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追蹤PCR實(shí)驗(yàn)中污染源
閱讀：158 發(fā)布時(shí)間：2023-2-10如果不慎發(fā)生污染情況,，應(yīng)從下面幾條出發(fā)，逐一分析,，排除污染,。
1.設(shè)立陰陽(yáng)性對(duì)照：有利于監(jiān)測(cè)反應(yīng)體系各成分的污染情況。選擇陽(yáng)性對(duì)照時(shí),，應(yīng)選擇擴(kuò)增弱,，且重復(fù)性好的樣品，因強(qiáng)陽(yáng)性對(duì)照可產(chǎn)生大量不必要的擴(kuò)增序列,，反而可能成為潛在的污染源,。如果以含靶序列的重組質(zhì)粒為對(duì)照，100個(gè)拷貝之內(nèi)的靶序列就足以產(chǎn)生陽(yáng)性擴(kuò)增,。陰性對(duì)照的選擇亦要慎重,，因?yàn)镻CR敏感性ji 高,，可以從其它方法（Sourthern 印跡或點(diǎn)雜交等）檢測(cè)陰性的標(biāo)本中檢測(cè)出極微量的靶分子。此外,，每次擴(kuò)增均應(yīng)包括PCR體系中各試劑的時(shí)機(jī)對(duì)照,，即包括PCR反應(yīng)所需的全部成分，而不加模板DNA,這對(duì)監(jiān)測(cè)試劑中PCR產(chǎn)物殘留污染是非常有益的,。如果擴(kuò)增結(jié)果中試劑對(duì)照為陽(yáng)性結(jié)果,，就是某一種或數(shù)種試劑被污染了。此時(shí),，要全部更換一批新的試劑進(jìn)行擴(kuò)增,，擴(kuò)增時(shí)設(shè)立不同的反應(yīng)管，每一管含有一種被檢測(cè)試劑,，在檢出污染試劑后，應(yīng)馬上處理,。
2.環(huán)境污染：在排除試劑污染的可能性外,，更換試劑后，若不久又發(fā)現(xiàn)試劑被污染了,，如果預(yù)防措施比較嚴(yán)密,，則考慮可能為環(huán)境污染。環(huán)境污染中常見(jiàn)的污染源主要有：
(1)模板提取時(shí)真空抽干裝置,。
(2)凝膠電泳加樣器,。
(3)電泳裝置。
(4)紫外分析儀,。
(5)切膠用刀或手術(shù)刀片,。
(6)離心機(jī)。
(7)冰箱門(mén)把手,，冷凍架,，門(mén)把手或?qū)嶒?yàn)臺(tái)面等。此時(shí)可用擦拭實(shí)驗(yàn)來(lái)查找可疑污染源：
(a)用無(wú)菌水浸泡過(guò)的滅菌棉簽擦拭可疑污染源,。(b)0.1ml去離子水浸泡,。(c)取5ml做PCR實(shí)驗(yàn)。(d)電泳檢測(cè)結(jié)果,。
(8)氣溶膠,。
如果經(jīng)過(guò)上述追蹤實(shí)驗(yàn)，仍不能查找到確切污染源,，則污染可能是由空氣中PCR產(chǎn)物的氣溶膠造成的,，此時(shí)就應(yīng)該更換實(shí)驗(yàn)場(chǎng)所，若條件不允許,，則重新設(shè)計(jì)新的引物（與原引物無(wú)相關(guān)性）,。