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線粒體測序技術幫助對個體患病風險的理解
閱讀:955 發(fā)布時間:2016-11-11線粒體是人類細胞將糖轉化成能量的重要工廠,。西奈山伊坎醫(yī)學院的科學家們開發(fā)了一種新測序技術,可以幫助人們理解線粒體基因對個體患病風險的影響,,比如糖尿病,、心臟病和癌癥。這項研究發(fā)表在近期的Nucleic Acids Research雜志上,。
在年齡,、體重和壞習慣(比如吸煙)相同的人中,有些會生病有些卻不會,。研究者們一直對這一點感到迷惑,,并嘗試通過飲食和核基因來確定個體的患病風險。但這樣的分析遺漏了線粒體基因(mtDNA)的差異,,mtDNA遺傳自我們的母親,,每個細胞都有這樣的DNA。
近年來研究表明,,線粒體發(fā)生錯誤會引起嚴重的疾病,。然而由于mtDNA的異質性很大,分析mtDNA變異對個體疾病風險的影響非常復雜,。
這項研究展示了*可以準確鑒定mtDNA異質性的測序技術,,Mseek。細胞里的mtDNA含量很少,,過去這方面一直沒有什么進展,。人們意識到了mtDNA的異質性,但卻無法再單細胞水平上建立決定性的理論,。
“研究者們一直在尋找能夠準確測序mtDNA的低成本方法,,”西奈山伊坎醫(yī)學院的助理教授Ravi Sachidanandam博士說。“現(xiàn)在我們做到了這一點,。Mseek可以鑒定線粒體中的功能紊亂,,使mtDNA成為了有用的生物學指標。此外,,人們還可以將mtDNA作為潛在的靶標,,治療癌癥和多種遺傳疾病。”
據(jù)Dr. Sachidanandam介紹,新測序技術達到了的靈敏性,、特異性和測序深度,,能夠得到高純度的mtDNA,檢測不同版本的mtDNA或mtDNA變體,。
Mseek主要是利用酶清除細胞核DNA,,只留下線粒體DNA進行測序。研究人員將Mseek用于多個細胞系,,鑒定了不同細胞樣本中的mtDNA“指紋”,。他們還通過追蹤mtDNA變體發(fā)現(xiàn),mtDNA異質性在單細胞水平上是穩(wěn)定維持的,。
“我們曾經(jīng)推測,,異質性可以通過細胞間的mtDNA交換穩(wěn)定下來,”Sachidanandam說,。“結果顯示,,mtDNA交換的確可行,,異質性能夠通過這一機制維持穩(wěn)定,。這一技術為人們提供了一個新平臺,可以研究正常和疾病狀態(tài)下mtDNA異質性特征,。未來也許可以利用交換機制進行治療,,將壞mtDNA換成好mtDNA。”