動物細(xì)胞染色體DNA之制備詳細(xì)的方法步驟!
閱讀:2233 發(fā)布時間:2012-10-18
動物細(xì)胞染色體DNA之制備
I.目的
動物,、植物及微生物等的基因圖譜(gene mapping)的構(gòu)筑,,以及基因順序(gene sequencing)的建立與分析比較,是目前分子生物研發(fā)的重要課題,。本實驗設(shè)計乃針對動物細(xì)胞培養(yǎng)之后,,抽取染色體DNA為*步,后續(xù)的DNA定序,、基因分析,、圖譜建立、DNA鑑定等于淵展開,。
以目前的估計,,人類約有10萬個基因,30億個堿基,。預(yù)定在2005年將人類基因*解析出來,,并確定它們在染色體上的位置。根據(jù)1990年當(dāng)時的物價,,每解析出一個堿基的平均成本約為美金1元,,故HGP總共需約30億美金來完成。
一旦人類基因輿圖*解析出來之后,,科學(xué)家就可以尋找每段基因的功能,,利用這些資料進(jìn)一步找出疾病(如ai癥或心臟?。┡c基因的關(guān)系,,另外亦提供開發(fā)新藥或?qū)ふ倚轮委煼椒ǖ念I(lǐng)域,如同在美國NASDAQ上的網(wǎng)路股一樣,,充滿了無限的想像空間,。在巨大商業(yè)利益的引誘之下,許多私人制藥公司已經(jīng)開始投入HGP的研究工作,,期能將重要的基因找出來
II.染色體DNA的制備
1.儀器用具:
a. 無菌操作臺
b. 37 ℃細(xì)胞培養(yǎng)箱
c. 倒立顯微鏡
d. 50 ℃恒溫箱具搖盪器
e. 冷凍離心機
2.藥品及試劑:
a. 同實驗20
b. Digestion buffer (100 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 25 mM EDTA, 0.5% SDS, fresh 0.1 mg/ml proteinase K)
c. phenol/chloroform
3.方法步驟:
1)培養(yǎng)HeLa細(xì)胞在100 mm培養(yǎng)皿中3~4天,,讓細(xì)胞佔滿生長平面空間(confluence < 3 ´ 107 cells ),加入10 ml PBS緩衝液清洗細(xì)胞表面,,再將PBS儘量*吸掉,。
2)加入1 ml Trypsin-EDTA(以能覆蓋細(xì)胞表面為原則),置入37 °C細(xì)胞培養(yǎng)箱數(shù)分鐘,,單層細(xì)胞全脫落,。
3)加入3 ml培養(yǎng)液沖洗下細(xì)胞,,在4 °C下以4,000 rpm離心1分鐘。
4)吸掉上層液,,加入5 ml PBS懸浮細(xì)胞,,在4 °C下以4,000 rpm離心1分鐘。
5)吸掉上層液,,加入30 ml digestion buffer懸浮細(xì)胞轉(zhuǎn)移到1.5 ml微量離心管中,,置于搖盪器上放入50 °C恒溫箱中過夜*。
6)取出微量離心管,,小心加入300 ml phenol 萃?。▍⒄諏嶒?)。
7)離心后轉(zhuǎn)移上清液至新的微量離心管,,加水成總體積為500 ml,,加入phenol/chloroform做萃取(參照實驗2),。
8)離心后,,做酒精沈淀DNA(參照實驗2)。
9)將染色體DNA懸浮于300 ml TE溶液中,,取少量作DNA定量分析(參照實驗2),。
10)取染色體DNA用EcoRI做限制酶切割,并做DNA電泳分析(參照實驗3),。
*注:1.在步驟5之后,,若DNA黏滯性太高,無法做萃取時,,建議在過夜反應(yīng)后,,以1ml針筒劇烈抽放染色體DNA,以抽放重覆動作,,可把DNA作物理性截斷(shearing),,或利用超音波破膜機來截斷DNA。
2.染色體DNA若有截斷處理,,到步驟10即可省略限制酶EcoRI的切割,,直接作電泳分析。
參考資料:
顯微鏡百科
http://www.jiance17.com