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雙判定標(biāo)準(zhǔn)判定qPCR擴增特異性,提升Ct值真實性

2020-4-9  閱讀(816)

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qPCR實驗易做,但數(shù)據(jù)分析并非想象中的那么容易,!數(shù)據(jù)分析的好與壞,,極大程度上依賴于qPCR原始結(jié)果的質(zhì)量。

qPCR結(jié)果的評價指標(biāo)


•溶解曲線,,是qPCR結(jié)果判定的第—要素,。它的作用是判定目的基因是否得到擴增。理論上,,當(dāng)反應(yīng)體系中僅是目標(biāo)基因的擴增,,才是有效擴增。
•標(biāo)準(zhǔn)曲線,,是qPCR結(jié)果判定的金標(biāo)準(zhǔn),。(在溶解曲線判定為特異性擴增后)它的作用是測定引物的擴增效率及試劑的檢測上下限。根據(jù)文章發(fā)表對于qPCR數(shù)據(jù)的要求,,擴增效率應(yīng)在90-110%,。
•擴增曲線,是直接生成qPCR定量的數(shù)據(jù),,即Ct值,。從試劑對比角度而言,Ct值大小常被用于判定試劑擴增效率的高低,。

產(chǎn)品描述


Hieff Unicon® Power qPCR SYBR Green Master Mix,,這是一款旨在解決諸多qPCR實驗常見疑難問題的qPCR試劑:
•它減少了大量引物驗證的預(yù)實驗工作,是一款具備強引物兼容性的Mix,,
•它明確了qPCR溶解曲線峰型的標(biāo)準(zhǔn)——“單峰的形狀”,,對于“什么溶解曲線是好的溶解曲線”的解讀具有參考意義,
•它讓時間不再碎片化,,1次體系配制,,24 h時間自由支配

產(chǎn)品特點


□引物兼容性強:針對遵循qPCR引物設(shè)計原則設(shè)計的引物,使用Hieff Unicon® Power 引物使用率可達97%,;
□模板加入量靈活:可檢測10-107個拷貝個數(shù)的基因片段,;
□特異性高:標(biāo)準(zhǔn)溶解曲線峰型,有效避免“胖”峰,、“多”峰的出現(xiàn);
□穩(wěn)定性強:產(chǎn)品經(jīng)50次反復(fù)凍融驗證,,擴增性能無變化,;
□操作靈活:配制好的qPCR反應(yīng)液4℃保存24 h,擴增性能無變化,;
□擴增時間短:每個擴增循環(huán)中,退火、延伸一步完成,,用時15 sec,。

產(chǎn)品性能展示


1. 超高特異性,簡化了qPCR實驗的引物設(shè)計


圖1. Hieff® Unicon Power預(yù)混液實現(xiàn)了引物的高特異性擴增  以293T細胞cDNA為模板,,利用Prime5軟件設(shè)計200bp擴增長度的片段(GC含量:30%-70%)的引物共1000對,,隨機挑選88對,使用Hieff Unicon® Power預(yù)混液測定引物的擴增特異性,。通過溶解曲線分析,,88個檢測片段中有86個(97.7%)目標(biāo)片段有效擴增,說明Hieff Unicon® Power預(yù)混液引物兼容性強,,具備高特異性擴增,、高檢出率的特點。

2. 超高特異性,,保證了Ct值的真實性

圖2. Hieff® Unicon Power預(yù)混液擴增高度特異,,Ct值結(jié)果可信度高  以1 ng人gDNA為模板,使用不同品牌預(yù)混液按照標(biāo)準(zhǔn)擴增程序,,擴增5個目的基因片段,,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析擴增產(chǎn)物情況。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液針對不同靶標(biāo)基因均可以高特異性擴增,,得到可信的靶標(biāo)片段Ct值,。

3. 檢測范圍寬廣,模板添加不再糾結(jié)
    
圖3. Hieff® Unicon Power預(yù)混液可有效檢測6個數(shù)量級范圍的模板量  以質(zhì)粒DNA為模板,,10倍梯度稀釋(107-101 拷貝/μl),,擴增IL23R基因。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液擴增特異,,線性相關(guān)性高,,可在寬廣的定量區(qū)域內(nèi)獲得良好的線性關(guān)系。

4. 良好的穩(wěn)定性,,讓體系配制更加靈活:
 

凍融次數(shù)0次10次30次50次
Ct均值22.9722.8722.9922.84
△Ct--0.090.02-0.12

 

4℃保存時間0 h24 h48 h72 h
Ct均值22.8322.8923.0523.16
△Ct-0.060.220.33


圖4. Hieff® Unicon Power預(yù)混液及其配制體系穩(wěn)定性俱佳  以1 ng 人gDNA為模板,,使用Hieff Unicon® Power預(yù)混液在不同凍融次數(shù)或體系配制后4℃放置不同時間條件下,檢測TFRC基因擴增情況,。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液經(jīng)50次反復(fù)凍融或體系配制后4℃保存24h,,擴增性能無變化(溶解曲線圖數(shù)據(jù)未做展示)。

5. 兼容快速程序與標(biāo)準(zhǔn)程序:
 

 30%GC-1號30%GC-2號50%GC-1號50%GC-2號70%GC-1號70%GC-2號
標(biāo)準(zhǔn)程序23.422.7923.7923.5223.2323.60
快速程序23.2923.0423.823.5723.4823.52
△Ct0.110.250.010.050.150.08


標(biāo)準(zhǔn)程序                                                快速程序

95℃         5 min                                       95℃         30 sec   
95℃         10 sec                                     95℃         10 sec
60℃         30 sec     40 Cycles                  60℃         15 sec    40 Cycles

圖6. Hieff® Unicon Power預(yù)混液讓擴增時間大大縮短 以1 ng人gDNA為模板,,擴增不同GC基因片段(30-70%),,比較Hieff Unicon® Power預(yù)混液在標(biāo)準(zhǔn)程序和快速程序下的擴增效果。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液可兼容快速擴增程序和標(biāo)準(zhǔn)擴增程序,,使用快速程序可縮短擴增時間,。

常見問題


Q:如何選擇產(chǎn)品,?
A:

產(chǎn)品名稱貨號特異性擴增效率靈敏度性價比
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix11195ES★★★★★★★★★☆★★★☆☆★★★☆☆
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix 11198ES★★★★☆★★★★☆★★★★☆★★★★☆
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix11201ES★★★★☆★★★★★★★★☆☆★★★★★


Q:Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix產(chǎn)品可應(yīng)用于哪些實驗?
A:可用于對特異性要求比較高或較難實現(xiàn)特異性擴增的基因片段,。這款產(chǎn)品極大程度上避免了引物二聚體,、非特異性擴增的出現(xiàn),特別適合于引物中有單個堿基不同的擴增,。

Q:建議的模板加入量,?
A:20 μL反應(yīng)體系,未經(jīng)稀釋的cDNA加入量建議不超過2 μL,。

Q:試劑如何儲存及保質(zhì)期,?
A:建議-20℃保存,有效期1年,。

訂購信息

產(chǎn)品名稱貨號規(guī)格價格(元)*(元)
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,,No Rox)11195ES085ml1653.00663.00
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,Low Rox)11196ES085ml1653.00663.00
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,,High Rox)11197ES085ml1653.00663.00


相關(guān)產(chǎn)品

 

產(chǎn)品名稱貨號規(guī)格價格(元)*(元)
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus)11123ES60100T955.00 
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox )11201ES085 ml740.00498.00
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox Plus)11202ES085 ml740.00498.00
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix (High Rox Plus)11203ES085 ml740.00498.00

HB190306

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