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根據(jù)培養(yǎng)基的用途來區(qū)分,，可分為選擇培養(yǎng)基,、增殖培養(yǎng)基、鑒別培養(yǎng)基等,。

  一,、選擇培養(yǎng)基在培養(yǎng)基中加入某種物質(zhì)以殺死或抑制不需要的菌種生長的培養(yǎng)基，稱之為選擇培養(yǎng)基,。如鏈霉素,、氯霉素等抑制原核微生物的生長；而制霉菌素,、灰黃霉素等能抑制真核微生物的生長,；結(jié)晶紫能抑制革蘭氏陽性細(xì)菌的生長等,。

  二、增殖培養(yǎng)基在自然界中,，不同種的微生物常生活在一起,，為了分離我們所需要的微生物，在普通培養(yǎng)基中加入一些某種微生物特別喜歡的營養(yǎng)物質(zhì),，以增加這種微生物的繁殖速度,，逐漸淘汰其它微生物，這種培養(yǎng)基稱為增殖培養(yǎng)基,，這種培養(yǎng)基常用于菌種篩選和選擇增菌中,。在某種程度上講，增殖培養(yǎng)基也是一種選擇培養(yǎng)基,。

  三,、鑒別培養(yǎng)基在培養(yǎng)基中加入某種試劑或化學(xué)藥品，使難以區(qū)分的微生物經(jīng)培養(yǎng)后呈現(xiàn)出明顯差別,，因而有助開快速鑒別某種微生物,。這樣的培養(yǎng)基稱之為鑒別培養(yǎng)基。例如用以檢查飲水和乳品中是否含有腸道致病菌的伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基就是一種常用的鑒別性培養(yǎng)基,。

  有些培養(yǎng)基是具有選擇和鑒別雙重作用,。例如食品檢驗中常用的麥康凱培養(yǎng)基是一例。它含有膽鹽,、乳糖和中性紅,。膽鹽具有抑制腸道菌以外的細(xì)菌的作用（選擇性），乳糖和中性紅（指示劑）能幫助區(qū)別乳糖發(fā)酵腸道菌（如大腸桿菌）和不能發(fā)酵乳糖的腸道致病菌（如沙門氏菌和志賀氏菌）,。

  另外,，根據(jù)培養(yǎng)基的營養(yǎng)成分是否“*"，可以分為基本培養(yǎng)基,、*培養(yǎng)基和補(bǔ)充培養(yǎng)基,，這類術(shù)語主要是用在微生物遺傳學(xué)中。根據(jù)培養(yǎng)基用于的目的來區(qū)分,，可以分為種子培養(yǎng)基和發(fā)酵培養(yǎng)基,。還有專門用于培養(yǎng)病毒等寄生微生物的活組織培養(yǎng)基，如雞胚等,；專門用于培養(yǎng)自養(yǎng)微生物的無機(jī)鹽培養(yǎng)基等,。