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滬鼎教您如何拯救危在旦夕的犀牛
閱讀：719 發(fā)布時(shí)間：2018-7-30 清晨的陽(yáng)光是寧?kù)o淡雅的,，沒(méi)有那種喧鬧氣息,，讓人感到心平氣和,、心曠神怡，我就感受到過(guò)那種意境,。您有這種感覺(jué)嗎,？
滬鼎報(bào)道：犀牛是一種體型龐大的動(dòng)物，在動(dòng)物園中經(jīng)?？梢钥匆?jiàn),。不過(guò),，也許你還不知道，由于犀牛角貿(mào)易引發(fā)的盜獵活動(dòng),，以及棲息地的嚴(yán)重破壞,，所有犀牛都面臨著滅絕的危險(xiǎn)。目前,，研究人員正在完成犀?；蚪M的組裝，以解讀犀牛的進(jìn)化關(guān)系和生物學(xué),，希望能拯救這些瀕危的動(dòng)物,。
在近日召開(kāi)的動(dòng)植物基因組大會(huì)上，自然歷史博物館介紹了他們?yōu)槿齻€(gè)犀牛物種建立參考基因組的工作,，這三個(gè)物種分別是黑犀牛（Diceros bicornis）,、蘇門答臘犀牛（Dicerorhinus sumatrensis）和已滅絕的披毛犀（Coelodonta antiquitatis）。
據(jù)介紹,，目前犀?？七€有五個(gè)種的活犀牛，大約起源于3000萬(wàn)至4000萬(wàn)年前,。這些犀牛正在頻臨滅絕,，例如，北非白犀?，F(xiàn)在只有三頭,，全部被圈養(yǎng)。南方白犀牛則由于大量的保護(hù)工作而有所改善,。
在黑犀牛測(cè)序項(xiàng)目中,，研究者利用Illumina HiSeq X和HiSeq 2500測(cè)序系統(tǒng)了數(shù)據(jù)，并利用一些不同的策略進(jìn)行de novo組裝,。在不斷改善基因組后,，他們計(jì)劃對(duì)另外20只黑犀牛的基因組進(jìn)行重測(cè)序，以便了解黑犀牛的多樣性,、局部適應(yīng)等,。
蘇門答臘犀牛因數(shù)量銳減也引起人們的關(guān)注，目前僅剩50-100頭,。與其他團(tuán)隊(duì)合作,，Dalén的團(tuán)隊(duì)利用HiSeq 2500系統(tǒng)對(duì)一只雄性的蘇門答臘犀牛的基因組DNA進(jìn)行測(cè)序，并利用三種方法開(kāi)展基因組組裝,。
研究人員已經(jīng)開(kāi)始對(duì)犀?；蚪M進(jìn)行一些初步的群體分析。他們計(jì)劃對(duì)20頭蘇門答臘犀牛的基因組以及一些歷史樣本進(jìn)行重測(cè)序，以便梳理遺傳變異的改變,，為未來(lái)的保護(hù)工作提供信息,。
此外，研究者還對(duì)28,500年前的披毛犀基因組進(jìn)行了測(cè)序,，平均覆蓋度大約為3倍,。之前的研究表明，蘇門答臘犀牛是披毛犀的近親,。研究人員認(rèn)為,，有披毛犀的基因組在手，他們應(yīng)該能更好地了解滅絕的時(shí)間以及現(xiàn)有犀牛物種的分歧時(shí)間,。
從所有犀牛物種中產(chǎn)生完整的基因組序列,，是探索犀牛科的進(jìn)化關(guān)系的先決條件,。此外,，提供參考基因組將讓未來(lái)的項(xiàng)目成為可能，他們有望開(kāi)發(fā)出遺傳監(jiān)測(cè)的標(biāo)志物,，評(píng)估群體基因組結(jié)構(gòu)和局部適應(yīng),。
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