技術(shù)文章
探討PCR檢測試劑盒溫度循環(huán)參數(shù)
閱讀:316 發(fā)布時間:2023-2-20探討PCR檢測試劑盒溫度循環(huán)參數(shù):
1.變性溫度與時間
PCR反應(yīng)中模板DNA的變性十分重要,。只有wan全性的模板DNA和PCR產(chǎn)物雙鏈wan全解開,,才能有效的和引物結(jié)合,。這種結(jié)合是PCR擴(kuò)增的基礎(chǔ),。變性溫度越高,,時間越長變性就越充分。但溫度過高,、時間過長又會影響Taq DNA聚合酶的活性,,所以通常選用變性溫度為95℃30s為宜。在PCR反應(yīng)中第一個循環(huán)變性最重要,,需時間較長,,因模板DNA的鏈比較長。
2.復(fù)性溫度與時間
變性溫度是PCR反應(yīng)成敗的關(guān)鍵,,復(fù)性溫度決定著PCR的特異性,。溫度越低復(fù)性越好,但是容易出現(xiàn)引物與靶DNA的錯配,,增加非特異性結(jié)合,,溫度太高不利于復(fù)性,大多數(shù)PCR反應(yīng)的復(fù)性溫度在55℃左右,。確定了復(fù)性溫度后,,復(fù)性時間并不是關(guān)鍵因素。但復(fù)性時間太長會增加非特異的復(fù)性,。
3.延伸溫度與時間
引物延伸溫度一般為72℃,。這個溫度即考慮了Taq DNA聚合酶的活性,又考慮到引物和靶基因的結(jié)合,。不合適的延伸溫度不僅會影響擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性,,也會影響其產(chǎn)量,,72℃時,,核苷酸的合成速度為35-100個核苷酸/S,這取決于緩沖體系,、pH,、鹽濃度和DNA模板的性質(zhì)。72℃延伸1min對于長達(dá)2kb的擴(kuò)增片段是足夠的,。然而,,延伸時間過長會導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增帶的出現(xiàn)。對很低濃度底物的擴(kuò)增,,延伸時間要長些,。
4.循環(huán)數(shù):
循環(huán)數(shù)決定著擴(kuò)增的產(chǎn)量,。在其它參數(shù)都已優(yōu)化條件下,最適循環(huán)數(shù)取決于靶序列初始濃度,。靶序列的初始濃度較低時,、要增加循環(huán)次數(shù)。另外,,酶活性不好,,或量不足時也要增加循環(huán)次數(shù)、以便達(dá)到有效的擴(kuò)增量,。