SYBR Green II(10000×) NobleRyder R0928
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SYBR Green II(10000×) NobleRyder R0928
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SYBR Green II(10000×)
SYBR Green II RNA染料是一種高敏感的核酸染色試劑,,可以對(duì)RNA或者是單鏈的DNA進(jìn)行染色,。使用300nm透射光顯影的情況下,非變性凝膠中檢測(cè)核酸的靈敏度可以達(dá)到5×10-7克,。與傳統(tǒng)的EB染料相比SYBR Green II RNA染料的靈敏度更高,,可以應(yīng)用于雜交前RNA質(zhì)量的檢測(cè),同時(shí)不會(huì)影響后續(xù)的轉(zhuǎn)膜,,還可應(yīng)用于變形梯度凝膠電泳(DGGE)和單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(SSCP)等實(shí)驗(yàn),。SYBR Green II RNA染料可以代替銀染和EB染色,消除了銀染復(fù)雜,、費(fèi)時(shí)的缺點(diǎn),;與EB染色相比,形成的SRBR Green II -RNA復(fù)合物所激發(fā)的熒光是EB-RNA復(fù)合物激發(fā)熒光的7倍。SYBR Green II RNA染料并不是特異性的結(jié)合RNA或者DNA單鏈,,但是其對(duì)單鏈的結(jié)合效率是雙鏈的約2倍,,廣泛的應(yīng)用于RNA的質(zhì)量分析中。
染色方法:
SYBR Green II RNA 染料檢測(cè)核酸時(shí)即可預(yù)染也可以電泳后再進(jìn)行染色,。做預(yù)染使用時(shí),,取1ul貯存液加入1ml TE緩沖液或者滅菌雙蒸水中混勻,再加入1ml 的6-loading buffer上樣緩沖液混勻(此時(shí)溶液為1:2000稀釋,,即為工作液)電泳時(shí)取1-2ul工作液和5ul電泳樣品混勻后直接上樣,。注意:須將商品化的核酸MARKER作一定倍數(shù)的稀釋(1/5-1/10),這樣才能得到比較理想的結(jié)果,。
電泳后染色,。電泳后,在室溫,、避光的情況之下準(zhǔn)備染色液。染色液要在塑料器皿中制備而不要在玻璃器皿中,,因?yàn)椴AП韺訉?duì)該試劑有吸附作用,。
染料取出后室溫放置,恢復(fù)室溫后簡(jiǎn)單離心混勻,。
染色液使用1×TBE緩沖液進(jìn)行1:10,,000稀釋。如果是瓊脂糖甲醛變性膠,,用1×TBE做1:5,,000的稀釋。由于SYBR Green II RNA染色液靈敏度高,,所以要選用新鮮的1×TBE緩沖液進(jìn)行稀釋,,以免緩沖液中殘存的雜質(zhì)產(chǎn)生背景,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,。注意:為了提高染色的靈敏度,,要確定緩沖液的PH值在7.5和8之間,因?yàn)?/span>SYBR Green II RNA染色液對(duì)PH敏感,。
把膠放在塑料的染色容器中,,加入足夠染色液使之覆蓋整塊膠。用鋁箔遮蓋或者是放在暗處避光,。在染色之前沒(méi)有必要先將膠中的變性劑如尿素和甲醛洗出來(lái),,因?yàn)?/span>SYBR Green II RNA染色液復(fù)合物發(fā)出的熒光在甲醛或者尿素存在時(shí)不會(huì)猝滅。
在室溫下輕輕搖晃凝膠,。聚丙烯酰胺凝膠的*染色時(shí)間是10-40分鐘,,瓊脂糖凝膠的*染色時(shí)間是20-40分鐘。染色時(shí)間也可能隨著凝膠的厚度和濃度變化。由于其熒光本底很低,,凝膠染色后無(wú)需脫色,。染色工作放在2-8°C避光保存,可以重復(fù)使用3-4次,。注意:SYBR Green II RNA染色液不影響RNA向膜上的轉(zhuǎn)移和northern中的后續(xù)實(shí)驗(yàn),。
染色膠顯色和成像:SYBR Green II RNA染色液復(fù)合物所激發(fā)的熒光可以使用300nm和254nm光波照射,通過(guò)Wratten 15 濾光片檢測(cè),。注意:由于熒光本底較低,,所以可以通過(guò)適當(dāng)延長(zhǎng)曝光時(shí)間的方法檢測(cè)痕量的核酸。
請(qǐng)帶手套操作,。
貯存
SYBR Green II RNA染色液保存于DMSO溶液中,,此貯存液于保存溫度為-20°C,放置于避光干燥器中,,在以上條件下,,可在保存一年。稀釋工作液在2-8°C可以放置一周,,在室溫放置3-4天,。
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