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技術(shù)文章

科學(xué)家揭示肝癌免疫微環(huán)境動態(tài)特征

點擊次數(shù):1019 發(fā)布時間:2019-12-27

 

 

肝細(xì)胞癌是世界范圍內(nèi)死亡率*三的癌癥,,其中中國的肝癌發(fā)病率居世界。HBV(乙肝病毒)的慢性感染是中國肝細(xì)胞癌發(fā)生的主要原因,,其感染導(dǎo)致腫瘤微環(huán)境常伴隨慢性炎癥,。免疫逃逸被認(rèn)為是癌癥發(fā)展的標(biāo)志之一,目前研究表明,,腫瘤存在多種免疫逃逸機制,。日前,中國學(xué)者指出研究腫瘤微環(huán)境中不同免疫細(xì)胞狀態(tài)的重要性,,而不同類型的單細(xì)胞測序技術(shù)則是研究不同類型免疫細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)的有力手段,。相關(guān)成果于11月1日發(fā)表于《細(xì)胞》雜志上。

此成果是北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC),、生命科學(xué)學(xué)院張澤民課題組聯(lián)合首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院彭吉潤課題組以及德國藥企勃林格殷格翰公司多位科學(xué)家聯(lián)合完成,。他們對肝癌患者多個組織的免疫細(xì)胞作出了系統(tǒng)性的刻畫,分析了免疫細(xì)胞動態(tài)遷移和狀態(tài)轉(zhuǎn)化的特征,,探索了它們在肝癌治療上的潛在價值,。

研究者結(jié)合通量相對較高的10x Genomics和基因捕獲率高的SMART-seq2測序技術(shù),從肝癌患者的肝癌組織,、癌旁正常組織,、肝淋巴結(jié)、血液和腹水五個組織器官中分離,、測序和分析了CD45+免疫細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,。通過整合兩組數(shù)據(jù)進行分析,研究者充分發(fā)揮了兩種數(shù)據(jù)的優(yōu)勢,,刻畫了高分辨率的肝癌免疫圖譜,。因此,聯(lián)合使用具有不同優(yōu)勢的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)進行細(xì)胞異質(zhì)性的研究或可成為相關(guān)研究的范式策略之一,。

隨后,,研究發(fā)現(xiàn),高表達LAMP3的樹突狀細(xì)胞無論在體內(nèi)還是體外都具有激活和成熟的特征,,可以從腫瘤遷移到周淋巴結(jié),,表達多種免疫配體基因,并具有與多種T淋巴細(xì)胞類型相互作用的潛力,。通過轉(zhuǎn)錄組相似性分析,,研究者發(fā)現(xiàn)腫瘤中巨噬細(xì)胞亞群表現(xiàn)出不同的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)和向腹水轉(zhuǎn)移的能力,。后,結(jié)合多種生物信息學(xué)分析方法,,研究者發(fā)現(xiàn)腹水中的髓系細(xì)胞和淋巴細(xì)胞分別主要來源于腫瘤和血液,,但腫瘤中的增殖性T細(xì)胞往往在腹水中積累。

該論文的共同通訊作者副研究員任仙文指出,,本項研究*對肝癌臨床樣本進行包括病理組織在內(nèi)的多組織位點的收集,,并利用前沿的生物信息學(xué)分析方法,通過自體對照,,不僅描述了肝癌微環(huán)境的免疫組分和狀態(tài),,而且描繪了腫瘤浸潤免疫細(xì)胞跨組織的動態(tài)過程。此項的開創(chuàng)性工作,,可為人們研究肝癌和其他疾病中的免疫細(xì)胞,,以及開發(fā)新的臨床檢測與治療方案提供新的思路

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