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士鋒生物電泳,、轉膜
點擊次數(shù):876 發(fā)布時間:2014-5-7
轉膜是把DNA從瓊脂糖凝膠中轉移到固相支持物(一般是尼龍膜)上固定,是進行各種后續(xù)研究(如RFLP分析,,陽性克隆的篩選驗證等所有涉及分子雜交的研究)的前提,。
實驗目的:掌握Southern Blotting的原理及操作步驟
實驗原理:
1. 轉膜的方式:
向上的毛細管轉移
向下的毛細管轉移
同時向兩張膜轉移
電轉移
真空轉移
2. 固相支持物的種類及選擇:
硝酸纖維素膜:非共價結合,易脆,,易丟失DNA,,< 500 bp的DNA無效,轉膜前的工作(從提高轉膜效率,,利于轉膜后使用等)
尼龍膜(帶正電荷的)高強度,,不易破損,,具有較大的DNA結合容量,它能夠吸附變性DNA,,核酸以共價結合方式不可逆的結合在尼龍膜上,。尼龍膜兩邊均有同樣吸附DNA功能,無論用哪邊均可以經久耐用,,可反復利用10次以上(10-20次),,經毛細管(毛細吸附)作用,把DNA從凝膠上轉到膜上,。DNA轉到膜上是復制膠上的帶型,,在80-100℃真空干燥2-4 hrs,即可固定DNA,。
3. 轉移緩沖液(transfer buffer)的選擇:
帶正電荷的尼龍膜:可用高鹽離子強度(SSC),,但不能充分發(fā)揮膜潛能;0.4N NaOH,,共價結合DNA是zui大優(yōu)點,。
硝酸纖維膜:高鹽離子強度促進DNA與膜結合(20×SSC),低鹽離子強度導致小片段DNA在轉移過程中丟失,,pH>9,,DNA不能與膜結合。
4.轉膜時間(duration of transfer)約12 hrs
效率高低,,但已無補救措施,,因此,每一步應嚴格操作,。
實驗材料及試劑:酶消化好的DNA樣品,,尼龍膜,0.2N HCl,,0.4N NaOH等
實驗步驟:
1. 0.8%瓊脂糖電泳
制膠:注意瓊脂糖的質量,膠的濃度,,厚度(<5mm)及均一性,。一般大電泳槽配制250ml 0.8%瓊脂糖凝膠,采用42孔梳子(經濟,,)
制樣,,點樣:DNA樣品中指示劑量稍多
電泳:一般1-1.5V/cm的電壓, 使DNA遷移到適當距離,,一般指示劑約移動10-11cm (大電泳槽:40V×12-15hrs,,小電泳槽30V×4-5 hrs)
2.轉膜前的準備:
依膠大小每塊凝膠準備兩張比膠稍大的濾紙(11×12.5 cm),兩張用作鹽橋的濾紙,,一張與膠同樣大小的尼龍膜(10×10.5cm),,兩個玻璃盤,、兩塊有機玻璃板、一根玻璃棒,,比尼龍膜稍大的一疊吸水紙等,。
3.一玻璃盤中加入足量的0.4N NaOH,放上洗凈的玻璃板,,按圖示搭制鹽橋(操作示范),。
4.凝膠的預處理:
a) 從電泳槽中移出凝膠置于塑料板上,用切膠板把膠切成適當大小,,切去右上角(zui后一個樣品的zui前端)作為電泳方向記號
b) 把凝膠翻面,,放入加有足量的0.2N HCl玻璃盤中,輕輕搖動10min,,使指示劑變黃色為止(脫嘌呤)
c) 倒去HCl溶液,,加蒸餾水漂洗凝膠
d) 倒去蒸餾水,加0.4N NaOH中和
e) 同時在鹽橋濾紙上灑些0.4 NaOH,,立即將膠放在鹽橋上(忌氣泡)
5.膠的四周用塑料片與膠緊緊相連,,防止短路(吸水紙與鹽橋相接)
6.在膠面上倒足夠量0.4N NaOH,小心放置膜(預濕0.4N NaOH)使膜覆蓋整塊膠(要求一次成功,,不能移動)
7.膜上放2張濾紙,,濾紙大小為15×12cm
8.放不少于5cm厚的吸水紙,放上玻板,,其上壓約500g的重物,,轉膜12 hrs左右
9.轉膜完畢,用2×SSC漂洗膜兩次,,各五分鐘,。用EB染膠以檢測轉移效果。
10.用兩張濾紙包住膜,,置于80-100℃的真空干燥箱中,,干燥2-4 hrs。