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PCR對(duì)照試驗(yàn)結(jié)果好卻沒回收到目的片段參考見解
閱讀:373 發(fā)布時(shí)間:2022-7-25PCR對(duì)照試驗(yàn)一般都會(huì)加陰性對(duì)照,陽性對(duì)照。如果你只想檢控PCR操作及擴(kuò)增,,就加水作為陰性對(duì)照,,陽性質(zhì)粒或者DNA作為陽性對(duì)照,。
如果你想監(jiān)控整個(gè)核酸提取過程,,及PCR過程的話,那就從核酸提取開始,,就將水作為陰性樣本做對(duì)照,,含模板DNA的菌或者病毒或者組織作為陽性對(duì)照。然而,,PCR對(duì)照試驗(yàn)結(jié)果好卻沒回收到目的片段參考見解:
1,、 連接用室溫保溫1小時(shí),能滿足大多數(shù)克隆,,為提高效率,,需4oC過夜。
2,、 插入片段帶有污染,,使3`-T缺失,或抑制連接,,抑制轉(zhuǎn)化,。為此,將插入片段和pGEM-T正對(duì)照混合,,再連接,。如降低了對(duì)照的菌落數(shù),插入片段需純化,,或重新制備,。如產(chǎn)生大量的藍(lán)斑,插入片段污染有核酸酶,,使pGEM-T或pGEM-T Easy載體3`-T缺失,。
3、插入片段不適于連接,。用凝膠純化的插入片段,,因受UV過度照射,時(shí)有發(fā)生,。UV過度照射會(huì)產(chǎn)生嘧啶二聚體,,不利于連接,DNA必需重新純化,。
4,、 帶有修復(fù)功能的耐熱DNA聚合酶的擴(kuò)增產(chǎn)物末端無A,,后者是pGEM-T或pGEM-T Easy載體克隆所需。加Taq DNA聚合酶和核苷酸可在末端加A,。詳情查pGEM-T pGEM-T Easy載體技術(shù)資料(TM042),。
5、高度重復(fù)序列可能會(huì)不穩(wěn)定,,在擴(kuò)增中產(chǎn)生缺失和重排,,如發(fā)現(xiàn)插入片段高頻率地產(chǎn)生缺失和重排,需用重組缺陷大腸桿菌菌株,,如SURE細(xì)胞