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蛋白質(zhì)組學(xué)研究系列儀器及軟件

閱讀:7027      發(fā)布時間:2012-2-3
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蛋白質(zhì)組學(xué)研究系列儀器及軟件

               人體內(nèi)真正發(fā)揮作用的是蛋白質(zhì),,蛋白質(zhì)扮演著構(gòu)筑生命大廈的磚塊角色,,隨著破譯生命密碼的人類基因組計(jì)劃進(jìn)入尾聲,一個以蛋白質(zhì)和藥物基因?qū)W為研究重點(diǎn)的后基因組時代已經(jīng)拉開序幕,,蛋白質(zhì)將是今后的重點(diǎn)研究方向之一,。然而,蛋白質(zhì)的分離和鑒定非常費(fèi)時,,目前測定蛋白質(zhì)的技術(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于破譯基因組的工具,,的實(shí)驗(yàn)室每天只能分離和識別出100種蛋白質(zhì)。據(jù)估計(jì),,人體內(nèi)可能有幾十萬種蛋白質(zhì),,這大概需要10年時間進(jìn)行識別

為了加快蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)程,,以專業(yè)生產(chǎn)蛋白質(zhì)組學(xué)研究設(shè)備而著稱的美國Genomic Solution Inc.公司開發(fā)了完整的蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案,,由一系列機(jī)械手臂與軟件,并結(jié)合了二維電泳實(shí)驗(yàn)設(shè)備與質(zhì)譜儀,,可以進(jìn)行,、自動化且具重復(fù)性的試驗(yàn)分析。在Genomic solution值得信賴的技術(shù)平臺上,,你的研究工作將更富成效,,重復(fù)性更好,。在這一整套Investigator平臺上,,各儀器之間配合無隙,由于它的整合性及標(biāo)準(zhǔn)性,,使得研究進(jìn)程大大加快,,原來需要9—12個月才能獲得數(shù)據(jù)結(jié)果發(fā)表的時間減少到9—12周。這套完整的系統(tǒng)具備蛋白質(zhì)組研究所需的眾多功能:2-D電泳,、圖像獲取,、2-D膠分析、蛋白樣品切割,、蛋白消化,、MALDI樣品準(zhǔn)備、消化及點(diǎn)樣、數(shù)據(jù)分析整合,,再加上制備好的膠,、試劑及附件,使研究工作可以立即展開,。此套設(shè)備為進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)研究的利器,大大加速了蛋白質(zhì)分離和鑒定的速度,。該系統(tǒng)主要由以下幾部分組成:
一、2-D電泳系統(tǒng)(Investigator™ 2-D Electophoresis System)
該系統(tǒng)主要進(jìn)行2D
PAGE
*向等電聚焦凝膠電泳和第二向SDS-PAGE電泳,,設(shè)備包括2-D電泳系統(tǒng)所需的各種設(shè)備,,如pHaser™(IPG膠條電泳)、管狀制膠設(shè)備,、二維電泳裝置,、電源設(shè)備、半導(dǎo)體冷卻器及各種相關(guān)的蛋白純化試劑盒,。
產(chǎn)品特征:
*
提供2D PAGE電泳所需的各種設(shè)備,,使電泳更加簡便,大大節(jié)約研究時間
*
高分辨率:有效的*向等電聚焦凝膠電泳和23cm X
23cm
第二向SDS-PAGE大面積板膠提供清晰的電泳圖像,,有效提高單體,、磷酸化和糖基化蛋白的分離
*
大容量:可同時容納151mm一維管狀膠,或82-3mm管狀膠,;10IPG膠條和10塊二維電泳板膠
*
靈活性:該系統(tǒng)用于管狀膠,、IPG 膠條、預(yù)制膠,、自制膠和SDS PAGE膠使用
*
恒溫:的半導(dǎo)體制冷裝置電泳體系溫度恒定,,溫度變化< 0.5℃
*
專門為高分辨率2D PAGE而設(shè)計(jì)的電源系統(tǒng)
*
提供超純的相關(guān)化學(xué)試劑和藥品

二、蛋白凝膠成像系統(tǒng)(Investigator™ ProImage)
ProImage
專業(yè)的蛋白凝膠成像系統(tǒng)提供高靈敏度,、高分辨率的大面積蛋白凝膠成像和分析,。
產(chǎn)品特征:
*
高靈敏度,高分辨率數(shù)字成像系統(tǒng)
* 12 bit
CCD數(shù)碼相機(jī)系統(tǒng),,大大提高圖像信噪比
*
提供白光和紫外光源,可對銀染,、熒光、膠片,、考馬斯亮藍(lán),、EB染色圖像進(jìn)行數(shù)字化
*
可以配合HT PC Analyzer蛋白質(zhì)組學(xué)分析軟件進(jìn)行各種圖像分析
*
多用途暗箱,無任何光線泄漏,,免除實(shí)驗(yàn)室的暗房設(shè)備
*
對高靈敏蛋白熒光染色劑SYPRO® Ruby染色圖像進(jìn)行優(yōu)化
*
光照均勻,,大成像面積達(dá)25 x 28 cm

