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士鋒生物PCR反應(yīng)五大要素
最近更新時間:2014-7-23
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參加pcr反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物,、酶,、dNTP、模板和Mg2+
引物:引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,,PCR 產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度,。理論上,,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設(shè)計互補(bǔ)的寡核苷酸鏈做引物,,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴(kuò)增,。
設(shè)計引物應(yīng)遵循以下原則:
①引物長度:15-30bp,常用為20bp左右,。
②引物擴(kuò)增跨度:以200-500bp為宜,,特定條件下可擴(kuò)增長至10kb的片段。
③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC隨機(jī)分布,,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列,。
④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),,特別是3'端的互補(bǔ),,否則會形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶,。
⑤引物3'端的堿基,,特別是zui末及倒數(shù)第二個堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,,以避免因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗,。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點(diǎn), 被擴(kuò)增的靶序列有適宜的酶切位點(diǎn),, 這對酶切分析或分子克隆很有好處,。
⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,,以zui低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴(kuò)增,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會,。