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如何選擇合適的蛋白含量測定方法,？
點擊次數(shù)：2484 發(fā)布時間：2013-1-27
對許多實驗來說，確定蛋白樣品濃度是至關重要的,。如果在2D電泳中,，蛋白過多或過少，產(chǎn)生的后果都將是相當嚴重的,。大多數(shù)蛋白樣品可通過比色測定法定量,。在典型的蛋白測定中，化學試劑加入到蛋白樣品溶液里產(chǎn)生顏色變化,，這一變化可由分光光度計或酶標儀檢測,，并與已知濃度的蛋白標準曲線作比較。Bio–Rad 提供了4種蛋白測定手段,，每種都有其*的優(yōu)點,。
Quick Start Bradford 蛋白測定是一種簡單、的蛋白濃度定量方法?，F(xiàn)成的1倍濃度染料和7 個預稀釋濃度（0.125,、0.25、0.5,、 0.75,、1.0、1.5,、2.0 mg/ml）的蛋白標準品,，讓你擁有現(xiàn)成的檢測工具。無需稀釋標準品和染料，一步完成蛋白濃度定量,。
Bio–Rad 蛋白測定也是一種簡單的蛋白濃度測定方法,。該方法適應標準濃度測定、低濃度微量測定,，或96孔微孔板的快速測定,。它的基本原理和流程和上面的Quick Start Bradford都是一樣的，不過要麻煩一點點,。因為除了要稀釋蛋白標準品,，配成幾個不同濃度之外，還要稀釋染料,，再過濾除去不溶顆粒,。后面的步驟就沒有區(qū)別了，還有一點小差別就是價格,。不過聯(lián)想一下奶粉和液體奶,，就會想通了吧。
Quick Start Bradford 和Bio–Rad 蛋白測定方法的起源都是Bradford染料結合方法 （Bradford 1976）,，該方法檢測考馬斯亮藍G–250染料與蛋白結合時（主要結合堿性或芳香族氨基酸殘基）的顏色變化,。這種測定方法能定量多數(shù)蛋白或多肽（分子量> 3,000–5,000 Da），操作簡單,、速度快,，靈敏度高，與一些還原劑（如DTT,、巰基乙醇）兼容,。但有些去垢劑、黃酮,、堿性緩沖液會干擾測定,。
DC （Detergent Compatible） 蛋白測定是一種適用于含有去垢劑的蛋白樣品比色測定方法。該方法類似于常規(guī)的Lowry 測定方法 （Lowry et al.1951）,，但經(jīng)過改良,，節(jié)省了操作時間。DC 蛋白測定只需要15分鐘的溫育過程,，而且吸光值讀數(shù)能保持2小時的穩(wěn)定,。它可以兼容NaOH和多種去污劑，如10% SDS,、2% NP-40,、1% CHAPS,、1% Triton X-100等,，但還原劑還是會干擾測定。
RC DC （Reducing agent Compatible & Detergent Compatible） 蛋白測定是一種適用于含還原劑和去垢劑的蛋白樣品比色測定方法。以 Lowry 方法（Lowry et al.1951）為基礎的 RC DC 蛋白測定,，具有原來DC蛋白測定的特點,，并能與更多的試劑兼容，簡化了復雜蛋白樣品溶液的定量測定,。吸光值至少穩(wěn)定1小時,。除了與DC 蛋白測定兼容的試劑外，RC DC 蛋白測定還與以下試劑和緩沖液兼容：2% CHAPS,、350 mM DTT,、0.1M EDTA、Laemmli 緩沖液,、10% beta-巰基乙醇,、ReadyPrep 抽提試劑等。
選擇合適的蛋白標準
大家可能從來沒有在意過蛋白標準,，認為不就是BSA嘛,。其實不然。在蛋白測定中,，的標準品是待測蛋白的純化制品,。當沒有這種的對照蛋白時，可以選擇另一種蛋白作為相對標準,。如果是用Bradford方法測定,，不同的標準品會導致同一樣品的結果差異較大，無可比性,。因此在蛋白測定之前,，是參照要測試的樣本的化學構成，尋找化學構成類似的標準蛋白作標準品,。如果只需要相對蛋白濃度,，那么任何一種純化蛋白均可作為對照標準品。
Bio–Rad 提供兩種蛋白標準品,，小牛gamma−球蛋白和牛血清白蛋白（BSA）標準品,。當你用Quick Start Bradford和Bio–Rad 蛋白測定試劑盒測定蛋白濃度時，那么標準品的選擇就要慎重一些,。如果你的樣品中主要含有白蛋白,，那么BSA將是一個好選擇。如果你的樣品包含了多種蛋白,，gamma-球蛋白可能更合適,。而DC和RC DC蛋白測定就幾乎不受到標準品的影響，你愛選哪個選哪個,。不過假如你想比較幾個蛋白的量時,，還是用同一種標準品,。
選擇合適的蛋白測定方法
正如一個硬幣的正反面，每種蛋白測定方法都有其優(yōu)缺點,。當你選擇一種蛋白測定方法時,，需要考慮兩個重要因素：緩沖液的化學組成和檢測的蛋白量?；?Bradford方法的Quick Start Bradford和Bio–Rad 蛋白測定靈敏度高,，可以兼容糖、巰基乙醇,、DTT等,。而對于去污劑和NaOH這兩種干擾Bradford測定的物質，DC蛋白測定卻可以兼容,。如果蛋白是在loading buffer中,，準備跑1D或2D電泳，或者剛從細胞裂解液中抽提出來,，需要定量,，那么RC DC蛋白測定更合適。下表總結了每一種蛋白測定方法的特點,。
比色皿
zui后還要提一下比色皿這個小東西,。一般定量核酸和紫外定量蛋白，都是采用石英杯或者玻璃杯,，但是不適合比色法測定蛋白質,。因為反應中的染料（如考馬斯亮藍）能讓石英和玻璃著色，所以必須采用一次性的塑料杯,。而塑料杯一般不適合用于在紫外范圍內測試樣品,。Bio-Rad也提供了一次性的比色皿。這些比色皿可直接用于樣品的混勻,，這樣你就省掉了轉移溶液的麻煩,。而且比色皿所需的樣品體積只是標準反應的一半左右，因此每個試劑盒的使用次數(shù)實際上變成了兩倍,。另外,，它的非光學面是凹槽設計，非常容易拿捏,，而且不容易搞錯,，在光學面上留下指紋或在分光光度計中放反了方向。
蛋白定量這個看似簡單的實驗中,，也蘊藏了不少學問,，所以還是要有一雙慧眼，來選擇的試劑盒