三、蛋白質(zhì)點(diǎn)自動切取機(jī)器人平臺(Investigator™ ProPic Workstation)
Investigator™ ProPic
工作站主要用于2-D蛋白凝膠上蛋白質(zhì)點(diǎn)的自動切取,,可對考馬斯亮藍(lán),、銀染,、熒光染色的蛋白凝膠進(jìn)行操作,廣泛應(yīng)用于制藥公司,、大學(xué)和重點(diǎn)研究所等進(jìn)行高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究的單位,。Investigator ProPic是*個將2-D凝膠成像分析和蛋白質(zhì)點(diǎn)自動切取兩個功能整合在一起的機(jī)器人工作站,主要為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的后續(xù)分析采集和提供樣品,,該產(chǎn)品*在同類產(chǎn)品中高,。


產(chǎn)品組成:
*
硬件部分:密閉暗箱及帶有XYZ機(jī)器人手臂,具有100mm的切割精度,,內(nèi)置可換光源(白光和紫外光源),,能容納896微孔樣品板的樣品盤,并裝配Gilson泵系統(tǒng)和12位高分辨率冷CCD數(shù)碼相機(jī)的成像系統(tǒng),。凝膠成像和蛋白質(zhì)點(diǎn)切取功能的整合,,使得成像后凝膠不必移動而原位切取,避免移動過程中產(chǎn)生的位移和污染,;切取結(jié)束后,,可再次原位成像,檢查切取結(jié)果性,;可對操作過程實(shí)時監(jiān)控,。切取速度達(dá)120/小時;全封閉的操作環(huán)境,,有效防止角蛋白污染,;超聲水浴清洗和泵沖洗兩種方式清洗槍頭,有效防止樣品交叉污染,;污染小化,。內(nèi)置水合裝置,有效避免操作過程中因凝膠變干而影響切取性和樣品回收率,。
*
軟件: HT Investigator PC Analyzer and
Database,
能進(jìn)行高通量的蛋白凝膠圖像分析,,功能強(qiáng)大,處理量大;專業(yè)軟件ProPic能自動控制數(shù)碼相機(jī)曝光和切割機(jī)器人的采樣操作,;可由軟件分析自動生成蛋白質(zhì)點(diǎn)切取列表,,亦可通過手動的point-click模式生成切取列表,在8小時的操作周期內(nèi)無需專人管理,,自動化,,結(jié)果可靠,。操作系統(tǒng):Microsoft
Windows 98/NT
,。

四、蛋白凝膠圖像分析專業(yè)軟件(Investigator™ HT PC Analyzer)
該軟件適用于大規(guī)模,、高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室,,能快速處理2-D蛋白電泳凝膠圖像,,能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)點(diǎn)進(jìn)行自動識別、定量和比較,;軟件功能強(qiáng)大,、界面友好,容易使用,。
產(chǎn)品特征:
*
能自動識別,、定量和比較2-D蛋白凝膠圖像;
*
自動計(jì)算2-D凝膠上蛋白質(zhì)點(diǎn)的分子量和pI值;
*
能自動生成蛋白表達(dá)量變化曲線或柱形圖
*
自動化,、批處理和強(qiáng)大的編輯功能大大加快研究進(jìn)程
*
通過創(chuàng)建True Average Gels克服樣品和試驗(yàn)誤差
*
能進(jìn)行半自動或全自動蛋白質(zhì)點(diǎn)匹配,,不需用戶提供標(biāo)記
*
可對多塊相應(yīng)凝膠上的蛋白質(zhì)點(diǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行T-檢驗(yàn)或其它統(tǒng)計(jì)分析;
*
數(shù)據(jù)可以傳送給Investigator ProPic™自動工作站進(jìn)行蛋白質(zhì)點(diǎn)自動切割;
*
帶有HT PC 數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),可以方便進(jìn)行蛋白研究的數(shù)據(jù)查詢和數(shù)據(jù)管理;

五,、自動化蛋白酶解工作站(Investigator™ ProGest)
Investigator ProGest
自動化蛋白酶解工作站是進(jìn)行全自動蛋白酶解的佳選擇,,適合于從2DSDS-PAGE膠上切取膠塊的自動化酶解。通過觸摸式顯示屏界面方便地進(jìn)行反應(yīng)程序的設(shè)定,,從而實(shí)現(xiàn)酶解過程中的自動清洗,,加酶和恒溫孵育步驟循環(huán),。
產(chǎn)品特征:
*
進(jìn)行自動化、高通量的蛋白斑點(diǎn)酶解
*
自動化操作和溫控反應(yīng)系統(tǒng)節(jié)約反應(yīng)時間,提高反應(yīng)效率,,微處理器控制酶解反應(yīng)條件
*
內(nèi)置加熱平臺
*
Flow-through技術(shù),提高反應(yīng)效率
*
能夠同時進(jìn)行96個樣品反應(yīng),每輪反應(yīng)時間為6.5小時
*
自動控制酶解反應(yīng)循環(huán)時間,,每天可進(jìn)行兩輪反應(yīng)
*
氮?dú)庹龎?,超凈環(huán)境

