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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)及其產(chǎn)物分析
最近更新時間:2016-5-18
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實驗?zāi)康模菏煜CR反應(yīng)的原理,;掌握PCR反應(yīng)的操作步驟以及PCR反應(yīng)參數(shù)的選擇與優(yōu)化,;掌握PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳檢測方法。
實驗原理:PCR擴增是模擬天然DNA復(fù)制過程,,利用dna聚合酶在體外(試管中)擴增一對引物之間特異性DNA片段的方法,。其主要熱循環(huán)過程可分為三個步驟:
(1)高溫變性(deNature):提供DNA復(fù)制的有效模板。
(2)低溫退火(anneal):引物與模板DNA復(fù)性,,提供游離3’-OH端供DNA復(fù)制起始,;
(3)中溫延伸(extend):依賴Mg2+,,DNA聚合酶催化合成與模板互補的新的DNA分子。
以上變性,、退火,、延伸三個過程組成一個循環(huán)周期;常循環(huán)25~40周期,,經(jīng)過n輪循環(huán)后,,靶DNA的拷貝數(shù)理論上呈2n增長;循環(huán)進行完畢,,通常zui后還在DNA聚合酶zui適溫度下延伸5~10分鐘,。
操作步驟:本次實驗程序如下:
(1)標(biāo)記一個潔凈的200uL反應(yīng)管,向其中依次加入:
ddH2O 36 uL
10×pcr反應(yīng)緩沖液 5uL
2mmol/L dNTPs 5uL
上游引物 1uL
下游引物 1uL
DNA模板 1uL
Taq DNA聚合酶 1 uL
總體積:50uL
混合均勻后,,蓋緊管蓋,,離心5S,使反應(yīng)成份均勻富集于管底,。
(2) 加石蠟油50~100μl于反應(yīng)液表面以防蒸發(fā)(此步驟根據(jù)PCR儀而定,,如帶高溫?zé)嵘wPCR儀不需加入)。
(3) 在PCR儀上設(shè)置反應(yīng)循環(huán)參數(shù),,本次實驗為:94℃ 30s,,56℃ 30s,,72℃ 30s,,循環(huán)數(shù)為30,zui后于72℃充分延伸10 min后終止反應(yīng)(16℃ 3 min),。
(4) 置反應(yīng)管于PCR儀上進行熱循環(huán),。
(5) 反應(yīng)完畢后,常取5~10%反應(yīng)產(chǎn)物(如本次5uL)進行瓊脂糖凝膠電泳,,通過溴乙錠染色,,在紫外燈下觀察擴增產(chǎn)物的質(zhì)量,正常DNA電泳帶應(yīng)清晰,、整齊,,并通過與已知分子量大小的DNA標(biāo)志物比較,初步了解產(chǎn)物大小是否與預(yù)期吻合,。
注意事項:
1. 戴手套操作,,避免污染
2.冰上操作