī)格價(jià)格(元)
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®12200ES08/24/968/24/96libraries2456/6486/23567


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