六、自動化MALDI點(diǎn)樣工作站(Investigator™ ProMS MALDI Spotting Workstation)
Investigator™ ProMS
系統(tǒng)用于蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析前的樣品濃縮,、脫鹽和MALDI點(diǎn)樣,點(diǎn)樣的多肽可以進(jìn)行后續(xù)的質(zhì)譜分析,,ProMS適用于大多數(shù)商業(yè)化的MALDI target
產(chǎn)品特征:
*
軟件操作方便,,可根據(jù)用戶需要進(jìn)行定制,,應(yīng)用靈活,可遠(yuǎn)程控制,,高通量,。
*
溶液反應(yīng)體系可對反應(yīng)控制,多肽的反向洗脫增加檢測靈敏度,。
*
提供正壓的干凈空氣
*
可以使用ZipTips™或類似產(chǎn)品
* 96
孔規(guī)格
*
單泵分裝
*
低流速(20 µl/min)增加純化效率

七,、自動化蛋白質(zhì)酶解點(diǎn)樣工作站(Investigator™ ProPrep Workstation)
Investigator™ ProPrep Workstation
將能夠自動完成凝膠蛋白質(zhì)點(diǎn)酶解及酶解后樣品的濃縮,脫鹽和MALDI點(diǎn)樣等一系列過程,,通過4個樣品針頭同時操作使得實(shí)驗(yàn)結(jié)果和自動化,。該儀器簡化了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的繁瑣步驟,大大加快了研究的實(shí)驗(yàn)進(jìn)程,。酶解后的樣品適用于多種后續(xù)分析,,包括LC(液相色譜)和CE(毛細(xì)管電泳),,尤其適用于質(zhì)譜分析,如MALDI
TOF
MS/MS,。該系統(tǒng)的酶解和MALDI點(diǎn)樣兩個操作過程可以分開單獨(dú)進(jìn)行,,也可以整合成一個完整的過程進(jìn)行自動化操作。
產(chǎn)品特征:
*
多功能:同時具有自動化蛋白質(zhì)酶解和MALDI點(diǎn)樣功能
*
高通量:酶解樣品處理能力達(dá)1536/天或更多,;MALDI點(diǎn)樣速度因方法和介質(zhì)不同而不同
*
無污染:*的反應(yīng)槽設(shè)計(jì)有效地防止樣品交叉污染,,HEPA濾過的干凈操作環(huán)境,有效防止角蛋白污染,;自動化操作減少了手動接觸污染
*
靈活性:提供4*968*96的樣品盤滿足不同通量的需求
*
操作方便:Window
2000
系統(tǒng)和15寸平面液晶顯示屏使得操作更舒適方便,;軟件操作簡單,PC內(nèi)置軟驅(qū)和CD-ROM10/100M網(wǎng)卡,使數(shù)據(jù)交換和共享更容易,。
*
靈敏度達(dá)125 fmol

八,、RADARS/MS™快速數(shù)據(jù)管理和檢索系統(tǒng)(Rapid Data Archival and Retrieval System )
作為Genomic Solutions Inc.公司旗艦產(chǎn)品的RADARS/MS™快速數(shù)據(jù)管理和檢索軟件系統(tǒng),是一個完整的蛋白質(zhì)組學(xué)研究智能平臺,。它整合了客戶機(jī)/服務(wù)器,,數(shù)據(jù)庫和外聯(lián)網(wǎng)(extranet)應(yīng)用軟件,可以方便地進(jìn)行蛋白質(zhì)的分析鑒定和傳輸,。它提供目前快,、可信和完整的蛋白鑒定解決方案。通過RADARS/MS系統(tǒng)可以方便分析的蛋白質(zhì)組學(xué)研究數(shù)據(jù),,快速發(fā)現(xiàn)和確認(rèn)藥靶及疾病標(biāo)志物,,尤其適合于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心、重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和制藥公司,。
特點(diǎn):
*
能自動化分析質(zhì)譜數(shù)據(jù)
*
蛋白序列和質(zhì)譜數(shù)據(jù)自動對應(yīng)
*
快速分析蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)
*
蛋白組研究的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和分析結(jié)果能進(jìn)行快速數(shù)據(jù)庫儲存
*
MSMS/MS結(jié)果數(shù)據(jù)能進(jìn)行快速自動化的數(shù)據(jù)庫查詢和蛋白鑒定
*
提供清晰,、有效的結(jié)果可視化和注釋工具

Genomic Solution Inc.系列儀器及軟件為蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供了完整的解決方案,大大加快了研究進(jìn)程,,提高了實(shí)驗(yàn)效率,。該系統(tǒng)非常靈活,用戶可以根據(jù)自己現(xiàn)有的設(shè)備情況,,有選擇性地配備Genomic Solution Inc.系列儀器及軟件,,形成適合自己的一整套完整蛋白組學(xué)研究系統(tǒng)。

 

 

 

 

 

 

 

 

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